206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCG9842_B1613 on replicon NC_011772
Organism: Bacillus cereus G9842



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B1613  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 
314 aa  632  1e-180  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0282022  hitchhiker  0.0000000647581 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3281  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  94.59 
 
 
316 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.093323  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3613  transcription regulator-like protein  92.5 
 
 
280 aa  526  1e-148  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0101765  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0976  transcriptional regulator  26.58 
 
 
310 aa  130  4.0000000000000003e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0684  hypothetical protein  28.29 
 
 
317 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0732899  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0559  transcriptional regulator  27.63 
 
 
317 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0562  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.96 
 
 
317 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.349747  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0777  hypothetical protein  28.29 
 
 
317 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.845326  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0615  hypothetical protein  27.63 
 
 
317 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.759398  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0648  hypothetical protein  27.63 
 
 
317 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0266881  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0716  hypothetical protein  27.33 
 
 
348 aa  116  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.129876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0705  hypothetical protein  28.06 
 
 
317 aa  116  6e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0560  transcriptional regulator  26.97 
 
 
317 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00184479  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4654  hypothetical protein  26.98 
 
 
317 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000770885  unclonable  9.19298e-26 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3147  DeoR family transcriptional regulator  25.47 
 
 
320 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3210  DeoR family transcriptional regulator  25.47 
 
 
320 aa  95.9  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0553478  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3451  transcriptional regulator, DeoR family  25 
 
 
320 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2821  hypothetical DNA-binding protein  24.1 
 
 
314 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.184297  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3466  transcriptional regulator, DeoR family  25 
 
 
320 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00154683  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3145  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  23.86 
 
 
320 aa  92.8  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.546002  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3237  DeoR family transcriptional regulator  26.17 
 
 
219 aa  92  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3444  DeoR family transcriptional regulator  24.61 
 
 
318 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00725446  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1809  transcriptional regulator, DeoR family  24.9 
 
 
320 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3437  transcriptional regulator, DeoR family  23.58 
 
 
320 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3859  hypothetical protein  25 
 
 
323 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4095  DeoR family transcriptional regulator  21.96 
 
 
333 aa  70.5  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0991  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  20.71 
 
 
302 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45460  hypothetical protein  27.07 
 
 
323 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2857  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.39 
 
 
326 aa  67  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0404483  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000786  predicted transcriptional regulator  34.17 
 
 
228 aa  66.2  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0574064  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2336  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  24 
 
 
230 aa  65.9  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0387558  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2379  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  24 
 
 
230 aa  65.9  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0064  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  23.22 
 
 
328 aa  65.9  0.0000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.188997  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7049  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  21.27 
 
 
233 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.135487  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2673  hypothetical protein  25.08 
 
 
320 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000327581 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6203  DeoR family transcriptional regulator  20.74 
 
 
318 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3428  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  30.43 
 
 
303 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5326  DeoR family transcriptional regulator  20.5 
 
 
318 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  0.563326 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17920  predicted transcriptional regulator  22.92 
 
 
238 aa  65.1  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.384504 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4104  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  19.02 
 
 
316 aa  63.9  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1092  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.47 
 
 
315 aa  63.9  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.206539  normal  0.830453 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2474  hypothetical protein  27.52 
 
 
320 aa  63.5  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0188594  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2656  hypothetical protein  27.52 
 
 
320 aa  63.5  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5106  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  20.26 
 
 
319 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.505458  normal  0.201643 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4059  helix-turn-helix, type 11  23.85 
 
 
318 aa  62.4  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.348793  normal  0.0202879 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2401  hypothetical protein  24.76 
 
 
320 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148102  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3671  helix-turn-helix, type 11  22.47 
 
 
237 aa  61.2  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.255542  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2098  Helix-turn-helix type 11 domain protein  20.93 
 
 
318 aa  60.8  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0009  transcriptional regulator, putative  34.38 
 
 
111 aa  60.8  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.227571  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1446  putative transcriptional regulator  20.2 
 
 
332 aa  60.8  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00684408  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0743  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.53 
 
 
328 aa  60.1  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0788  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  23.26 
 
