More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2296 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_2296  Helix-turn-helix type 11 domain protein  100 
 
 
322 aa  625  1e-178  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000342768  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1363  YobV  30.06 
 
 
311 aa  137  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.396054  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3646  Helix-turn-helix type 11 domain protein  33.53 
 
 
309 aa  125  7e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000392325  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0891  transcriptional regulator, putative  33.13 
 
 
306 aa  124  2e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2492  Helix-turn-helix type 11 domain protein  30.48 
 
 
302 aa  123  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156303  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0991  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  29.67 
 
 
302 aa  122  6e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6686  hypothetical protein  26.43 
 
 
327 aa  119  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0918823  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3428  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  28.66 
 
 
303 aa  119  6e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5238  transcriptional regulator  25.47 
 
 
304 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0664508  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0660  transcriptional regulator, putative  28.8 
 
 
301 aa  114  3e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1647  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  30 
 
 
299 aa  112  6e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2944  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.57 
 
 
324 aa  108  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2507  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.85 
 
 
321 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1185  hypothetical protein  29.09 
 
 
313 aa  105  9e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0764  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.94 
 
 
298 aa  104  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000424784  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0998  transcriptional regulator  28.18 
 
 
313 aa  98.6  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1001  hypothetical protein  27.36 
 
 
313 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3694  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.38 
 
 
321 aa  97.1  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0509362  hitchhiker  0.00000175857 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1244  HTH domain family  26.75 
 
 
313 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4104  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  25.23 
 
 
316 aa  94.7  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2166  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.92 
 
 
320 aa  94.4  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.304825  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4054  Helix-turn-helix type 11 domain protein  20.68 
 
 
324 aa  94.4  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.135242  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15260  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.98 
 
 
327 aa  92  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190404  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0335  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  22.12 
 
 
321 aa  90.9  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.377994  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1867  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.93 
 
 
232 aa  90.1  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.117205 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3039  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.73 
 
 
235 aa  89.7  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.545561  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3934  Helix-turn-helix type 11 domain protein  21.71 
 
 
321 aa  89.4  7e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0769202  hitchhiker  0.00173443 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5398  helix-turn-helix type 11 domain protein  21.45 
 
 
327 aa  89.4  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.229533  normal  0.331781 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0875  Helix-turn-helix type 11 domain protein  20.68 
 
 
328 aa  89  9e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2042  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  25.55 
 
 
307 aa  88.6  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.395632  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0788  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  27.76 
 
 
319 aa  88.6  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1092  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.46 
 
 
315 aa  89  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.206539  normal  0.830453 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3763  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  22.32 
 
 
323 aa  89  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3647  Helix-turn-helix type 11 domain protein  20.65 
 
 
320 aa  88.2  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.306366  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3846  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.91 
 
 
230 aa  88.2  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.80209  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2797  putative transcriptional regulator  24.88 
 
 
229 aa  87.4  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2874  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  22.19 
 
 
322 aa  87.4  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1644  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.82 
 
 
347 aa  86.3  6e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0304784  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1180  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.44 
 
 
233 aa  86.3  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1946  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  22.82 
 
 
321 aa  85.9  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0147  helix-turn-helix, type 11  26.46 
 
 
316 aa  85.9  9e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0815  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.86 
 
 
312 aa  85.5  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.502142  hitchhiker  0.0000272273 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7481  transcriptional regulator-like  21.74 
 
 
326 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0941  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  28.97 
 
 
230 aa  85.1  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.958625  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0064  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  24.17 
 
 
328 aa  85.1  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.188997  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1294  regulatory protein, DeoR  23.28 
 
 
336 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2683  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.68 
 
 
324 aa  85.1  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.255194  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4135  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  20.61 
 
 
332 aa  84.7  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.124521  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0247  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  24.77 
 
 
227 aa  85.1  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3904  Helix-turn-helix type 11 domain protein  21.81 
 
