99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3925 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_3925  transcriptional regulator-like  100 
 
 		 345 aa  668    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.836948  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4065  transcriptional regulator protein-like protein  92.46 
 
 		 511 aa  617  1e-176  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4033  transcriptional regulator protein-like protein  92.17 
 
 		 511 aa  588  1e-167  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.559835  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4015  transcriptional regulator protein-like protein  65.8 
 
 		 512 aa  431  1e-120  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0623  DeoR family transcriptional regulator  38.63 
 
 		 335 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0615  putative DeoR-family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 334 aa  142  7e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0607  putative DeoR-family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 334 aa  142  9e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0580  DeoR family transcriptional regulator  35.31 
 
 		 334 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5753  putative DeoR-family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 369 aa  98.2  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5754  hypothetical protein  31.62 
 
 		 351 aa  86.7  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5862  transcriptional regulator protein-like protein  34.04 
 
 		 318 aa  83.2  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12131  hypothetical protein  30.28 
 
 		 332 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000529286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1783  transcriptional regulator protein-like protein  28.84 
 
 		 337 aa  76.6  0.0000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  unclonable  0.000000000261192  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3444  hypothetical protein  29.18 
 
 		 335 aa  76.3  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3091  hypothetical protein  29.23 
 
 		 359 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.727496  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1924  transcriptional regulator-like protein  32.59 
 
 		 663 aa  74.7  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000155311 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1826  transcriptional regulator protein-like protein  31.74 
 
 		 313 aa  73.9  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4456  transcriptional regulator,-like protein  29.93 
 
 		 335 aa  72.8  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.427678  normal  0.167477 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18560  predicted transcriptional regulator  28.19 
 
 		 361 aa  72.8  0.000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.0049611  normal  0.0116825 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2650  transcriptional regulator-like  31.85 
 
 		 323 aa  72.4  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.535773  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2316  DeoR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 331 aa  71.6  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000471902  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5785  transcriptional regulator protein-like protein  28.26 
 
 		 687 aa  70.9  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13990  predicted transcriptional regulator  31.7 
 
 		 348 aa  69.7  0.00000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0412748  normal  0.158003 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2181  transcriptional regulator-like protein  32.29 
 
 		 663 aa  69.3  0.00000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117971  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1879  transcriptional regulator-like  33.61 
 
 		 352 aa  67.8  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2610  transcriptional regulator-like  30.32 
 
 		 361 aa  67.8  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000080301  normal  0.16283 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1866  transcriptional regulator protein-like protein  31.6 
 
 		 354 aa  67.8  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00621522  normal  0.291628 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0970  transcriptional regulator-like protein  25.52 
 
 		 330 aa  67.4  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1501  transcriptional regulator  29.69 
 
 		 683 aa  67  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.634725  decreased coverage  0.0000677289 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2021  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.46 
 
 		 317 aa  66.6  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0370713  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2472  hypothetical protein  28.7 
 
 		 326 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2517  hypothetical protein  28.7 
 
 		 326 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2509  hypothetical protein  28.7 
 
 		 326 aa  63.2  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.308334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0956  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25 
 
 		 327 aa  62.8  0.000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2154  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.06 
 
 		 324 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0841  hypothetical protein  25.39 
 
 		 351 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.189594 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1200  transcriptional regulator-like  29.25 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.386828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0494  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  24.25 
 
 		 336 aa  60.5  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1294  regulatory protein, DeoR  24.91 
 
 		 336 aa  60.5  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2434  hypothetical protein  27.83 
 
 		 361 aa  58.9  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2367  hypothetical protein  28.22 
 
 		 330 aa  58.9  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1438  hypothetical protein  23.76 
 
 		 337 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2959  transcriptional regulator protein-like protein  28.4 
 
 		 364 aa  58.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000346913  hitchhiker  0.00472926 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3086  transcriptional regulator, putative  25.93 
 
 		 334 aa  57.8  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1421  hypothetical protein  23.48 
 
 		 324 aa  57.8  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.182129 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2249  putative transcriptional regulator protein  32.88 
 
 		 327 aa  57.4  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21980  predicted transcriptional regulator  33.03 
 
 		 327 aa  57.4  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.143715  normal  0.382871 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0713  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  24.56 
 
