More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4133 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4133  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 
317 aa  627  1e-179  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113991  normal  0.040793 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1047  DeoR family transcriptional regulator  59.74 
 
 
322 aa  348  9e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0554838 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2098  Helix-turn-helix type 11 domain protein  59.68 
 
 
318 aa  344  1e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2974  DeoR family transcriptional regulator  57.43 
 
 
319 aa  336  3.9999999999999995e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.779274  normal  0.781562 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6203  DeoR family transcriptional regulator  56.33 
 
 
318 aa  335  7.999999999999999e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0249  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  55.77 
 
 
324 aa  331  1e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5463  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  53.33 
 
 
313 aa  309  4e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.364956  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8630  DeoR family transcriptional regulator  53.38 
 
 
322 aa  303  3.0000000000000004e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0920  Helix-turn-helix type 11 domain protein  52.7 
 
 
327 aa  300  2e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.711136  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4095  DeoR family transcriptional regulator  55.13 
 
 
333 aa  293  3e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0284  Helix-turn-helix type 11 domain protein  54.49 
 
 
332 aa  285  5e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.527195 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3107  Helix-turn-helix type 11 domain protein  50.97 
 
 
324 aa  281  8.000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.786544  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5212  Helix-turn-helix type 11 domain protein  51.9 
 
 
317 aa  276  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000701081  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0988  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  46.86 
 
 
317 aa  275  5e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4549  Helix-turn-helix type 11 domain protein  55.13 
 
 
327 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8641  Helix-turn-helix type 11 domain protein  52.4 
 
 
320 aa  270  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160159  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0960  helix-turn-helix, type 11  46.23 
 
 
317 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.386939  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0978  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  46.23 
 
 
317 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.318116  normal  0.0703128 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5106  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  48.26 
 
 
319 aa  267  1e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.505458  normal  0.201643 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4787  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  47.59 
 
 
336 aa  265  7e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.287509 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4377  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  52.86 
 
 
320 aa  265  7e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000417511 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1247  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  46.86 
 
 
317 aa  264  1e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.161645 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1067  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  52.09 
 
 
320 aa  262  4.999999999999999e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1446  putative transcriptional regulator  47.6 
 
 
332 aa  259  4e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00684408  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5326  DeoR family transcriptional regulator  46.95 
 
 
318 aa  258  8e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  0.563326 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2690  Helix-turn-helix type 11 domain protein  53.54 
 
 
324 aa  253  3e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.113203 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0153  Helix-turn-helix type 11 domain protein  46.6 
 
 
325 aa  250  3e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1742  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0206  Helix-turn-helix type 11 domain protein  45.98 
 
 
318 aa  249  3e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0242006 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4172  Helix-turn-helix type 11 domain protein  49.01 
 
 
317 aa  249  4e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.917159  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4041  Helix-turn-helix type 11 domain protein  50 
 
 
316 aa  248  1e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4323  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  46.53 
 
 
327 aa  248  1e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.807083  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3338  Helix-turn-helix type 11 domain protein  48.45 
 
 
320 aa  246  3e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0367  Helix-turn-helix type 11 domain protein  44.18 
 
 
335 aa  242  5e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3486  Helix-turn-helix type 11 domain protein  48.59 
 
 
314 aa  235  6e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5404  DeoR family transcriptional regulator  47.28 
 
 
332 aa  235  7e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924628  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0094  Helix-turn-helix type 11 domain protein  44.16 
 
 
325 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5244  DeoR family transcriptional regulator  47.32 
 
 
337 aa  233  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.288323 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3135  Helix-turn-helix type 11 domain protein  46.22 
 
 
329 aa  232  6e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.224168  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0977  DeoR family transcriptional regulator  43.77 
 
 
360 aa  229  6e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.226699  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1998  Helix-turn-helix type 11 domain protein  45.18 
 
 
334 aa  224  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.556593 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0463  Helix-turn-helix type 11 domain protein  42.63 
 
 
334 aa  223  3e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.104964  normal  0.0170301 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3867  Helix-turn-helix type 11 domain protein  44 
 
 
335 aa  223  4e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3293  Helix-turn-helix type 11 domain protein  46.45 
 
 
327 aa  218  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0990426  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2906  Helix-turn-helix type 11 domain protein  42.76 
 
 
334 aa  218  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.754227  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4738  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  40.54 
 
 
313 aa  217  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.947562  normal  0.956989 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2064  Helix-turn-helix type 11 domain protein  45.19 
 
 
337 aa  215  8e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.177932  normal  0.600491 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02350  predicted transcriptional regulator  43.73 
 