 
319 aa  60.5  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1247  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  17.72 
 
 
317 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.161645 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2689  hypothetical protein  25.93 
 
 
320 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0201589  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0147  helix-turn-helix, type 11  24.03 
 
 
316 aa  58.5  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3135  Helix-turn-helix type 11 domain protein  17.97 
 
 
329 aa  58.9  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.224168  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2021  Helix-turn-helix type 11 domain protein  20.46 
 
 
317 aa  57.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0370713  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2492  Helix-turn-helix type 11 domain protein  20.54 
 
 
302 aa  58.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156303  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0988  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  18.06 
 
 
317 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1946  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  24.63 
 
 
321 aa  57.4  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2690  Helix-turn-helix type 11 domain protein  21.54 
 
 
324 aa  57  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.113203 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1998  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.38 
 
 
334 aa  57  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.556593 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1895  DeoR family transcriptional regulator  25.13 
 
 
229 aa  56.6  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3934  Helix-turn-helix type 11 domain protein  19.42 
 
 
321 aa  56.6  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0769202  hitchhiker  0.00173443 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0977  DeoR family transcriptional regulator  19.21 
 
 
360 aa  56.2  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.226699  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3488  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.36 
 
 
265 aa  56.6  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.483454 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0960  helix-turn-helix, type 11  20.66 
 
 
317 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.386939  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0978  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  20.66 
 
 
317 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.318116  normal  0.0703128 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4377  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  20.57 
 
 
320 aa  56.2  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000417511 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1751  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  19.94 
 
 
325 aa  56.6  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.33135  normal  0.990555 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0660  transcriptional regulator, putative  21.09 
 
 
301 aa  56.2  0.0000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6729  Helix-turn-helix type 11 domain protein  21.71 
 
 
324 aa  56.2  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.41486 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2934  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  27.11 
 
 
230 aa  55.8  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.334283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0249  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  24 
 
 
324 aa  55.8  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5244  DeoR family transcriptional regulator  21.13 
 
 
337 aa  55.8  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.288323 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1867  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.66 
 
 
232 aa  55.5  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.117205 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3039  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25 
 
 
235 aa  55.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.545561  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0554  TonB-dependent receptor  31.9 
 
 
234 aa  55.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.665291  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1244  HTH domain family  28.12 
 
 
313 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4172  Helix-turn-helix type 11 domain protein  18.69 
 
 
317 aa  55.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.917159  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0998  transcriptional regulator  27.34 
 
 
313 aa  54.3  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1001  hypothetical protein  27.34 
 
 
313 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2626  helix-turn-helix, type 11  35.9 
 
 
230 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.182787  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4041  Helix-turn-helix type 11 domain protein  21.7 
 
 
316 aa  55.1  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1731  DeoR family transcriptional regulator  25.45 
 
 
230 aa  55.1  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.590959  normal  0.873384 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2670  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  35.9 
 
 
230 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.750457  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0359  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.29 
 
 
318 aa  54.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0838  hypothetical protein  25.33 
 
 
229 aa  54.7  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.183627 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2296  Helix-turn-helix type 11 domain protein  35.14 
 
 
322 aa  54.3  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000342768  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4645  helix-turn-helix, type 11  18.75 
 
 
333 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0418126  normal  0.223314 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5404  DeoR family transcriptional regulator  19.91 
 
 
332 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924628  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0713  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  20 
 
 
319 aa  54.3  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.677583  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1185  hypothetical protein  25.78 
 
 
313 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1585  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  21.1 
 
 
244 aa  53.5  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0474711  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4135  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  20.87 
 
 
332 aa  53.5  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.124521  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6686  hypothetical protein  21.53 
 
 
327 aa  53.9  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0918823  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3412  Helix-turn-helix type 11 domain protein  20.26 
 
 
324 aa  53.5  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380317  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5534  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.05 
 
 
239 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0533877 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0680  DeoR family transcriptional regulator  25.19 
 
 
231 aa  53.1  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2755  Helix-turn-helix type 11 domain protein  18.12 
 
 
336 aa  53.5  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>