236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1879 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1879  transcriptional regulator-like  100 
 
 		 352 aa  682    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2316  DeoR family transcriptional regulator  52.48 
 
 		 331 aa  276  3e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000471902  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2434  hypothetical protein  49.21 
 
 		 361 aa  272  7e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1200  transcriptional regulator-like  52.4 
 
 		 315 aa  263  4e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.386828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5862  transcriptional regulator protein-like protein  50.79 
 
 		 318 aa  260  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2650  transcriptional regulator-like  49.69 
 
 		 323 aa  256  4e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.535773  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2367  hypothetical protein  49.53 
 
 		 330 aa  256  4e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1826  transcriptional regulator protein-like protein  53.65 
 
 		 313 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2249  putative transcriptional regulator protein  48.43 
 
 		 327 aa  248  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18560  predicted transcriptional regulator  47.42 
 
 		 361 aa  247  2e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.0049611  normal  0.0116825 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21980  predicted transcriptional regulator  49.84 
 
 		 327 aa  244  9.999999999999999e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.143715  normal  0.382871 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2610  transcriptional regulator-like  46.87 
 
 		 361 aa  243  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000080301  normal  0.16283 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1501  transcriptional regulator  46.95 
 
 		 683 aa  243  5e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.634725  decreased coverage  0.0000677289 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2249  hypothetical protein  50 
 
 		 330 aa  241  2e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00588148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13990  predicted transcriptional regulator  47.01 
 
 		 348 aa  234  1.0000000000000001e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0412748  normal  0.158003 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3444  hypothetical protein  44.89 
 
 		 335 aa  232  7.000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12131  hypothetical protein  42.99 
 
 		 332 aa  227  2e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000529286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2472  hypothetical protein  43.79 
 
 		 326 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2517  hypothetical protein  43.79 
 
 		 326 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2509  hypothetical protein  44.27 
 
 		 326 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.308334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3091  hypothetical protein  44.58 
 
 		 359 aa  225  9e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.727496  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2686  hypothetical protein  52.72 
 
 		 327 aa  224  1e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1783  transcriptional regulator protein-like protein  46.3 
 
 		 337 aa  219  3.9999999999999997e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  unclonable  0.000000000261192  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2057  transcriptional regulator-like protein  47.3 
 
 		 320 aa  218  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.090135  normal  0.188447 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4456  transcriptional regulator,-like protein  42.86 
 
 		 335 aa  209  8e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.427678  normal  0.167477 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1866  transcriptional regulator protein-like protein  43.48 
 
 		 354 aa  207  2e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00621522  normal  0.291628 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2959  transcriptional regulator protein-like protein  41.42 
 
 		 364 aa  204  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000346913  hitchhiker  0.00472926 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4872  hypothetical protein  45.62 
 
 		 401 aa  202  5e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1771  transcriptional regulator  45.54 
 
 		 675 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.193993  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2466  transcriptional regulator protein-like protein  40.24 
 
 		 331 aa  189  5e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0245457  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1287  putative transcriptional regulator protein  39.49 
 
 		 334 aa  182  8.000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.271739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2181  transcriptional regulator-like protein  40.85 
 
 		 663 aa  169  8e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117971  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1924  transcriptional regulator-like protein  41.21 
 
 		 663 aa  169  9e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000155311 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2167  hypothetical protein  39.38 
 
 		 325 aa  157  3e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.175858  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16040  predicted transcriptional regulator  40.29 
 
 		 664 aa  109  8.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5753  putative DeoR-family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 369 aa  85.5  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11950  predicted transcriptional regulator  32.82 
 
 		 699 aa  77.8  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.308253  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3867  Helix-turn-helix type 11 domain protein  30.55 
 
 		 335 aa  75.5  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5326  DeoR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  0.563326 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5785  transcriptional regulator protein-like protein  30.12 
 
 		 687 aa  73.6  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6203  DeoR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 318 aa  73.2  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4033  transcriptional regulator protein-like protein  31.85 
 