 
327 aa  212  4.9999999999999996e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3513  Helix-turn-helix type 11 domain protein  44.41 
 
 
322 aa  207  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188923  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2870  Helix-turn-helix type 11 domain protein  46.53 
 
 
326 aa  206  6e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.308782  normal  0.417493 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0343  Helix-turn-helix type 11 domain protein  42.35 
 
 
339 aa  199  3.9999999999999996e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1359  Helix-turn-helix type 11 domain protein  41.56 
 
 
322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2888  Helix-turn-helix type 11 domain protein  45.97 
 
 
317 aa  194  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00647609 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1347  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  43.17 
 
 
339 aa  186  5e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.469049  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0728  Helix-turn-helix type 11 domain protein  41.2 
 
 
320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00443  repressor  40.14 
 
 
322 aa  156  6e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0287725  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4059  helix-turn-helix, type 11  38.32 
 
 
318 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.348793  normal  0.0202879 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0147  helix-turn-helix, type 11  34.82 
 
 
316 aa  152  8e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1870  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  37.35 
 
 
337 aa  149  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.199317 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17920  predicted transcriptional regulator  40.54 
 
 
238 aa  146  5e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.384504 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3412  Helix-turn-helix type 11 domain protein  37.11 
 
 
324 aa  138  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380317  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1946  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  30.45 
 
 
321 aa  136  5e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2021  Helix-turn-helix type 11 domain protein  32.48 
 
 
317 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0370713  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0713  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  29.39 
 
 
319 aa  130  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.677583  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2627  Helix-turn-helix type 11 domain protein  35.84 
 
 
332 aa  124  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0327  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.94 
 
 
339 aa  122  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489263  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3859  hypothetical protein  33.23 
 
 
323 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3440  Helix-turn-helix type 11 domain protein  35.6 
 
 
336 aa  117  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000171457  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45460  hypothetical protein  33.12 
 
 
323 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1789  Helix-turn-helix type 11 domain protein  30.32 
 
 
333 aa  112  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0003326  normal  0.195591 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3679  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  30.53 
 
 
321 aa  102  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0370855  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000786  predicted transcriptional regulator  30.99 
 
 
228 aa  99.4  8e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0574064  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2105  hypothetical protein  34.15 
 
 
228 aa  95.9  8e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2094  hypothetical protein  34.15 
 
 
228 aa  95.9  8e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2785  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  31.16 
 
 
229 aa  94  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.899973 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4645  helix-turn-helix, type 11  28.62 
 
 
333 aa  94  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0418126  normal  0.223314 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2857  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.42 
 
 
326 aa  92.8  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0404483  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0554  TonB-dependent receptor  31.25 
 
 
234 aa  90.5  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.665291  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1823  Helix-turn-helix type 11 domain protein  34.01 
 
 
237 aa  90.9  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406304  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2503  Helix-turn-helix type 11 domain protein  35.5 
 
 
232 aa  89.7  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.751243 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2541  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  29.6 
 
 
228 aa  90.1  5e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0510  helix-turn-helix, type 11  34.45 
 
 
230 aa  90.1  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0680  DeoR family transcriptional regulator  27.01 
 
 
231 aa  89.7  6e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0450  HTH domain-containing protein  34.45 
 
 
230 aa  89.4  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0456  helix-turn-helix, type 11  34.45 
 
 
230 aa  89.4  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2909  Helix-turn-helix type 11 domain protein  35.5 
 
 
232 aa  87.8  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1647  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.57 
 
 
299 aa  87.8  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3142  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  31.16 
 
 
232 aa  87.8  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92923  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2755  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.97 
 
 
336 aa  87  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0588  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  32.84 
 
 
237 aa  87.4  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2627  Helix-turn-helix type 11 domain protein  31.6 
 
 
242 aa  86.7  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0532  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  33.18 
 
 
231 aa  86.3  6e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0172  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  32.93 
 
 
242 aa  86.3  7e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.657073  normal  0.98017 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0941  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.54 
 
 
230 aa  85.1  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.958625  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0190  Helix-turn-helix type 11 domain protein  33.49 
 
 
242 aa  85.5  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4104  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  33.33 
 
 
316 aa  84.7  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2538  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  30.15 
 
 
232 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2605  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  28.7 
 
 
232 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2368  helix-turn-helix, type 11  33.82 
 
 
231 aa  84.3  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.150063 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2704  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  30.15 
 
 
232 aa  84  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.981557  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2089  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  31.78 
 
 
237 aa  84  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.641654  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>