227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_3613 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_3613  transcription regulator-like protein  100 
 
 		 280 aa  568  1e-161  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0101765  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3281  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  91.79 
 
 		 316 aa  527  1e-149  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.093323  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1613  transcriptional regulator, DeoR family  92.5 
 
 		 314 aa  526  1e-148  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0282022  hitchhiker  0.0000000647581 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0976  transcriptional regulator  27.7 
 
 		 310 aa  121  9.999999999999999e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0562  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  31.19 
 
 		 317 aa  117  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.349747  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0559  transcriptional regulator  30.73 
 
 		 317 aa  116  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0684  hypothetical protein  30.32 
 
 		 317 aa  116  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0732899  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0716  hypothetical protein  30.77 
 
 		 348 aa  115  6e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.129876  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0777  hypothetical protein  30.32 
 
 		 317 aa  115  6e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.845326  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0705  hypothetical protein  30.32 
 
 		 317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0615  hypothetical protein  30.32 
 
 		 317 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.759398  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0648  hypothetical protein  30.32 
 
 		 317 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0266881  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0560  transcriptional regulator  29.9 
 
 		 317 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00184479  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4654  hypothetical protein  30.28 
 
 		 317 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000770885  unclonable  9.19298e-26 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3147  DeoR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 320 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3210  DeoR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 320 aa  95.1  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0553478  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3451  transcriptional regulator, DeoR family  26.29 
 
 		 320 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3237  DeoR family transcriptional regulator  25 
 
 		 219 aa  93.6  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3466  transcriptional regulator, DeoR family  26.29 
 
 		 320 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00154683  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3145  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  24.89 
 
 		 320 aa  92  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.546002  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2821  hypothetical DNA-binding protein  26.7 
 
 		 314 aa  89  9e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.184297  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3444  DeoR family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 318 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00725446  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1809  transcriptional regulator, DeoR family  24.59 
 
 		 320 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3437  transcriptional regulator, DeoR family  23.74 
 
 		 320 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3859  hypothetical protein  26.47 
 
 		 323 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5106  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  20.35 
 
 		 319 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.505458  normal  0.201643 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45460  hypothetical protein  22.59 
 
 		 323 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2336  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  25.22 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0387558  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2379  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  25.22 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000786  predicted transcriptional regulator  35 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0574064  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4059  helix-turn-helix, type 11  23.5 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.348793  normal  0.0202879 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6203  DeoR family transcriptional regulator  22.27 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4095  DeoR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 333 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1247  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  19.3 
 
 		 317 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161645 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3671  helix-turn-helix, type 11  23.79 
 
 		 237 aa  67  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.255542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5326  DeoR family transcriptional regulator  21.5 
 
 		 318 aa  66.6  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  0.563326 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0988  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  19.38 
 
 		 317 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0064  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  24.5 
 
 		 328 aa  66.2  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.188997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7049  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  21.24 
 
 		 233 aa  65.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.135487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0960  helix-turn-helix, type 11  19.38 
 
 		 317 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.386939  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1092  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.206539  normal  0.830453 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0978  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  19.38 
 
 		 317 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.318116  normal  0.0703128 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3428  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  30.81 
 
 		 303 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17920  predicted transcriptional regulator  24.5 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.384504 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1446  putative transcriptional regulator  20.69 
 
 		 332 aa  63.2  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00684408  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1751  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  23.83 
 
 		 325 aa  62.8  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.33135  normal  0.990555 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0009  transcriptional regulator, putative  35.42 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.227571  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2098  Helix-turn-helix type 11 domain protein  20.98 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2857  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.64 
 
 		 326 aa  62  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0404483  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2673  hypothetical protein  26.1 
 
 		 320 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000327581 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0284  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.28 
 
 		 332 aa  61.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.527195 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6729  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.79 
 
 		 324 aa  61.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.41486 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6686  hypothetical protein  22.64 
 
 		 327 aa  60.8  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0918823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0249  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.4 
 
 		 324 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0147  helix-turn-helix, type 11  24.81 
 
 		 316 aa  60.8  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2934  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  28.31 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334283 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1895  DeoR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2474  hypothetical protein  27.06 
 
 		 320 aa  60.1  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0188594  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2656  hypothetical protein  27.06 
 
 		 320 aa  60.1  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4041  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.84 
 
 		 316 aa  59.3  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0977  DeoR family transcriptional regulator  21.18 
 
 		 360 aa  59.3  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.226699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0554  TonB-dependent receptor  30.72 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.665291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4104  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  22.17 
 
 		 316 aa  59.3  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1998  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.22 
 
 		 334 aa  58.9  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.556593 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2401  hypothetical protein  26.91 
 
 		 320 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148102  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5398  helix-turn-helix type 11 domain protein  22.68 
 
 		 327 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.229533  normal  0.331781 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3412  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.03 
 
 		 324 aa  58.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1867  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.52 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.117205 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3934  Helix-turn-helix type 11 domain protein  19.44 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0769202  hitchhiker  0.00173443 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5244  DeoR family transcriptional regulator  22.46 
 
 		 337 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.288323 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4738  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  22.63 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.947562  normal  0.956989 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1946  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  25.37 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4054  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.11 
 
 		 324 aa  57  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.135242  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3039  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.69 
 
 		 235 aa  57  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.545561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4135  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  21.84 
 
 		 332 aa  57.4  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.124521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4377  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  21.9 
 
 		 320 aa  57  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000417511 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2690  Helix-turn-helix type 11 domain protein  21.54 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.113203 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2689  hypothetical protein  26.87 
 
 		 320 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0201589  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3135  Helix-turn-helix type 11 domain protein  20.72 
 
 		 329 aa  55.8  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.224168  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3029  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  23.36 
 
 		 327 aa  55.8  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3338  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.5 
 
 		 320 aa  55.8  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2042  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.66 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.395632  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1244  HTH domain family  28.12 
 
 		 313 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0359  Helix-turn-helix type 11 domain protein  34.57 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0713  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  18.78 
 
 		 319 aa  55.5  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.677583  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0998  transcriptional regulator  27.34 
 
 		 313 aa  55.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1001  hypothetical protein  27.34 
 
 		 313 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4172  Helix-turn-helix type 11 domain protein  19.19 
 
 		 317 aa  55.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.917159  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2626  helix-turn-helix, type 11  35.9 
 
 		 230 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.182787  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0680  DeoR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 231 aa  55.5  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2755  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.27 
 
 		 336 aa  55.5  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0838  hypothetical protein  25.33 
 
 		 229 aa  55.1  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.183627 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2670  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  35.9 
 
 		 230 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.750457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1067  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  20.51 
 
 		 320 aa  55.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1962  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  22.07 
 
 		 330 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000800393  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1185  hypothetical protein  25.78 
 
 		 313 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0206  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.11 
 
 		 318 aa  54.3  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0242006 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3846  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.57 
 
 		 230 aa  54.7  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.80209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2296  Helix-turn-helix type 11 domain protein  35.14 
 
 		 322 aa  54.7  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000342768  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1585  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  21.56 
 
 		 244 aa  54.3  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0474711  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>