More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4549 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4549  Helix-turn-helix type 11 domain protein  100 
 
 		 327 aa  637    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0249  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  56.37 
 
 		 324 aa  317  2e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1047  DeoR family transcriptional regulator  56.45 
 
 		 322 aa  306  3e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0554838 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0988  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  50.47 
 
 		 317 aa  297  2e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4133  DeoR family transcriptional regulator  55.13 
 
 		 317 aa  295  8e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113991  normal  0.040793 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0284  Helix-turn-helix type 11 domain protein  58.12 
 
 		 332 aa  293  3e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.527195 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0920  Helix-turn-helix type 11 domain protein  53.46 
 
 		 327 aa  293  3e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.711136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5463  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  50.95 
 
 		 313 aa  291  9e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.364956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5212  Helix-turn-helix type 11 domain protein  55.35 
 
 		 317 aa  291  1e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000701081  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0960  helix-turn-helix, type 11  49.84 
 
 		 317 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.386939  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0978  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  49.84 
 
 		 317 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.318116  normal  0.0703128 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6203  DeoR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 318 aa  288  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4095  DeoR family transcriptional regulator  54.4 
 
 		 333 aa  286  2.9999999999999996e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8630  DeoR family transcriptional regulator  52.48 
 
 		 322 aa  283  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2098  Helix-turn-helix type 11 domain protein  53.75 
 
 		 318 aa  276  3e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2974  DeoR family transcriptional regulator  52.68 
 
 		 319 aa  275  7e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.779274  normal  0.781562 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5106  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  49.37 
 
 		 319 aa  272  7e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.505458  normal  0.201643 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1247  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  48.59 
 
 		 317 aa  271  1e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161645 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3107  Helix-turn-helix type 11 domain protein  51.1 
 
 		 324 aa  265  7e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.786544  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5326  DeoR family transcriptional regulator  48.76 
 
 		 318 aa  259  4e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  0.563326 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3338  Helix-turn-helix type 11 domain protein  48.62 
 
 		 320 aa  256  3e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4172  Helix-turn-helix type 11 domain protein  50.95 
 
 		 317 aa  256  4e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.917159  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4377  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  50.16 
 
 		 320 aa  252  7e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000417511 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1446  putative transcriptional regulator  47.53 
 
 		 332 aa  251  1e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00684408  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5404  DeoR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 332 aa  250  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0367  Helix-turn-helix type 11 domain protein  46.44 
 
 		 335 aa  248  7e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8641  Helix-turn-helix type 11 domain protein  50.46 
 
 		 320 aa  248  9e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0977  DeoR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 360 aa  245  8e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.226699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4323  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  49.18 
 
 		 327 aa  245  9e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.807083  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1067  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  49.53 
 
 		 320 aa  244  9.999999999999999e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3867  Helix-turn-helix type 11 domain protein  48.66 
 
 		 335 aa  242  7.999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4738  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  44.48 
 
 		 313 aa  241  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.947562  normal  0.956989 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4787  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  45.83 
 
 		 336 aa  238  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.287509 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0206  Helix-turn-helix type 11 domain protein  45.6 
 
 		 318 aa  236  3e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0242006 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0153  Helix-turn-helix type 11 domain protein  47 
 
 		 325 aa  235  8e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1742  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2064  Helix-turn-helix type 11 domain protein  48.48 
 
 		 337 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.177932  normal  0.600491 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4041  Helix-turn-helix type 11 domain protein  48.45 
 
 		 316 aa  232  8.000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2690  Helix-turn-helix type 11 domain protein  51.66 
 
 		 324 aa  230  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.113203 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1998  Helix-turn-helix type 11 domain protein  45.4 
 
 		 334 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.556593 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0343  Helix-turn-helix type 11 domain protein  45.6 
 
 		 339 aa  216  2.9999999999999998e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3135  Helix-turn-helix type 11 domain protein  45.62 
 
 		 329 aa  214  9.999999999999999e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.224168  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0094  Helix-turn-helix type 11 domain protein  44.63 
 
 		 325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02350  predicted transcriptional regulator  45.76 
 
 		 327 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3486  Helix-turn-helix type 11 domain protein  49.68 
 
 		 314 aa  212  7.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1359  Helix-turn-helix type 11 domain protein  46.1 
 
 		 322 aa  212  7.999999999999999e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3513  Helix-turn-helix type 11 domain protein  45.79 
 
 		 322 aa  212  7.999999999999999e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188923  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2906  Helix-turn-helix type 11 domain protein  44.15 
 
 		 334 aa  210  3e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.754227  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5244  DeoR family transcriptional regulator  45.25 
 