 		 511 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.559835  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3925  transcriptional regulator-like  33.2 
 
 		 345 aa  70.1  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.836948  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0988  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  29.6 
 
 		 317 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4065  transcriptional regulator protein-like protein  32.95 
 
 		 511 aa  69.7  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0672  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  32.88 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5106  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  31.7 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.505458  normal  0.201643 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0596  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  31.96 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0621  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  31.96 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.296179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4377  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  36.87 
 
 		 320 aa  66.6  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000417511 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0221  helix-turn-helix, type 11  31.96 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0705  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  31.96 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.179711  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2021  Helix-turn-helix type 11 domain protein  30.07 
 
 		 317 aa  65.9  0.0000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0370713  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3791  transcriptional regulator-like  30.94 
 
 		 228 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.55139  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4041  Helix-turn-helix type 11 domain protein  31.58 
 
 		 316 aa  65.5  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0920  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.96 
 
 		 327 aa  65.1  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.711136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3135  Helix-turn-helix type 11 domain protein  32.2 
 
 		 329 aa  65.1  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.224168  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4015  transcriptional regulator protein-like protein  28.72 
 
 		 512 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1247  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  29.5 
 
 		 317 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161645 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5754  hypothetical protein  27.76 
 
 		 351 aa  63.9  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4323  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  32.8 
 
 		 327 aa  63.9  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.807083  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2370  hypothetical protein  33.18 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3390  transcriptional regulator (repressor protein)  33.18 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4645  helix-turn-helix, type 11  33.67 
 
 		 333 aa  63.5  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0418126  normal  0.223314 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0284  hypothetical protein  33.18 
 
 		 361 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1146  hypothetical protein  33.18 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0387023  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2550  putative transcriptional regulator  33.18 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3348  hypothetical protein  33.18 
 
 		 339 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.822547  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0607  putative DeoR-family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 334 aa  63.2  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0615  putative DeoR-family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 334 aa  63.2  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3383  putative transcriptional regulator  33.18 
 
 		 367 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.296007  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0960  helix-turn-helix, type 11  28.62 
 
 		 317 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.386939  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0978  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  28.62 
 
 		 317 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.318116  normal  0.0703128 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0580  DeoR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 334 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1255  transcriptional regulator  27.46 
 
 		 322 aa  62  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2679  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  33.33 
 
 		 228 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0623  DeoR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 335 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1446  putative transcriptional regulator  28.03 
 
 		 332 aa  62  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00684408  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3142  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.06 
 
 		 232 aa  62  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0788  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  23.1 
 
 		 319 aa  61.6  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4172  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.87 
 
 		 317 aa  61.6  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.917159  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1262  hypothetical protein  32.88 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0382  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.12 
 
 		 333 aa  60.8  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.117118  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4104  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  32.43 
 
 		 316 aa  60.8  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2690  Helix-turn-helix type 11 domain protein  37.07 
 
 		 324 aa  60.5  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.113203 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0249  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  29.67 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0679  helix-turn-helix, type 11  32.97 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1758  hypothetical protein  27.7 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4095  DeoR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 333 aa  59.3  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3400  hypothetical protein  27.7 
 
 		 226 aa  58.9  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2098  Helix-turn-helix type 11 domain protein  31.23 
 
 		 318 aa  59.3  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2673  putative repressor transcription regulator protein  30.73 
 
 		 232 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.94129  normal  0.397505 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1808  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  26.55 
 
 		 327 aa  58.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.503322  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4059  helix-turn-helix, type 11  29.24 
 
 		 318 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.348793  normal  0.0202879 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1289  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.5 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.447111 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1191  hypothetical protein  30.14 
 
 		 235 aa  58.2  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.351784  normal  0.832163 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1067  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  36.61 
 
 		 320 aa  58.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1870  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  36.47 
 
 		 337 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.199317 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2755  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.8 
 
 		 336 aa  58.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2605  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  26.61 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>