More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCB4264_A5238 on replicon NC_011725
Organism: Bacillus cereus B4264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A5238  transcriptional regulator  100 
 
 
304 aa  625  1e-178  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0664508  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2874  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  31.12 
 
 
322 aa  153  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1363  YobV  31.99 
 
 
311 aa  149  5e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.396054  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2042  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  30.74 
 
 
307 aa  145  8.000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.395632  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0991  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.69 
 
 
302 aa  142  5e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0660  transcriptional regulator, putative  28.48 
 
 
301 aa  133  3e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0764  Helix-turn-helix type 11 domain protein  30.66 
 
 
298 aa  133  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000424784  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1647  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  28.12 
 
 
299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0891  transcriptional regulator, putative  28.21 
 
 
306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2367  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.56 
 
 
313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.440872  normal  0.310405 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3428  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  28.47 
 
 
303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3646  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.84 
 
 
309 aa  127  3e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000392325  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2492  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.01 
 
 
302 aa  127  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156303  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6729  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.44 
 
 
324 aa  122  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.41486 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2296  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.47 
 
 
322 aa  119  9e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000342768  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3694  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.65 
 
 
321 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0509362  hitchhiker  0.00000175857 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0680  DeoR family transcriptional regulator  31.94 
 
 
231 aa  109  6e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1078  transcriptional regulator  49.18 
 
 
132 aa  108  1e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0312133  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0788  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  30.45 
 
 
319 aa  107  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4104  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  24.7 
 
 
316 aa  105  7e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2944  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.08 
 
 
324 aa  105  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1092  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.69 
 
 
315 aa  98.2  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.206539  normal  0.830453 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1289  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.35 
 
 
315 aa  97.8  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.447111 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3846  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.68 
 
 
230 aa  97.1  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.80209  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0359  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.03 
 
 
318 aa  96.7  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0064  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  25.44 
 
 
328 aa  95.1  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.188997  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6686  hypothetical protein  26.2 
 
 
327 aa  95.1  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0918823  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0941  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  31.14 
 
 
230 aa  94.7  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.958625  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0335  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  23.22 
 
 
321 aa  94  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.377994  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3763  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.54 
 
 
323 aa  93.6  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3062  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.43 
 
 
313 aa  92.4  9e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal  0.752018 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2166  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.34 
 
 
320 aa  91.7  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.304825  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2010  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  23.65 
 
 
320 aa  91.7  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1644  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.62 
 
 
347 aa  90.1  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0304784  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0960  helix-turn-helix, type 11  26.55 
 
 
317 aa  89  8e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.386939  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0978  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  26.55 
 
 
317 aa  89  8e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.318116  normal  0.0703128 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1867  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.02 
 
 
232 aa  89  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.117205 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3039  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.35 
 
 
235 aa  88.2  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.545561  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0988  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  25.19 
 
 
317 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4054  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.67 
 
 
324 aa  86.7  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.135242  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1731  DeoR family transcriptional regulator  27.75 
 
 
230 aa  85.9  7e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.590959  normal  0.873384 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2689  hypothetical protein  24.46 
 
 
320 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0201589  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2755  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.89 
 
 
336 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2821  hypothetical DNA-binding protein  27.83 
 
 
314 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.184297  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1946  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  24.52 
 
 
321 aa  83.6  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1751  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  25.76 
 
 
325 aa  83.6  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.33135  normal  0.990555 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2437  hypothetical protein  25.08 
 
 
323 aa  83.2  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2401  hypothetical protein  22.8 
 
 
320 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148102  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5404  DeoR family transcriptional regulator  28.22 
 
 
332 aa  83.2  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924628  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2683  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.03 
 
 
324 aa  82.8  0.000000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.255194  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0838  hypothetical protein  29.17 
 
 
229 aa  82.4  0.000000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.183627 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3029  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  23.48 
 
 
327 aa  82.4  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189154  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7481  transcriptional regulator-like  25.6 
 
 
326 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5326  DeoR family transcriptional regulator  22.67 
 
 
318 aa  80.5  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  0.563326 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1185  hypothetical protein  25.15 
 
 
313 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2474  hypothetical protein  22.32 
 
 
320 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0188594  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2673  hypothetical protein  21.65 
 
 
320 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000327581 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2656  hypothetical protein  22.32 
 
 
320 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3752  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  22.7 
 
 
327 aa  79.7  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0372442  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3400  hypothetical protein  30.57 
 
 
226 aa  79.3  0.00000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0875  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.15 
 
 
328 aa  79.3  0.00000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0325  Helix-turn-helix type 11 domain protein  21.02 
 
 
335 aa  78.6  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00275048  normal  0.0249624 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3647  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.05 
 
 
320 aa  77.4  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.306366  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2021  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.91 
 
 
317 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0370713  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5244  DeoR family transcriptional regulator  23.61 
 
 
337 aa  77  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.288323 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5106  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  24.89 
 
 
319 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.505458  normal  0.201643 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2507  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.71 
 
 
321 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3107  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.64 
 
 
324 aa  76.6  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.786544  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0450  HTH domain-containing protein  22.77 
 
 
230 aa  76.3  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2626  helix-turn-helix, type 11  27.48 
 
 
230 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.182787  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0456  helix-turn-helix, type 11  22.77 
 
 
230 aa  76.3  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2670  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  27.48 
 
 
230 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.750457  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0510  helix-turn-helix, type 11  22.77 
 
 
230 aa  76.3  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1294  regulatory protein, DeoR  26.05 
 
 
336 aa  75.9  0.0000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2996  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  26.73 
 
 
226 aa  75.9  0.0000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4135  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  25.65 
 
 
332 aa  75.9  0.0000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.124521  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4540  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.33 
 
 
228 aa  75.9  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3402  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  25.08 
 
 
323 aa  75.5  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0120343  normal  0.0687104 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0559  transcriptional regulator  25.99 
 
 
317 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3494  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.42 
 
 
344 aa  75.5  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0562  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  24.4 
 
 
317 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.349747  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7257  helix-turn-helix type 11 domain protein  23.74 
 
 
326 aa  75.1  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.143006 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2064  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.47 
 
 
337 aa  74.3  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.177932  normal  0.600491 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1247  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  23.11 
 
 
317 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.161645 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3135  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25 
 
 
329 aa  74.7  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.224168  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15260  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.85 
 
 
327 aa  74.3  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190404  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0713  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  24.04 
 
 
319 aa  73.9  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.677583  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4654  hypothetical protein  25 
 
 
317 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000770885  unclonable  9.19298e-26 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3934  Helix-turn-helix type 11 domain protein  21.95 
 
 
321 aa  73.9  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0769202  hitchhiker  0.00173443 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0766  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.62 
 
 
303 aa  73.9  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2605  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  25.74 
 
 
232 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2609  hypothetical protein  21.88 
 
 
325 aa  73.6  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000144716  normal  0.0873123 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2538  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  25.74 
 
 
232 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2704  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  25.74 
 
 
232 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.981557  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0094  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.49 
 
 
325 aa  73.6  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0247  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  23.14 
 
 
227 aa  73.6  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3859  hypothetical protein  24.87 
 
 
323 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0044  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.02 
 
 
318 aa  72.8  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.164988  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0063  hypothetical protein  24.83 
 
 
339 aa  72.8  0.000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516278  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1001  hypothetical protein  25.69 
 
 
313 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>