 		 337 aa  209  7e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.288323 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3293  Helix-turn-helix type 11 domain protein  46.6 
 
 		 327 aa  204  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0990426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0728  Helix-turn-helix type 11 domain protein  45.85 
 
 		 320 aa  194  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0463  Helix-turn-helix type 11 domain protein  42.36 
 
 		 334 aa  194  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.104964  normal  0.0170301 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2888  Helix-turn-helix type 11 domain protein  48.01 
 
 		 317 aa  192  4e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00647609 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2870  Helix-turn-helix type 11 domain protein  48 
 
 		 326 aa  190  2.9999999999999997e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.308782  normal  0.417493 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1347  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  41.43 
 
 		 339 aa  186  5e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.469049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4059  helix-turn-helix, type 11  39.44 
 
 		 318 aa  165  8e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.348793  normal  0.0202879 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00443  repressor  40.13 
 
 		 322 aa  149  6e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0287725  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17920  predicted transcriptional regulator  41.89 
 
 		 238 aa  145  1e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.384504 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3412  Helix-turn-helix type 11 domain protein  37.46 
 
 		 324 aa  141  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0713  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  31.65 
 
 		 319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.677583  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0327  Helix-turn-helix type 11 domain protein  33.73 
 
 		 339 aa  135  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45460  hypothetical protein  35.17 
 
 		 323 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3679  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  36.18 
 
 		 321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0370855  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4645  helix-turn-helix, type 11  36.57 
 
 		 333 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0418126  normal  0.223314 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0147  helix-turn-helix, type 11  33.23 
 
 		 316 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1946  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  30.34 
 
 		 321 aa  126  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1870  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  39 
 
 		 337 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.199317 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2627  Helix-turn-helix type 11 domain protein  37.66 
 
 		 332 aa  125  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3859  hypothetical protein  35.56 
 
 		 323 aa  122  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2021  Helix-turn-helix type 11 domain protein  30.03 
 
 		 317 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0370713  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2857  Helix-turn-helix type 11 domain protein  35.33 
 
 		 326 aa  115  6.9999999999999995e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0404483  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1789  Helix-turn-helix type 11 domain protein  34.57 
 
 		 333 aa  112  8.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0003326  normal  0.195591 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2541  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  33.96 
 
 		 228 aa  100  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000786  predicted transcriptional regulator  34.47 
 
 		 228 aa  99.8  6e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0574064  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0104  hypothetical protein  36.45 
 
 		 230 aa  98.2  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3440  Helix-turn-helix type 11 domain protein  35.19 
 
 		 336 aa  96.7  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000171457  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3142  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  35 
 
 		 232 aa  95.5  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2785  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  32.56 
 
 		 229 aa  94.7  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.899973 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1758  hypothetical protein  32.55 
 
 		 230 aa  94.4  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4104  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  33.64 
 
 		 316 aa  94  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2673  hypothetical protein  27.52 
 
 		 320 aa  94  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000327581 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0680  DeoR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 231 aa  93.6  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2605  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  32.55 
 
 		 232 aa  93.2  6e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0743  Helix-turn-helix type 11 domain protein  31.6 
 
 		 328 aa  92.4  9e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2401  hypothetical protein  27.52 
 
 		 320 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148102  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2538  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  32.55 
 
 		 232 aa  92  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2689  hypothetical protein  28.57 
 
 		 320 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0201589  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2474  hypothetical protein  26.61 
 
 		 320 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0188594  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2656  hypothetical protein  26.61 
 
 		 320 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2704  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  32.84 
 
 		 232 aa  91.7  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.981557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0941  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  28.44 
 
 		 230 aa  90.9  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.958625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0190  Helix-turn-helix type 11 domain protein  36.55 
 
 		 242 aa  91.3  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3039  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.64 
 
 		 235 aa  90.5  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.545561  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1823  Helix-turn-helix type 11 domain protein  34.85 
 
 		 237 aa  90.9  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406304  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1185  hypothetical protein  31.88 
 
 		 313 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1867  Helix-turn-helix type 11 domain protein  34.64 
 
 		 232 aa  89.7  7e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.117205 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0172  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  36.04 
 
 		 242 aa  88.6  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.657073  normal  0.98017 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1457  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  32.84 
 
 		 225 aa  88.6  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2755  Helix-turn-helix type 11 domain protein  30.82 
 
 		 336 aa  87.8  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2010  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  33.19 
 
 		 320 aa  87.4  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4654  hypothetical protein  25.93 
 
 		 317 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000770885  unclonable  9.19298e-26 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>