More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1585 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1585  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  100 
 
 
244 aa  495  1e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0474711  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2026  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  40.27 
 
 
245 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.826373  normal  0.365081 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2425  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  37.39 
 
 
245 aa  141  9e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0915708 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3671  helix-turn-helix, type 11  31.72 
 
 
237 aa  97.8  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.255542  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1013  hypothetical protein  31.6 
 
 
245 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.18033  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1071  Helix-turn-helix type 11 domain protein  32.11 
 
 
245 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.045266  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5534  Helix-turn-helix type 11 domain protein  31.07 
 
 
239 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0533877 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3647  Helix-turn-helix type 11 domain protein  32.52 
 
 
320 aa  87.8  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.306366  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35620  predicted transcriptional regulator  29.82 
 
 
241 aa  85.9  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0977  DeoR family transcriptional regulator  32.34 
 
 
360 aa  85.1  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.226699  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3980  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  31.58 
 
 
317 aa  82.8  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26771  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1446  putative transcriptional regulator  29.26 
 
 
332 aa  82.4  0.000000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00684408  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1962  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  30 
 
 
330 aa  82.4  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000800393  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4172  Helix-turn-helix type 11 domain protein  32.85 
 
 
317 aa  79.3  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.917159  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4095  DeoR family transcriptional regulator  31.63 
 
 
333 aa  79  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3934  Helix-turn-helix type 11 domain protein  30.26 
 
 
321 aa  79  0.00000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0769202  hitchhiker  0.00173443 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6203  DeoR family transcriptional regulator  28.24 
 
 
318 aa  78.6  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4654  hypothetical protein  24.64 
 
 
317 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000770885  unclonable  9.19298e-26 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0284  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.88 
 
 
332 aa  76.6  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.527195 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0343  Helix-turn-helix type 11 domain protein  32.02 
 
 
339 aa  76.6  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4041  Helix-turn-helix type 11 domain protein  30.54 
 
 
316 aa  76.6  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0573  Helix-turn-helix type 11 domain protein  30.05 
 
 
317 aa  76.3  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000975752  normal  0.773563 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3039  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25 
 
 
235 aa  75.9  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.545561  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0249  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  29.05 
 
 
324 aa  75.9  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5106  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  27.45 
 
 
319 aa  75.9  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.505458  normal  0.201643 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0777  hypothetical protein  24.62 
 
 
317 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.845326  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0941  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.09 
 
 
230 aa  75.9  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.958625  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0684  hypothetical protein  24.62 
 
 
317 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0732899  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0705  hypothetical protein  24.61 
 
 
317 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0560  transcriptional regulator  24.61 
 
 
317 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00184479  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4377  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  30.33 
 
 
320 aa  74.7  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000417511 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0615  hypothetical protein  24.08 
 
 
317 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.759398  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0559  transcriptional regulator  24.1 
 
 
317 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0920  Helix-turn-helix type 11 domain protein  32.02 
 
 
327 aa  73.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.711136  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0648  hypothetical protein  24.08 
 
 
317 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0266881  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0510  helix-turn-helix, type 11  29.7 
 
 
230 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3867  Helix-turn-helix type 11 domain protein  32.23 
 
 
335 aa  74.3  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0456  helix-turn-helix, type 11  29.7 
 
 
230 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0450  HTH domain-containing protein  29.7 
 
 
230 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4645  helix-turn-helix, type 11  26.29 
 
 
333 aa  73.2  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0418126  normal  0.223314 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2296  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.57 
 
 
322 aa  73.6  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000342768  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0562  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  24.1 
 
 
317 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.349747  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6729  Helix-turn-helix type 11 domain protein  30.23 
 
 
324 aa  72.8  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.41486 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4323  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  29.21 
 
 
327 aa  72.8  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.807083  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2492  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.91 
 
 
302 aa  72.8  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156303  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0679  helix-turn-helix, type 11  28.84 
 
 
237 aa  72.4  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3107  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.95 
 
