116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCB4264_A3437 on replicon NC_011725
Organism: Bacillus cereus B4264



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A3437  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 		 320 aa  646    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1809  transcriptional regulator, DeoR family  96.56 
 
 		 320 aa  610  1e-173  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3145  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  88.12 
 
 		 320 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.546002  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3210  DeoR family transcriptional regulator  91.19 
 
 		 320 aa  568  1e-161  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0553478  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3451  transcriptional regulator, DeoR family  90.62 
 
 		 320 aa  568  1e-161  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3444  DeoR family transcriptional regulator  89.06 
 
 		 318 aa  564  1e-160  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00725446  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3147  DeoR family transcriptional regulator  90.31 
 
 		 320 aa  566  1e-160  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3466  transcriptional regulator, DeoR family  89.06 
 
 		 320 aa  561  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00154683  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3237  DeoR family transcriptional regulator  91.74 
 
 		 219 aa  409  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0976  transcriptional regulator  23.55 
 
 		 310 aa  97.4  3e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3281  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  24.59 
 
 		 316 aa  91.7  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.093323  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4654  hypothetical protein  28.17 
 
 		 317 aa  92  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000770885  unclonable  9.19298e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0562  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.94 
 
 		 317 aa  89.4  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.349747  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3613  transcription regulator-like protein  23.74 
 
 		 280 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0101765  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0560  transcriptional regulator  26.89 
 
 		 317 aa  88.6  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00184479  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0777  hypothetical protein  26.42 
 
 		 317 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.845326  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0615  hypothetical protein  26.42 
 
 		 317 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.759398  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0559  transcriptional regulator  26.42 
 
 		 317 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0648  hypothetical protein  26.42 
 
 		 317 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0266881  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0684  hypothetical protein  23.85 
 
 		 317 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0732899  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0705  hypothetical protein  26.42 
 
 		 317 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0716  hypothetical protein  25.94 
 
 		 348 aa  86.7  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.129876  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1613  transcriptional regulator, DeoR family  24.32 
 
 		 314 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0282022  hitchhiker  0.0000000647581 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2821  hypothetical DNA-binding protein  25.78 
 
 		 314 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.184297  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1895  DeoR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3039  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.58 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.545561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2336  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  23.35 
 
 		 230 aa  65.1  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0387558  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2379  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  23.35 
 
 		 230 aa  65.1  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0009  transcriptional regulator, putative  39.29 
 
 		 111 aa  61.6  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.227571  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4044  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.48 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3902  hypothetical protein  27.74 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4003  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.48 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0147  helix-turn-helix, type 11  29.25 
 
 		 316 aa  56.6  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3846  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.91 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.80209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0838  hypothetical protein  25.17 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.183627 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1731  DeoR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 230 aa  55.8  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.590959  normal  0.873384 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0941  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  33.73 
 
 		 230 aa  54.7  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.958625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0456  helix-turn-helix, type 11  24 
 
 		 230 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0450  HTH domain-containing protein  24 
 
 		 230 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0359  Helix-turn-helix type 11 domain protein  32.14 
 
 		 318 aa  53.5  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0510  helix-turn-helix, type 11  23.56 
 
 		 230 aa  53.1  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3671  helix-turn-helix, type 11  31.46 
 
 		 237 aa  52.4  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.255542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1946  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  30.34 
 
 		 321 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0991  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  22.27 
 
 		 302 aa  52  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2934  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  21.4 
 
 		 230 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1289  Helix-turn-helix type 11 domain protein  32.14 
 
 		 315 aa  51.2  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.447111 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3647  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.27 
 
 		 320 aa  51.2  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.306366  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5534  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25 
 
 		 239 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0533877 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1585  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  20.18 
 
 		 244 aa  50.1  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0474711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3107  Helix-turn-helix type 11 domain protein  21.52 
 
 		 324 aa  50.1  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.786544  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0872  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.18 
 
 		 220 aa  50.1  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.919156 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1751  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  25.62 
 
 		 325 aa  49.3  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.33135  normal  0.990555 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0680  DeoR family transcriptional regulator  22.47 
 
 		 231 aa  48.9  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0325  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.16 
 
 		 335 aa  48.9  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00275048  normal  0.0249624 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6729  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.29 
 
 		 324 aa  48.5  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.41486 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0044  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.24 
 
 		 318 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.164988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0554  TonB-dependent receptor  31.87 
 
 		 234 aa  48.1  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.665291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4135  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  29.63 
 
 		 332 aa  48.1  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.124521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0788  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  24.1 
 
 		 319 aa  48.5  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3428  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.19 
 
 		 303 aa  48.5  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3934  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.04 
 
 		 321 aa  47.8  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0769202  hitchhiker  0.00173443 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2755  Helix-turn-helix type 11 domain protein  20.06 
 
 		 336 aa  47.8  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3062  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.69 
 
 		 313 aa  47.4  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal  0.752018 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1294  regulatory protein, DeoR  24.4 
 
 		 336 aa  47  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2296  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.37 
 
 		 322 aa  46.6  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000342768  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7257  helix-turn-helix type 11 domain protein  26.37 
 
 		 326 aa  46.6  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.143006 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7481  transcriptional regulator-like  26.19 
 
 		 326 aa  46.6  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3029  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  29.27 
 
 		 327 aa  46.6  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4305  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.51 
 
 		 233 aa  46.2  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3904  Helix-turn-helix type 11 domain protein  30.38 
 
 		 260 aa  46.2  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0312  putative transcriptional regulator  27.47 
 
 		 388 aa  45.4  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4005  putative transcriptional regulator  30 
 
 		 246 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.22778  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1823  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.57 
 
 		 237 aa  45.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406304  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2626  helix-turn-helix, type 11  20.93 
 
 		 230 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.182787  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45460  hypothetical protein  27.06 
 
 		 323 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2670  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  20.93 
 
 		 230 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.750457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0652  regulatory protein, DeoR  30.95 
 
 		 332 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.545144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1867  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.76 
 
 		 232 aa  45.1  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.117205 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2538  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  25 
 
 		 232 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2605  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  25 
 
 		 232 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0596  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  25 
 
 		 228 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2704  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  25 
 
 		 232 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.981557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3859  hypothetical protein  25.4 
 
 		 323 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4377  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  28.38 
 
 		 320 aa  44.3  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000417511 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0621  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  25 
 
 		 228 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.296179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4104  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  25.95 
 
 		 316 aa  44.3  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1092  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.76 
 
 		 315 aa  44.3  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.206539  normal  0.830453 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1789  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.14 
 
 		 333 aa  44.3  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0003326  normal  0.195591 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5791  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  23.93 
 
 		 339 aa  43.9  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36430  predicted transcriptional regulator  28.75 
 
 		 323 aa  43.9  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.649805 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1457  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  23.81 
 
 		 225 aa  43.5  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0672  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  28.75 
 
 		 228 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0694  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.75 
 
 		 246 aa  43.5  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.454528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1376  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.81 
 
 		 328 aa  43.5  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3400  hypothetical protein  27.38 
 
 		 226 aa  43.1  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1734  transcriptional regulator, putative  27.16 
 
 		 233 aa  43.1  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.781604  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0221  helix-turn-helix, type 11  28.75 
 
 		 228 aa  43.1  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0705  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  28.75 
 
 		 228 aa  43.1  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.179711  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1676  putative transcriptional regulator  27.16 
 
 		 233 aa  43.1  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1180  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.16 
 
 		 233 aa  43.1  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>