219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0976 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0976  transcriptional regulator  100 
 
 		 310 aa  628  1e-179  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3281  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.91 
 
 		 316 aa  133  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.093323  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0560  transcriptional regulator  25.94 
 
 		 317 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00184479  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0684  hypothetical protein  26.4 
 
 		 317 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0732899  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0705  hypothetical protein  25.94 
 
 		 317 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1613  transcriptional regulator, DeoR family  26.58 
 
 		 314 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0282022  hitchhiker  0.0000000647581 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0777  hypothetical protein  26.09 
 
 		 317 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.845326  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4654  hypothetical protein  25.47 
 
 		 317 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000770885  unclonable  9.19298e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0562  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.71 
 
 		 317 aa  127  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.349747  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0615  hypothetical protein  25.31 
 
 		 317 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.759398  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0648  hypothetical protein  25.31 
 
 		 317 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0266881  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0559  transcriptional regulator  25.16 
 
 		 317 aa  122  6e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3613  transcription regulator-like protein  27.7 
 
 		 280 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0101765  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0716  hypothetical protein  25 
 
 		 348 aa  120  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.129876  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2821  hypothetical DNA-binding protein  26.65 
 
 		 314 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.184297  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1809  transcriptional regulator, DeoR family  23.62 
 
 		 320 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3437  transcriptional regulator, DeoR family  23.55 
 
 		 320 aa  94  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3147  DeoR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 320 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3237  DeoR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 219 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3210  DeoR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 320 aa  90.5  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0553478  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3451  transcriptional regulator, DeoR family  29.41 
 
 		 320 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3466  transcriptional regulator, DeoR family  25.67 
 
 		 320 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00154683  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3145  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  25.07 
 
 		 320 aa  90.5  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.546002  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3444  DeoR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 318 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00725446  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5106  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  19.74 
 
 		 319 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.505458  normal  0.201643 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0988  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  21.05 
 
 		 317 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0960  helix-turn-helix, type 11  22.86 
 
 		 317 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.386939  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0978  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  22.86 
 
 		 317 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.318116  normal  0.0703128 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1247  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  18.95 
 
 		 317 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161645 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1446  putative transcriptional regulator  23.53 
 
 		 332 aa  70.5  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00684408  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4104  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  19.63 
 
 		 316 aa  70.9  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1895  DeoR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0977  DeoR family transcriptional regulator  20.77 
 
 		 360 aa  69.7  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.226699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3039  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.86 
 
 		 235 aa  69.3  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.545561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0359  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.81 
 
 		 318 aa  69.3  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5463  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  21.5 
 
 		 313 aa  68.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.364956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5326  DeoR family transcriptional regulator  19.94 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  0.563326 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4323  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  25.12 
 
 		 327 aa  67  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.807083  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2336  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  26.46 
 
 		 230 aa  67  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0387558  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2379  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.46 
 
 		 230 aa  67  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0343  Helix-turn-helix type 11 domain protein  20.98 
 
 		 339 aa  67  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5212  Helix-turn-helix type 11 domain protein  19.78 
 
 		 317 aa  67  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000701081  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0788  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  26.92 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2503  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.33 
 
 		 232 aa  65.9  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.751243 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3029  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  20.58 
 
 		 327 aa  65.1  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189154  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2098  Helix-turn-helix type 11 domain protein  19.87 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0064  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  24.32 
 
 		 328 aa  64.7  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.188997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2909  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.89 
 
 		 232 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36430  predicted transcriptional regulator  21.04 
 
 		 323 aa  64.3  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.649805 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1347  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  20.54 
 
 		 339 aa  63.9  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.469049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0510  helix-turn-helix, type 11  25.43 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0450  HTH domain-containing protein  25.43 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000786  predicted transcriptional regulator  27.27 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0574064  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0456  helix-turn-helix, type 11  25.43 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4172  Helix-turn-helix type 11 domain protein  20.44 
 
 		 317 aa  62.4  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.917159  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4095  DeoR family transcriptional regulator  23.15 
 
 		 333 aa  62.4  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45460  hypothetical protein  22.26 
 
 		 323 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2673  putative repressor transcription regulator protein  24.56 
 
 		 232 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.94129  normal  0.397505 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2906  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.46 
 
 		 334 aa  62.4  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.754227  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2944  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  21.41 
 
 		 324 aa  61.2  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3647  Helix-turn-helix type 11 domain protein  20.9 
 
 		 320 aa  61.6  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.306366  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0680  DeoR family transcriptional regulator  24.21 
 
 		 231 aa  61.6  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6203  DeoR family transcriptional regulator  22.57 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0713  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  23.96 
 
 		 319 aa  61.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.677583  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4135  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  23.03 
 
 		 332 aa  60.8  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.124521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3859  hypothetical protein  22.85 
 
 		 323 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3553  helix-turn-helix, type 11  25.12 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4549  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.91 
 
 		 327 aa  60.1  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4041  Helix-turn-helix type 11 domain protein  21 
 
 		 316 aa  59.7  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0284  Helix-turn-helix type 11 domain protein  18.62 
 
 		 332 aa  59.7  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.527195 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3867  Helix-turn-helix type 11 domain protein  19.68 
 
 		 335 aa  59.7  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2683  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.08 
 
 		 324 aa  59.3  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.255194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5404  DeoR family transcriptional regulator  20.27 
 
 		 332 aa  59.3  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3107  Helix-turn-helix type 11 domain protein  20.63 
 
 		 324 aa  59.3  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.786544  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0009  transcriptional regulator, putative  38.1 
 
 		 111 aa  58.9  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.227571  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1289  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.02 
 
 		 315 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.447111 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0660  transcriptional regulator, putative  22.88 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1185  hypothetical protein  23.03 
 
 		 313 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3142  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  25.67 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1180  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  22.92 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1734  transcriptional regulator, putative  25.27 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.781604  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2492  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.44 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156303  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2064  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.22 
 
 		 337 aa  57.4  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.177932  normal  0.600491 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2785  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  26.74 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.899973 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0249  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  19.59 
 
 		 324 aa  57  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0991  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  22.78 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7481  transcriptional regulator-like  19.24 
 
 		 326 aa  57  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2857  Helix-turn-helix type 11 domain protein  20 
 
 		 326 aa  57  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0404483  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02350  predicted transcriptional regulator  21.93 
 
 		 327 aa  57  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0206  Helix-turn-helix type 11 domain protein  21.46 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0242006 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1457  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  25.13 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1867  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.67 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.117205 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1092  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.32 
 
 		 315 aa  56.2  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.206539  normal  0.830453 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1359  Helix-turn-helix type 11 domain protein  21.74 
 
 		 322 aa  56.2  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1789  Helix-turn-helix type 11 domain protein  20.95 
 
 		 333 aa  56.2  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0003326  normal  0.195591 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0838  hypothetical protein  29.92 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.183627 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2755  Helix-turn-helix type 11 domain protein  20.74 
 
 		 336 aa  55.8  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1593  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  24.86 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.375886 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2021  Helix-turn-helix type 11 domain protein  21.17 
 
 		 317 aa  55.8  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0370713  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1751  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  21.82 
 
 		 325 aa  55.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.33135  normal  0.990555 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>