219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_2509 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2472  hypothetical protein  99.69 
 
 
326 aa  642    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2517  hypothetical protein  99.69 
 
 
326 aa  642    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2509  hypothetical protein  100 
 
 
326 aa  645    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.308334  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3444  hypothetical protein  77.23 
 
 
335 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3091  hypothetical protein  74.46 
 
 
359 aa  476  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.727496  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12131  hypothetical protein  70.91 
 
 
332 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000529286  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2249  putative transcriptional regulator protein  54.06 
 
 
327 aa  315  6e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2466  transcriptional regulator protein-like protein  54.15 
 
 
331 aa  301  1e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0245457  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21980  predicted transcriptional regulator  52.53 
 
 
327 aa  288  1e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.143715  normal  0.382871 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2167  hypothetical protein  48.92 
 
 
325 aa  263  3e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.175858  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5862  transcriptional regulator protein-like protein  46.01 
 
 
318 aa  238  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167693  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1826  transcriptional regulator protein-like protein  47.87 
 
 
313 aa  231  1e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2686  hypothetical protein  47.06 
 
 
327 aa  231  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2367  hypothetical protein  44.68 
 
 
330 aa  228  9e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2249  hypothetical protein  46.32 
 
 
330 aa  224  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00588148  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1879  transcriptional regulator-like  44.55 
 
 
352 aa  223  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1501  transcriptional regulator  43.03 
 
 
683 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.634725  decreased coverage  0.0000677289 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4456  transcriptional regulator,-like protein  42.59 
 
 
335 aa  216  4e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.427678  normal  0.167477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2434  hypothetical protein  39.76 
 
 
361 aa  211  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2316  DeoR family transcriptional regulator  40.99 
 
 
331 aa  211  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000471902  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2959  transcriptional regulator protein-like protein  41.57 
 
 
364 aa  205  9e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000346913  hitchhiker  0.00472926 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1200  transcriptional regulator-like  42.94 
 
 
315 aa  204  2e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.386828  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2610  transcriptional regulator-like  42.06 
 
 
361 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000080301  normal  0.16283 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1783  transcriptional regulator protein-like protein  41.74 
 
 
337 aa  199  7e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  unclonable  0.000000000261192  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2650  transcriptional regulator-like  42.2 
 
 
323 aa  196  5.000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.535773  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1771  transcriptional regulator  41.9 
 
 
675 aa  193  3e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.193993  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18560  predicted transcriptional regulator  37.84 
 
 
361 aa  193  3e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.0049611  normal  0.0116825 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13990  predicted transcriptional regulator  41.38 
 
 
348 aa  190  4e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0412748  normal  0.158003 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1866  transcriptional regulator protein-like protein  37.91 
 
 
354 aa  185  8e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00621522  normal  0.291628 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4872  hypothetical protein  41 
 
 
401 aa  176  5e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1287  putative transcriptional regulator protein  35.38 
 
 
334 aa  162  6e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.271739  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2057  transcriptional regulator-like protein  40.25 
 
 
320 aa  162  8.000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.090135  normal  0.188447 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1924  transcriptional regulator-like protein  38.58 
 
 
663 aa  150  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000155311 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2181  transcriptional regulator-like protein  34.63 
 
 
663 aa  129  8.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117971  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16040  predicted transcriptional regulator  35.32 
 
 
664 aa  102  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5785  transcriptional regulator protein-like protein  28.01 
 
 
687 aa  89.4  8e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11950  predicted transcriptional regulator  35.09 
 
 
699 aa  83.6  0.000000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.308253  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3412  Helix-turn-helix type 11 domain protein  32.4 
 
 
324 aa  76.3  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380317  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4015  transcriptional regulator protein-like protein  25.23 
 
 
512 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0988  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  34.53 
 
 
317 aa  73.2  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0680  DeoR family transcriptional regulator  27.73 
 
 
231 aa  72  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0960  helix-turn-helix, type 11  32.58 
 
 
317 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.386939  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0978  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  32.58 
 
 
317 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.318116  normal  0.0703128 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4104  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  31.1 
 
 
316 aa  67.4  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4033  transcriptional regulator protein-like protein  29.05 
 
 
511 aa  67  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.559835  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4065  transcriptional regulator protein-like protein  29.04 
 