 
324 aa  72.4  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.786544  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5398  helix-turn-helix type 11 domain protein  30.92 
 
 
327 aa  72.4  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.229533  normal  0.331781 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3904  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.4 
 
 
260 aa  72.4  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2683  Helix-turn-helix type 11 domain protein  30.69 
 
 
324 aa  72.4  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.255194  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0716  hypothetical protein  23.59 
 
 
348 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.129876  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0206  Helix-turn-helix type 11 domain protein  30.24 
 
 
318 aa  72.4  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0242006 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7481  transcriptional regulator-like  29.86 
 
 
326 aa  72  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0970  transcriptional regulator-like protein  27.19 
 
 
330 aa  72  0.000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45460  hypothetical protein  28.25 
 
 
323 aa  72  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1247  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  27.45 
 
 
317 aa  72  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.161645 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5244  DeoR family transcriptional regulator  30.4 
 
 
337 aa  71.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.288323 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2821  hypothetical DNA-binding protein  25.96 
 
 
314 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.184297  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1867  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.44 
 
 
232 aa  71.6  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.117205 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4054  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.57 
 
 
324 aa  71.6  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.135242  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2098  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.06 
 
 
318 aa  71.2  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3679  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.67 
 
 
321 aa  70.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0370855  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2021  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.24 
 
 
317 aa  70.5  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0370713  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0960  helix-turn-helix, type 11  26.47 
 
 
317 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.386939  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0978  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  26.47 
 
 
317 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.318116  normal  0.0703128 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2010  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.76 
 
 
320 aa  70.5  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17920  predicted transcriptional regulator  30.1 
 
 
238 aa  70.1  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.384504 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4135  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  27.19 
 
 
332 aa  69.7  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.124521  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2367  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.63 
 
 
313 aa  69.3  0.00000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.440872  normal  0.310405 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1959  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.78 
 
 
234 aa  68.9  0.00000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3428  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.05 
 
 
303 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0660  transcriptional regulator, putative  25.25 
 
 
301 aa  68.2  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4003  Helix-turn-helix type 11 domain protein  31.12 
 
 
221 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4044  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.12 
 
 
221 aa  67.8  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0988  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  25.98 
 
 
317 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5463  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.9 
 
 
313 aa  68.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.364956  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2698  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  29.91 
 
 
323 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000125555  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3075  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.57 
 
 
326 aa  67  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00643592  unclonable  0.0000000271212 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1647  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  24.27 
 
 
299 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0713  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  24.61 
 
 
319 aa  67.4  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.677583  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4846  transcriptional regulator protein-like protein  32.26 
 
 
326 aa  67.8  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.715011 
 
 
-
 
NC_004310  BR1734  transcriptional regulator, putative  28.44 
 
 
233 aa  67  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.781604  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1751  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.85 
 
 
325 aa  66.6  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.33135  normal  0.990555 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1676  putative transcriptional regulator  28.44 
 
 
233 aa  67  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0766  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29 
 
 
303 aa  66.2  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2004  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  30.88 
 
 
321 aa  66.6  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.532666  normal  0.656208 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0788  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  22.61 
 
 
319 aa  66.2  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7049  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  28.1 
 
 
233 aa  65.9  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.135487  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0094  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.9 
 
 
325 aa  65.5  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1067  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  29.38 
 
 
320 aa  65.5  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1808  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  27.24 
 
 
327 aa  65.1  0.0000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.503322  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1376  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.29 
 
 
328 aa  65.1  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4133  DeoR family transcriptional regulator  26.73 
 
 
317 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113991  normal  0.040793 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1180  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  28.44 
 
 
233 aa  64.7  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4059  helix-turn-helix, type 11  26.48 
 
 
318 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.348793  normal  0.0202879 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0991  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  21.98 
 
 
302 aa  64.7  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2166  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.5 
 
 
320 aa  63.9  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.304825  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3029  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.83 
 
 
327 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189154  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0335  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.49 
 
 
321 aa  63.9  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.377994  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3846  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.29 
 
 
230 aa  63.9  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.80209  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>