More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_0562 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_0562  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  100 
 
 		 317 aa  655    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.349747  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0559  transcriptional regulator  95.58 
 
 		 317 aa  633  1e-180  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0615  hypothetical protein  94.64 
 
 		 317 aa  628  1e-179  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.759398  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0648  hypothetical protein  94.64 
 
 		 317 aa  628  1e-179  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0266881  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0777  hypothetical protein  94.95 
 
 		 317 aa  627  1e-179  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.845326  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0684  hypothetical protein  94.32 
 
 		 317 aa  624  1e-178  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0732899  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0705  hypothetical protein  93.69 
 
 		 317 aa  623  1e-177  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0716  hypothetical protein  93.06 
 
 		 348 aa  615  1e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.129876  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0560  transcriptional regulator  92.43 
 
 		 317 aa  615  1e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00184479  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4654  hypothetical protein  92.43 
 
 		 317 aa  616  1e-175  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000770885  unclonable  9.19298e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2821  hypothetical DNA-binding protein  32.81 
 
 		 314 aa  203  4e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.184297  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0976  transcriptional regulator  26.71 
 
 		 310 aa  127  3e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3281  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.96 
 
 		 316 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.093323  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1613  transcriptional regulator, DeoR family  27.96 
 
 		 314 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0282022  hitchhiker  0.0000000647581 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3613  transcription regulator-like protein  31.19 
 
 		 280 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0101765  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2944  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.74 
 
 		 324 aa  116  6e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1185  hypothetical protein  27.95 
 
 		 313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4104  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  22.19 
 
 		 316 aa  107  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0064  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.6 
 
 		 328 aa  106  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.188997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1289  Helix-turn-helix type 11 domain protein  30.84 
 
 		 315 aa  102  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.447111 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1244  HTH domain family  27.02 
 
 		 313 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1946  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.21 
 
 		 321 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0998  transcriptional regulator  26.71 
 
 		 313 aa  100  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1001  hypothetical protein  26.4 
 
 		 313 aa  99.4  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2755  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.85 
 
 		 336 aa  99  9e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0788  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  32.37 
 
 		 319 aa  98.6  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6686  hypothetical protein  26.38 
 
 		 327 aa  98.2  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0918823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1092  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.72 
 
 		 315 aa  96.7  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.206539  normal  0.830453 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3694  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.93 
 
 		 321 aa  96.7  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0509362  hitchhiker  0.00000175857 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2857  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.09 
 
 		 326 aa  95.9  9e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0404483  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2021  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.27 
 
 		 317 aa  95.5  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0370713  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5404  DeoR family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 332 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3647  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.47 
 
 		 320 aa  93.6  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.306366  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0660  transcriptional regulator, putative  27.1 
 
 		 301 aa  93.2  5e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3237  DeoR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 219 aa  93.2  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3763  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  31.72 
 
 		 323 aa  92.8  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2064  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.4 
 
 		 337 aa  93.2  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.177932  normal  0.600491 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2507  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.8 
 
 		 321 aa  92.8  7e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3147  DeoR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 320 aa  92  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4059  helix-turn-helix, type 11  27.01 
 
 		 318 aa  91.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.348793  normal  0.0202879 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0312  putative transcriptional regulator  31.89 
 
 		 388 aa  91.7  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1751  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.73 
 
 		 325 aa  91.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.33135  normal  0.990555 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1067  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  28.57 
 
 		 320 aa  91.3  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4135  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  23.01 
 
 		 332 aa  91.3  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.124521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3466  transcriptional regulator, DeoR family  26.42 
 
 		 320 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00154683  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3867  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.26 
 
 		 335 aa  90.5  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0284  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.32 
 
 		 332 aa  89.7  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.527195 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2379  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.09 
 
 		 230 aa  90.1  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2336  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  27.09 
 
 		 230 aa  90.1  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0387558  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0977  DeoR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 360 aa  90.1  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.226699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45460  hypothetical protein  23.1 
 
 		 323 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4377  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.89 
 
 		 320 aa  89.4  7e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000417511 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1867  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.58 
 
 		 232 aa  89.4  7e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.117205 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3451  transcriptional regulator, DeoR family  26.42 
 
 		 320 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3210  DeoR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 320 aa  89.4  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0553478  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0941  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  30.53 
 
 		 230 aa  88.6  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.958625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3145  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  23.85 
 
 		 320 aa  88.6  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.546002  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6203  DeoR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 318 aa  88.6  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1809  transcriptional regulator, DeoR family  26.48 
 
 		 320 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2098  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.56 
 
 		 318 aa  87.8  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7481  transcriptional regulator-like  28.1 
 
 		 326 aa  87.4  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3039  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.99 
 
 		 235 aa  87.4  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.545561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0680  DeoR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 231 aa  87.4  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3437  transcriptional regulator, DeoR family  26.94 
 
 		 320 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1870  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  22.62 
 
 		 337 aa  86.7  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.199317 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4172  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.84 
 
 		 317 aa  86.3  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.917159  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6729  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.01 
 
 		 324 aa  86.3  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.41486 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5212  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.73 
 
 		 317 aa  86.3  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000701081  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0249  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.81 
 
 		 324 aa  85.5  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0359  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.98 
 
 		 318 aa  85.5  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3934  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.77 
 
 		 321 aa  85.5  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0769202  hitchhiker  0.00173443 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7049  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  30.14 
 
 		 233 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.135487  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4041  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.65 
 
 		 316 aa  85.1  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3444  DeoR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 318 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00725446  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3062  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.27 
 
 		 313 aa  84.3  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal  0.752018 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4095  DeoR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 333 aa  84.3  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2689  hypothetical protein  29.69 
 
 		 320 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0201589  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0920  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.41 
 
 		 327 aa  83.6  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.711136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3107  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.66 
 
 		 324 aa  83.6  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.786544  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1789  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.32 
 
 		 333 aa  83.2  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0003326  normal  0.195591 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5244  DeoR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 337 aa  82.8  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.288323 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0838  hypothetical protein  28.44 
 
 		 229 aa  82.4  0.000000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.183627 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0679  helix-turn-helix, type 11  28.37 
 
 		 237 aa  82.8  0.000000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000786  predicted transcriptional regulator  25.94 
 
 		 228 aa  82.4  0.000000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0574064  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0510  helix-turn-helix, type 11  25 
 
 		 230 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0456  helix-turn-helix, type 11  25 
 
 		 230 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0450  HTH domain-containing protein  25 
 
 		 230 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36430  predicted transcriptional regulator  24.44 
 
 		 323 aa  81.3  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.649805 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0147  helix-turn-helix, type 11  23.15 
 
 		 316 aa  81.6  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3029  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  22.54 
 
 		 327 aa  81.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8641  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.27 
 
 		 320 aa  81.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0108  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  28.5 
 
 		 240 aa  81.6  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403778 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3412  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.6 
 
 		 324 aa  81.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0713  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.73 
 
 		 319 aa  81.3  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.677583  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0094  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.36 
 
 		 325 aa  80.5  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2673  hypothetical protein  30.05 
 
 		 320 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000327581 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2401  hypothetical protein  29.58 
 
 		 320 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148102  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2656  hypothetical protein  29.58 
 
 		 320 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0325  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.4 
 
 		 335 aa  80.5  0.00000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00275048  normal  0.0249624 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5106  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  21.59 
 
 		 319 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.505458  normal  0.201643 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>