 
511 aa  67  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5753  putative DeoR-family transcriptional regulator  24.71 
 
 
369 aa  66.6  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1446  putative transcriptional regulator  30.07 
 
 
332 aa  65.9  0.0000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00684408  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3925  transcriptional regulator-like  28.08 
 
 
345 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.836948  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0970  transcriptional regulator-like protein  26.89 
 
 
330 aa  64.3  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6203  DeoR family transcriptional regulator  30.37 
 
 
318 aa  63.9  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5106  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  31.65 
 
 
319 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.505458  normal  0.201643 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5326  DeoR family transcriptional regulator  32.79 
 
 
318 aa  63.5  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  0.563326 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0672  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  30.14 
 
 
228 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664641  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4549  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.67 
 
 
327 aa  62.8  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3146  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.62 
 
 
351 aa  62  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2241  transcriptional regulator-like protein  23.17 
 
 
350 aa  62.4  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295044  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1870  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  33.03 
 
 
337 aa  62  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.199317 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1185  hypothetical protein  24.89 
 
 
313 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4059  helix-turn-helix, type 11  32.8 
 
 
318 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.348793  normal  0.0202879 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3791  transcriptional regulator-like  29.41 
 
 
228 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.55139  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0596  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  30.14 
 
 
228 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0621  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  30.14 
 
 
228 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.296179  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2755  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.63 
 
 
336 aa  60.5  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0221  helix-turn-helix, type 11  29.68 
 
 
228 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0705  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  29.68 
 
 
228 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.179711  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1001  hypothetical protein  25.74 
 
 
313 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4645  helix-turn-helix, type 11  31.55 
 
 
333 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0418126  normal  0.223314 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0615  putative DeoR-family transcriptional regulator  29.59 
 
 
334 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0284  Helix-turn-helix type 11 domain protein  33.15 
 
 
332 aa  58.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.527195 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0607  putative DeoR-family transcriptional regulator  28.76 
 
 
334 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0623  DeoR family transcriptional regulator  30.46 
 
 
335 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0998  transcriptional regulator  24.75 
 
 
313 aa  58.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3403  transcriptional regulator-like protein  25.4 
 
 
323 aa  58.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0101274  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1808  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  25.98 
 
 
327 aa  57.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.503322  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7049  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  32.35 
 
 
233 aa  57.4  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.135487  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0094  Helix-turn-helix type 11 domain protein  34.01 
 
 
325 aa  57  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1244  HTH domain family  24.27 
 
 
313 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0063  hypothetical protein  21.79 
 
 
339 aa  56.6  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516278  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2004  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  29.15 
 
 
321 aa  57  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.532666  normal  0.656208 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3107  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.52 
 
 
324 aa  56.6  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.786544  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0815  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.22 
 
 
312 aa  56.2  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.502142  hitchhiker  0.0000272273 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2098  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.63 
 
 
318 aa  56.2  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1946  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.8 
 
 
321 aa  56.2  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2857  Helix-turn-helix type 11 domain protein  32.56 
 
 
326 aa  55.8  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0404483  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3867  Helix-turn-helix type 11 domain protein  31.94 
 
 
335 aa  55.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02350  predicted transcriptional regulator  29.31 
 
 
327 aa  55.8  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2021  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.21 
 
 
317 aa  55.8  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0370713  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4172  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.47 
 
 
317 aa  55.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.917159  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2539  transcriptional regulator protein-like protein  38.28 
 
 
163 aa  55.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1644  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.15 
 
 
347 aa  55.5  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0304784  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0920  Helix-turn-helix type 11 domain protein  33.33 
 
 
327 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.711136  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2687  transcriptional regulator-like protein  35.06 
 
 
331 aa  55.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0977  DeoR family transcriptional regulator  32.09 
 
 
360 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.226699  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1347  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  28.47 
 
 
339 aa  55.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.469049  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0788  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  23.41 
 
 
319 aa  55.1  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2698  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  27.12 
 
 
323 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000125555  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5754  hypothetical protein  31.1 
 
 
351 aa  54.7  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0713  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  28.12 
 
 
319 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.677583  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4323  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  31.38 
 
 
327 aa  54.3  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.807083  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>