 		 319 aa  57  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.677583  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2167  hypothetical protein  28.09 
 
 		 325 aa  57  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.175858  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2057  transcriptional regulator-like protein  29.52 
 
 		 320 aa  56.6  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.090135  normal  0.188447 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2466  transcriptional regulator protein-like protein  27.54 
 
 		 331 aa  56.6  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0245457  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2241  transcriptional regulator-like protein  24.15 
 
 		 350 aa  56.6  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295044  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4104  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.26 
 
 		 316 aa  55.8  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0437  hypothetical protein  22.41 
 
 		 326 aa  55.5  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2004  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.19 
 
 		 321 aa  53.1  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.532666  normal  0.656208 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1287  putative transcriptional regulator protein  28.32 
 
 		 334 aa  53.1  0.000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.271739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15260  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.9 
 
 		 327 aa  53.1  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190404  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4034  transcriptional regulator-like protein  28.76 
 
 		 322 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0063  hypothetical protein  24.24 
 
 		 339 aa  52.4  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516278  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4066  transcriptional regulator-like protein  29.2 
 
 		 322 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.652063  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0473  transcriptional regulator, putative  24.71 
 
 		 334 aa  51.6  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0815  Helix-turn-helix type 11 domain protein  20.24 
 
 		 312 aa  50.8  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.502142  hitchhiker  0.0000272273 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2755  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.86 
 
 		 336 aa  50.4  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3403  transcriptional regulator-like protein  26.2 
 
 		 323 aa  49.7  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0101274  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1289  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.05 
 
 		 315 aa  49.7  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.447111 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1771  transcriptional regulator  33.66 
 
 		 675 aa  49.3  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.193993  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1644  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.82 
 
 		 347 aa  48.9  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0304784  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0955  transcriptional regulator  22.56 
 
 		 323 aa  48.9  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0131189  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2673  hypothetical protein  34.88 
 
 		 698 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.749079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0172  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  30.89 
 
 		 242 aa  48.9  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.657073  normal  0.98017 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45460  hypothetical protein  28.32 
 
 		 323 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3146  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.41 
 
 		 351 aa  48.5  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7049  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  29.78 
 
 		 233 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.135487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3009  transcriptional regulator-like protein  34.71 
 
 		 695 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0558706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0247  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  31.69 
 
 		 227 aa  47.8  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2249  hypothetical protein  29.84 
 
 		 330 aa  47.8  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00588148  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1001  hypothetical protein  19.43 
 
 		 313 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1244  HTH domain family  19.43 
 
 		 313 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3859  hypothetical protein  27.3 
 
 		 323 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0359  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.69 
 
 		 318 aa  47.4  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0190  Helix-turn-helix type 11 domain protein  30.89 
 
 		 242 aa  47.4  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1823  Helix-turn-helix type 11 domain protein  30.27 
 
 		 237 aa  46.6  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406304  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2985  transcriptional regulator protein-like protein  23.99 
 
 		 342 aa  46.6  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.256195 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0382  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.19 
 
 		 333 aa  45.8  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.117118  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1946  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  28.4 
 
 		 321 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4872  hypothetical protein  26.14 
 
 		 401 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2698  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  26.51 
 
 		 323 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000125555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0944  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  22.39 
 
 		 330 aa  46.2  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.001663  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0998  transcriptional regulator  20.23 
 
 		 313 aa  46.2  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0147  helix-turn-helix, type 11  29.73 
 
 		 316 aa  45.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1867  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.87 
 
 		 232 aa  44.7  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.117205 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3075  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.89 
 
 		 326 aa  43.9  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00643592  unclonable  0.0000000271212 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2010  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  25.49 
 
 		 320 aa  43.9  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3926  transcriptional regulator-like  26.67 
 
 		 323 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.816323  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1515  hypothetical protein  21.66 
 
 		 349 aa  43.5  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.284607  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3385  CRISPR-associated protein Cas5  27.39 
 
 		 1084 aa  43.5  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.335684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4846  transcriptional regulator protein-like protein  27.59 
 
 		 326 aa  42.7  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.715011 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0552  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.31 
 
 		 347 aa  42.7  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2250  hypothetical protein  27.11 
 
 		 337 aa  42.7  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0118565  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>