103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH820_3451 on replicon NC_011773
Organism: Bacillus cereus AH820



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005957  BT9727_3210  DeoR family transcriptional regulator  99.69 
 
 
320 aa  647    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0553478  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3147  DeoR family transcriptional regulator  99.69 
 
 
320 aa  648    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3451  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 
320 aa  650    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3466  transcriptional regulator, DeoR family  96.56 
 
 
320 aa  604  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00154683  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3145  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  89.06 
 
 
320 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.546002  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3444  DeoR family transcriptional regulator  91.56 
 
 
318 aa  579  1e-164  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00725446  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3437  transcriptional regulator, DeoR family  90.62 
 
 
320 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1809  transcriptional regulator, DeoR family  89.69 
 
 
320 aa  571  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3237  DeoR family transcriptional regulator  99.54 
 
 
219 aa  442  1e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3281  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  24.17 
 
 
316 aa  99  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.093323  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3613  transcription regulator-like protein  24.9 
 
 
280 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0101765  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1613  transcriptional regulator, DeoR family  24.09 
 
 
314 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0282022  hitchhiker  0.0000000647581 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0976  transcriptional regulator  25 
 
 
310 aa  95.5  1e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4654  hypothetical protein  27.7 
 
 
317 aa  92  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000770885  unclonable  9.19298e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0684  hypothetical protein  24.14 
 
 
317 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0732899  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0560  transcriptional regulator  26.42 
 
 
317 aa  90.1  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00184479  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0777  hypothetical protein  24.45 
 
 
317 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.845326  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0562  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.42 
 
 
317 aa  89.4  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.349747  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0615  hypothetical protein  25.94 
 
 
317 aa  88.6  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.759398  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0559  transcriptional regulator  25.94 
 
 
317 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0648  hypothetical protein  25.94 
 
 
317 aa  88.6  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0266881  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0705  hypothetical protein  25.94 
 
 
317 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0716  hypothetical protein  25.94 
 
 
348 aa  87  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.129876  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3039  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.12 
 
 
235 aa  70.1  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.545561  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2821  hypothetical DNA-binding protein  31.93 
 
 
314 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.184297  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1895  DeoR family transcriptional regulator  24.21 
 
 
229 aa  65.1  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0009  transcriptional regulator, putative  38.1 
 
 
111 aa  61.2  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.227571  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1731  DeoR family transcriptional regulator  25.17 
 
 
230 aa  60.5  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.590959  normal  0.873384 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2336  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  21.59 
 
 
230 aa  59.7  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0387558  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2379  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  21.59 
 
 
230 aa  59.7  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0147  helix-turn-helix, type 11  31.13 
 
 
316 aa  59.7  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0838  hypothetical protein  23.04 
 
 
229 aa  59.3  0.00000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.183627 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0991  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  23.14 
 
 
302 aa  57.8  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4044  Helix-turn-helix type 11 domain protein  21.46 
 
 
221 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3902  hypothetical protein  27.01 
 
 
221 aa  56.6  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4003  Helix-turn-helix type 11 domain protein  21.46 
 
 
221 aa  55.8  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3107  Helix-turn-helix type 11 domain protein  21.5 
 
 
324 aa  55.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.786544  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0456  helix-turn-helix, type 11  24.07 
 
 
230 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0450  HTH domain-containing protein  24.07 
 
 
230 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3846  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.36 
 
 
230 aa  55.1  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.80209  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0941  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  33.73 
 
 
230 aa  54.3  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.958625  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0359  Helix-turn-helix type 11 domain protein  32.14 
 
 
318 aa  53.9  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3647  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.29 
 
 
320 aa  53.1  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.306366  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3934  Helix-turn-helix type 11 domain protein  21.83 
 
 
321 aa  53.1  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0769202  hitchhiker  0.00173443 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0510  helix-turn-helix, type 11  23.61 
 
 
230 aa  52.8  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2934  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  21.3 
 
 
230 aa  52  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.334283 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0788  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  22.15 
 
 
319 aa  51.2  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0325  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.4 
 