 
260 aa  84.3  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3859  hypothetical protein  23.87 
 
 
323 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0190  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25 
 
 
242 aa  84.3  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0679  helix-turn-helix, type 11  25.66 
 
 
237 aa  84  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0104  hypothetical protein  28.5 
 
 
230 aa  83.2  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3432  helix-turn-helix, type 11  25.12 
 
 
234 aa  83.2  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.587974  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1751  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  24.17 
 
 
325 aa  83.2  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.33135  normal  0.990555 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1962  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  20.78 
 
 
330 aa  83.2  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000800393  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1676  putative transcriptional regulator  25.48 
 
 
233 aa  82.8  0.000000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1734  transcriptional regulator, putative  25.48 
 
 
233 aa  82.8  0.000000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.781604  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0838  hypothetical protein  29.72 
 
 
229 aa  82  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.183627 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0713  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  22.97 
 
 
319 aa  81.3  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.677583  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0450  HTH domain-containing protein  26.34 
 
 
230 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2368  helix-turn-helix, type 11  27.91 
 
 
231 aa  81.3  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.150063 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45460  hypothetical protein  22.77 
 
 
323 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0510  helix-turn-helix, type 11  26.34 
 
 
230 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3062  Helix-turn-helix type 11 domain protein  18.71 
 
 
313 aa  81.3  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal  0.752018 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0456  helix-turn-helix, type 11  26.34 
 
 
230 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3029  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  21.52 
 
 
327 aa  80.5  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189154  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1289  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.55 
 
 
315 aa  80.5  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.447111 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35620  predicted transcriptional regulator  23.45 
 
 
241 aa  80.5  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5791  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  22.11 
 
 
339 aa  80.1  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0172  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  24.41 
 
 
242 aa  80.1  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.657073  normal  0.98017 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2755  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.96 
 
 
336 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0672  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  25.45 
 
 
228 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664641  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4546  DeoR family transcriptional regulator  23.73 
 
 
314 aa  78.6  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.86893  normal  0.117628 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0221  helix-turn-helix, type 11  25 
 
 
228 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3553  helix-turn-helix, type 11  27.8 
 
 
238 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0705  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  25 
 
 
228 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.179711  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2822  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.88 
 
 
235 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.424495  normal  0.108616 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2909  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.31 
 
 
232 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36430  predicted transcriptional regulator  20.63 
 
 
323 aa  78.2  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.649805 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3791  transcriptional regulator-like  25 
 
 
228 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.55139  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7049  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  25.33 
 
 
233 aa  77  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.135487  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2437  hypothetical protein  24.62 
 
 
323 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3821  hypothetical protein  26.76 
 
 
232 aa  77  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2996  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  25.35 
 
 
226 aa  77  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2821  hypothetical DNA-binding protein  25.69 
 
 
314 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.184297  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2992  helix-turn-helix, type 11  23.22 
 
 
252 aa  76.6  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2627  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.23 
 
 
242 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3403  transcriptional regulator-like protein  24.3 
 
 
323 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0101274  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2010  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  22.12 
 
 
320 aa  76.6  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0325  Helix-turn-helix type 11 domain protein  20.93 
 
 
335 aa  76.6  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00275048  normal  0.0249624 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2503  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.31 
 
 
232 aa  76.3  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.751243 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1731  DeoR family transcriptional regulator  27.4 
 
 
230 aa  76.3  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.590959  normal  0.873384 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2021  Helix-turn-helix type 11 domain protein  21.91 
 
 
317 aa  76.3  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0370713  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5970  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  24.89 
 
 
241 aa  76.3  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.392838 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3146  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.36 
 
 
351 aa  75.9  0.0000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0559  transcriptional regulator  25.15 
 
 
317 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0108  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  25.46 
 
 
240 aa  75.5  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.403778 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1799  helix-turn-helix, type 11  26.17 
 
 
229 aa  75.1  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.000591723  normal  0.0198726 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>