More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCB4264_A2821 on replicon NC_011725
Organism: Bacillus cereus B4264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A2821  hypothetical DNA-binding protein  100 
 
 
314 aa  642    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.184297  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0777  hypothetical protein  33.44 
 
 
317 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.845326  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4654  hypothetical protein  33.75 
 
 
317 aa  207  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000770885  unclonable  9.19298e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0684  hypothetical protein  33.12 
 
 
317 aa  205  7e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0732899  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0716  hypothetical protein  33.44 
 
 
348 aa  203  4e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.129876  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0562  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  32.81 
 
 
317 aa  203  4e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.349747  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0705  hypothetical protein  32.49 
 
 
317 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0615  hypothetical protein  32.18 
 
 
317 aa  199  6e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.759398  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0648  hypothetical protein  32.18 
 
 
317 aa  199  6e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0266881  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0559  transcriptional regulator  32.18 
 
 
317 aa  199  7e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0560  transcriptional regulator  32.81 
 
 
317 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00184479  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0976  transcriptional regulator  26.65 
 
 
310 aa  120  3.9999999999999996e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4104  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  25.45 
 
 
316 aa  115  6.9999999999999995e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0359  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.16 
 
 
318 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2755  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.88 
 
 
336 aa  102  7e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6729  Helix-turn-helix type 11 domain protein  30.2 
 
 
324 aa  99.4  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.41486 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1185  hypothetical protein  25.71 
 
 
313 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1092  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.78 
 
 
315 aa  96.7  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.206539  normal  0.830453 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3281  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  28.5 
 
 
316 aa  96.7  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.093323  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0788  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  25.24 
 
 
319 aa  95.5  9e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6686  hypothetical protein  25.76 
 
 
327 aa  95.1  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0918823  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1676  putative transcriptional regulator  30.2 
 
 
233 aa  93.6  4e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1613  transcriptional regulator, DeoR family  24.1 
 
 
314 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0282022  hitchhiker  0.0000000647581 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4059  helix-turn-helix, type 11  28.08 
 
 
318 aa  92  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.348793  normal  0.0202879 
 
 
-
 
NC_004310  BR1734  transcriptional regulator, putative  30.2 
 
 
233 aa  92  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.781604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1001  hypothetical protein  26.23 
 
 
313 aa  92  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1180  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  30.2 
 
 
233 aa  91.3  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1244  HTH domain family  25.62 
 
 
313 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3613  transcription regulator-like protein  26.7 
 
 
280 aa  89  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0101765  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0680  DeoR family transcriptional regulator  27.23 
 
 
231 aa  88.2  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0064  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  30.05 
 
 
328 aa  87  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.188997  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0764  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.78 
 
 
298 aa  87.4  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000424784  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1289  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.73 
 
 
315 aa  86.7  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.447111 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3934  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.37 
 
 
321 aa  86.3  7e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0769202  hitchhiker  0.00173443 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3694  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.85 
 
 
321 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0509362  hitchhiker  0.00000175857 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5238  transcriptional regulator  27.83 
 
 
304 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0664508  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2992  helix-turn-helix, type 11  28.21 
 
 
252 aa  85.5  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45460  hypothetical protein  25.49 
 
 
323 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0408  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  28.21 
 
 
233 aa  85.1  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.855844 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1647  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.69 
 
 
299 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0998  transcriptional regulator  25.62 
 
 
313 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0713  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.47 
 
 
319 aa  85.1  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.677583  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0679  helix-turn-helix, type 11  28.57 
 
 
237 aa  84.7  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0147  helix-turn-helix, type 11  26.34 
 
 
316 aa  84.3  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1946  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.7 
 
 
321 aa  84.7  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2944  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  24.92 
 
 
324 aa  84.7  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000786  predicted transcriptional regulator  27.8 
 
 
228 aa  84.7  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0574064  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4645  helix-turn-helix, type 11  24.41 
 
 
333 aa  84  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0418126  normal  0.223314 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2021  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27 
 
 
317 aa  84  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0370713  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2503  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.45 
 
 
232 aa  83.2  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.751243 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2909  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.89 
 
 
232 aa  83.2  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36430  predicted transcriptional regulator  24.32 
 
 
323 aa  83.2  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.649805 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3647  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.55 
 
 
320 aa  82.4  0.000000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.306366  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3428  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.47 
 
 
303 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2673  putative repressor transcription regulator protein  25 
 
 
232 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.94129  normal  0.397505 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1867  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.66 
 
 
232 aa  81.6  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.117205 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0335  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  29.38 
 
 
321 aa  81.3  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.377994  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3859  hypothetical protein  26.47 
 
 
323 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7049  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  28.78 
 
 
233 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.135487  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0510  helix-turn-helix, type 11  28.86 
 
 
230 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0450  HTH domain-containing protein  28.86 
 
 
230 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0456  helix-turn-helix, type 11  28.86 
 
 
230 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1593  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.92 
 
 
237 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.375886 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3142  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.61 
 
 
232 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92923  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0970  transcriptional regulator-like protein  23.22 
 
 
330 aa  80.5  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4041  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.89 
 
 
316 aa  80.5  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2785  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  27.94 
 
 
229 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.899973 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2507  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.98 
 
 
321 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15260  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.31 
 
 
327 aa  80.5  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190404  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7481  transcriptional regulator-like  23.67 
 
 
326 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2786  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.44 
 
 
237 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.987618  normal  0.72002 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1558  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.44 
 
 
237 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1564  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  26.44 
 
 
237 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2689  hypothetical protein  29.19 
 
 
320 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0201589  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1457  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  26.96 
 
 
225 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1644  Helix-turn-helix type 11 domain protein  21.07 
 
 
347 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0304784  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2857  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.04 
 
 
326 aa  79.3  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0404483  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1758  hypothetical protein  26.96 
 
 
230 aa  79.3  0.00000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1191  hypothetical protein  28.92 
 
 
235 aa  79  0.00000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.351784  normal  0.832163 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2401  hypothetical protein  28.64 
 
 
320 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148102  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2673  hypothetical protein  29.19 
 
 
320 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000327581 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3029  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  24.61 
 
 
327 aa  78.6  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189154  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1870  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  25.84 
 
 
337 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.199317 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2538  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  26.47 
 
 
232 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2605  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  26.47 
 
 
232 aa  79  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2704  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  26.47 
 
 
232 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.981557  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2775  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.75 
 
 
229 aa  78.6  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3086  transcriptional regulator, putative  21.36 
 
 
334 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0554  TonB-dependent receptor  24.89 
 
 
234 aa  77.8  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.665291  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3432  helix-turn-helix, type 11  27.72 
 
 
234 aa  77.8  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.587974  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4323  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  27.36 
 
 
327 aa  78.2  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.807083  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0660  transcriptional regulator, putative  26.03 
 
 
301 aa  77.4  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2296  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.69 
 
 
322 aa  77  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000342768  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3039  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.78 
 
 
235 aa  77  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.545561  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2474  hypothetical protein  28.71 
 
 
320 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0188594  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2656  hypothetical protein  28.71 
 
 
320 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0499  hypothetical protein  31.18 
 
 
229 aa  76.6  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.477682  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0988  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  22.97 
 
 
317 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2541  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  25.85 
 
 
228 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0960  helix-turn-helix, type 11  24.4 
 
 
317 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.386939  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>