More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0580 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_0580  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 		 334 aa  654    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0615  putative DeoR-family transcriptional regulator  93.11 
 
 		 334 aa  575  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0607  putative DeoR-family transcriptional regulator  92.51 
 
 		 334 aa  567  1e-161  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0623  DeoR family transcriptional regulator  81.19 
 
 		 335 aa  500  1e-140  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5753  putative DeoR-family transcriptional regulator  38.08 
 
 		 369 aa  167  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4015  transcriptional regulator protein-like protein  35.37 
 
 		 512 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4065  transcriptional regulator protein-like protein  36.01 
 
 		 511 aa  152  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4033  transcriptional regulator protein-like protein  35.85 
 
 		 511 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.559835  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3925  transcriptional regulator-like  35.03 
 
 		 345 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.836948  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5785  transcriptional regulator protein-like protein  29.78 
 
 		 687 aa  93.2  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2316  DeoR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 331 aa  87.8  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000471902  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0063  hypothetical protein  24.22 
 
 		 339 aa  85.9  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516278  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0815  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.8 
 
 		 312 aa  84  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.502142  hitchhiker  0.0000272273 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18560  predicted transcriptional regulator  32.74 
 
 		 361 aa  80.5  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.0049611  normal  0.0116825 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5862  transcriptional regulator protein-like protein  30.42 
 
 		 318 aa  79.7  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4104  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.49 
 
 		 316 aa  79.7  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0970  transcriptional regulator-like protein  26.49 
 
 		 330 aa  77.8  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1783  transcriptional regulator protein-like protein  31.15 
 
 		 337 aa  76.6  0.0000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  unclonable  0.000000000261192  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2959  transcriptional regulator protein-like protein  33.33 
 
 		 364 aa  75.9  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000346913  hitchhiker  0.00472926 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1826  transcriptional regulator protein-like protein  28.89 
 
 		 313 aa  76.3  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3086  transcriptional regulator, putative  28.51 
 
 		 334 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0788  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  23.93 
 
 		 319 aa  75.5  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2610  transcriptional regulator-like  27.12 
 
 		 361 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000080301  normal  0.16283 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1501  transcriptional regulator  31.84 
 
 		 683 aa  75.1  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.634725  decreased coverage  0.0000677289 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1001  hypothetical protein  23.23 
 
 		 313 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5754  hypothetical protein  30.34 
 
 		 351 aa  74.3  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1244  HTH domain family  22.9 
 
 		 313 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1185  hypothetical protein  22.64 
 
 		 313 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1644  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.53 
 
 		 347 aa  72.8  0.000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0304784  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1866  transcriptional regulator protein-like protein  29.8 
 
 		 354 aa  72.4  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00621522  normal  0.291628 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0624  transcriptional regulator-like protein  36 
 
 		 368 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1438  hypothetical protein  24.51 
 
 		 337 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1924  transcriptional regulator-like protein  29.52 
 
 		 663 aa  72.4  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000155311 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2755  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.08 
 
 		 336 aa  72  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0998  transcriptional regulator  22.9 
 
 		 313 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0147  helix-turn-helix, type 11  33.53 
 
 		 316 aa  71.2  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0494  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  30.81 
 
 		 336 aa  71.2  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1294  regulatory protein, DeoR  27.63 
 
 		 336 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1879  transcriptional regulator-like  33.18 
 
 		 352 aa  70.1  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13990  predicted transcriptional regulator  32.39 
 
 		 348 aa  70.1  0.00000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0412748  normal  0.158003 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0944  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  24.34 
 
 		 330 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.001663  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2689  hypothetical protein  35.87 
 
 		 320 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0201589  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0437  hypothetical protein  23.37 
 
 		 326 aa  69.7  0.00000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2021  Helix-turn-helix type 11 domain protein  40.66 
 
 		 317 aa  68.6  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0370713  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0554  TonB-dependent receptor  29.46 
 
 		 234 aa  69.3  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.665291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2934  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  31.58 
 
 		 230 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334283 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3091  hypothetical protein  30.53 
 