 
335 aa  51.6  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00275048  normal  0.0249624 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5534  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.22 
 
 
239 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0533877 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6729  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.35 
 
 
324 aa  51.2  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.41486 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1585  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  21.08 
 
 
244 aa  50.8  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0474711  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2755  Helix-turn-helix type 11 domain protein  21.82 
 
 
336 aa  50.8  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1289  Helix-turn-helix type 11 domain protein  33.33 
 
 
315 aa  50.8  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.447111 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1751  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  25.62 
 
 
325 aa  50.8  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.33135  normal  0.990555 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3428  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.19 
 
 
303 aa  50.4  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3671  helix-turn-helix, type 11  24.31 
 
 
237 aa  49.7  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.255542  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0680  DeoR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
231 aa  48.9  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3859  hypothetical protein  26.98 
 
 
323 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45460  hypothetical protein  28.09 
 
 
323 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4135  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  29.63 
 
 
332 aa  48.5  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.124521  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3062  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.69 
 
 
313 aa  47.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal  0.752018 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3904  Helix-turn-helix type 11 domain protein  31.65 
 
 
260 aa  48.5  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7257  helix-turn-helix type 11 domain protein  26.37 
 
 
326 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.143006 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0872  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.18 
 
 
220 aa  48.5  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.919156 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3029  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  29.27 
 
 
327 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189154  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1946  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  28.09 
 
 
321 aa  47.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2296  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.46 
 
 
322 aa  47.8  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000342768  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2626  helix-turn-helix, type 11  20.93 
 
 
230 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.182787  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2670  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  20.93 
 
 
230 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.750457  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0554  TonB-dependent receptor  31.87 
 
 
234 aa  46.6  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.665291  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0312  putative transcriptional regulator  27.47 
 
 
388 aa  46.6  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1294  regulatory protein, DeoR  24.04 
 
 
336 aa  46.6  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4104  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  30.95 
 
 
316 aa  46.6  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1092  Helix-turn-helix type 11 domain protein  30.95 
 
 
315 aa  46.6  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.206539  normal  0.830453 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1644  Helix-turn-helix type 11 domain protein  21.14 
 
 
347 aa  46.6  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0304784  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0044  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.24 
 
 
318 aa  46.2  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.164988  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4305  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.81 
 
 
233 aa  46.2  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5791  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  23.93 
 
 
339 aa  46.2  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7481  transcriptional regulator-like  26.19 
 
 
326 aa  45.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0652  regulatory protein, DeoR  32.14 
 
 
332 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.545144  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3980  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.83 
 
 
317 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26771  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2155  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.78 
 
 
324 aa  45.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.190178 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36430  predicted transcriptional regulator  28.75 
 
 
323 aa  45.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.649805 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0335  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.25 
 
 
321 aa  45.1  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.377994  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4005  putative transcriptional regulator  30 
 
 
246 aa  44.3  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.22778  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2874  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  21.23 
 
 
322 aa  44.3  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2944  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  25.88 
 
 
324 aa  44.3  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1867  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.61 
 
 
232 aa  44.3  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.117205 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1376  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.81 
 
 
328 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4059  helix-turn-helix, type 11  21.7 
 
 
318 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.348793  normal  0.0202879 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4377  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  28.38 
 
 
320 aa  43.9  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000417511 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2673  putative repressor transcription regulator protein  20.75 
 
 
232 aa  43.5  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.94129  normal  0.397505 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0596  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  19.31 
 
 
228 aa  43.5  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0621  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  19.31 
 
 
228 aa  43.5  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.296179  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3494  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.94 
 
 
344 aa  43.5  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3402  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  30.12 
 
 
323 aa  43.5  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0120343  normal  0.0687104 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2496  Helix-turn-helix type 11 domain protein  30.43 
 
 
322 aa  43.1  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.496312  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0452  helix-turn-helix type 11 domain protein  24.32 
 
 
324 aa  43.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0437  hypothetical protein  22.01 
 
 
326 aa  42.7  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1823  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.38 
 
 
237 aa  42.7  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406304  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>