 		 359 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.727496  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1946  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.74 
 
 		 321 aa  68.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4546  DeoR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 314 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.86893  normal  0.117628 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15260  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.08 
 
 		 327 aa  68.2  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190404  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2626  helix-turn-helix, type 11  32.02 
 
 		 230 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.182787  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1200  transcriptional regulator-like  33.64 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.386828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2670  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  32.02 
 
 		 230 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.750457  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0473  transcriptional regulator, putative  27.4 
 
 		 334 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2609  hypothetical protein  35.06 
 
 		 325 aa  67.8  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000144716  normal  0.0873123 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2821  hypothetical DNA-binding protein  22.67 
 
 		 314 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.184297  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3521  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  31.87 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3859  hypothetical protein  30.92 
 
 		 323 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1823  Helix-turn-helix type 11 domain protein  31.18 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406304  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1734  transcriptional regulator, putative  27.48 
 
 		 233 aa  65.9  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.781604  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1676  putative transcriptional regulator  27.48 
 
 		 233 aa  65.5  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0499  hypothetical protein  30.05 
 
 		 229 aa  65.1  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.477682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0108  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.34 
 
 		 240 aa  65.1  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403778 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1363  YobV  25.41 
 
 		 311 aa  65.5  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.396054  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3444  hypothetical protein  29.15 
 
 		 335 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4846  transcriptional regulator protein-like protein  31.85 
 
 		 326 aa  65.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.715011 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2401  hypothetical protein  33.33 
 
 		 320 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148102  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1300  transcriptional regulator  24.63 
 
 		 323 aa  65.1  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.909513  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0382  Helix-turn-helix type 11 domain protein  31.58 
 
 		 333 aa  63.9  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.117118  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2650  transcriptional regulator-like  29.44 
 
 		 323 aa  64.3  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.535773  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3646  Helix-turn-helix type 11 domain protein  21.98 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000392325  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1180  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.48 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000786  predicted transcriptional regulator  25.51 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0574064  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2673  hypothetical protein  34.41 
 
 		 320 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000327581 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2474  hypothetical protein  32.61 
 
 		 320 aa  63.5  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0188594  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2656  hypothetical protein  32.61 
 
 		 320 aa  63.5  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0359  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.13 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3412  Helix-turn-helix type 11 domain protein  31.52 
 
 		 324 aa  63.2  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45460  hypothetical protein  29.84 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1731  DeoR family transcriptional regulator  23.19 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.590959  normal  0.873384 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2010  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  25.68 
 
 		 320 aa  62.4  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0680  DeoR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 231 aa  62  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4305  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.14 
 
 		 233 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1092  Helix-turn-helix type 11 domain protein  21.36 
 
 		 315 aa  62  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.206539  normal  0.830453 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2181  transcriptional regulator-like protein  30.58 
 
 		 663 aa  62  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117971  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2154  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.09 
 
 		 324 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1289  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.49 
 
 		 315 aa  62.4  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.447111 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0713  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  35.65 
 
 		 319 aa  62.4  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.677583  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6729  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.46 
 
 		 324 aa  61.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.41486 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1219  transcriptional regulator  27.62 
 
 		 336 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1880  hypothetical protein  36.17 
 
 		 344 aa  61.6  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2996  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  31.53 
 
 		 226 aa  61.6  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2434  hypothetical protein  28.44 
 
 		 361 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1799  helix-turn-helix, type 11  27.27 
 
 		 229 aa  60.8  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.000591723  normal  0.0198726 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2437  hypothetical protein  28.82 
 
 		 323 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1771  transcriptional regulator  41.46 
 
 		 675 aa  60.5  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.193993  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2166  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.49 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.304825  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2466  transcriptional regulator protein-like protein  31.42 
 
 		 331 aa  60.1  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0245457  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1515  hypothetical protein  24.54 
 
 		 349 aa  59.7  0.00000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.284607  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2057  transcriptional regulator-like protein  31.7 
 
 		 320 aa  60.1  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.090135  normal  0.188447 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>