265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_13990 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_13990  predicted transcriptional regulator  100 
 
 		 348 aa  682    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0412748  normal  0.158003 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1879  transcriptional regulator-like  47.2 
 
 		 352 aa  237  2e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2316  DeoR family transcriptional regulator  43.44 
 
 		 331 aa  217  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000471902  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5862  transcriptional regulator protein-like protein  42.45 
 
 		 318 aa  209  6e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2367  hypothetical protein  42.99 
 
 		 330 aa  206  4e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2249  hypothetical protein  44.24 
 
 		 330 aa  205  9e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00588148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2472  hypothetical protein  41.38 
 
 		 326 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2517  hypothetical protein  41.38 
 
 		 326 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2509  hypothetical protein  41.38 
 
 		 326 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.308334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2686  hypothetical protein  44.52 
 
 		 327 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2434  hypothetical protein  40.25 
 
 		 361 aa  199  5e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1200  transcriptional regulator-like  42.99 
 
 		 315 aa  196  7e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.386828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3444  hypothetical protein  40.55 
 
 		 335 aa  193  4e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4456  transcriptional regulator,-like protein  40.37 
 
 		 335 aa  192  5e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.427678  normal  0.167477 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2650  transcriptional regulator-like  43.03 
 
 		 323 aa  192  5e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.535773  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12131  hypothetical protein  38.34 
 
 		 332 aa  187  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000529286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3091  hypothetical protein  40.31 
 
 		 359 aa  187  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.727496  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1826  transcriptional regulator protein-like protein  41.59 
 
 		 313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2610  transcriptional regulator-like  38.53 
 
 		 361 aa  180  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000080301  normal  0.16283 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2249  putative transcriptional regulator protein  39.94 
 
 		 327 aa  179  4.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18560  predicted transcriptional regulator  38.65 
 
 		 361 aa  179  4.999999999999999e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.0049611  normal  0.0116825 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1783  transcriptional regulator protein-like protein  39.38 
 
 		 337 aa  178  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  unclonable  0.000000000261192  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21980  predicted transcriptional regulator  39.46 
 
 		 327 aa  175  9.999999999999999e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.143715  normal  0.382871 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1501  transcriptional regulator  41.4 
 
 		 683 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.634725  decreased coverage  0.0000677289 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1287  putative transcriptional regulator protein  37.89 
 
 		 334 aa  172  1e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.271739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2466  transcriptional regulator protein-like protein  39.26 
 
 		 331 aa  168  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0245457  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2959  transcriptional regulator protein-like protein  37.76 
 
 		 364 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000346913  hitchhiker  0.00472926 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2057  transcriptional regulator-like protein  38.66 
 
 		 320 aa  162  6e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.090135  normal  0.188447 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2167  hypothetical protein  37.46 
 
 		 325 aa  156  6e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.175858  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1771  transcriptional regulator  39.63 
 
 		 675 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.193993  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4872  hypothetical protein  39.39 
 
 		 401 aa  153  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1866  transcriptional regulator protein-like protein  40.23 
 
 		 354 aa  145  8.000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00621522  normal  0.291628 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1924  transcriptional regulator-like protein  38.17 
 
 		 663 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000155311 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2181  transcriptional regulator-like protein  36.04 
 
 		 663 aa  117  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117971  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5785  transcriptional regulator protein-like protein  31.91 
 
 		 687 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16040  predicted transcriptional regulator  37.85 
 
 		 664 aa  100  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11950  predicted transcriptional regulator  36.88 
 
 		 699 aa  93.2  6e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.308253  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4033  transcriptional regulator protein-like protein  34.86 
 
 		 511 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.559835  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4065  transcriptional regulator protein-like protein  33.61 
 
 		 511 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0672  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  36.99 
 
 		 228 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5753  putative DeoR-family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 369 aa  78.2  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0596  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  36.99 
 
 		 228 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0621  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  36.99 
 
 		 228 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.296179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0221  helix-turn-helix, type 11  36.42 
 
 		 228 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0705  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  36.42 
 
 		 228 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.179711  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17920  predicted transcriptional regulator  31.71 
 
 		 238 aa  76.6  0.0000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.384504 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3791  transcriptional regulator-like  35.84 
 
 		 228 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.55139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5244  DeoR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 337 aa  73.6  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.288323 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0679  helix-turn-helix, type 11  33.7 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0991  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  25.47 
 
 		 302 aa  72  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3925  transcriptional regulator-like  32.48 
 
 		 345 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.836948  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0615  putative DeoR-family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 334 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4059  helix-turn-helix, type 11  30.04 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.348793  normal  0.0202879 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0607  putative DeoR-family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 334 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000786  predicted transcriptional regulator  29.91 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0574064  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1946  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.91 
 
 		 321 aa  67  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0623  DeoR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 335 aa  67  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2296  Helix-turn-helix type 11 domain protein  19.94 
 
 		 322 aa  65.9  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000342768  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1593  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  30.28 
 
 		 237 aa  65.5  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.375886 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0580  DeoR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 334 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1558  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  29.82 
 
 		 237 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2786  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.82 
 
 		 237 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.987618  normal  0.72002 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1564  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  29.82 
 
 		 237 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3135  Helix-turn-helix type 11 domain protein  34.67 
 
 		 329 aa  64.3  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.224168  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2539  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  39.73 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3400  hypothetical protein  29.63 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3867  Helix-turn-helix type 11 domain protein  35.48 
 
 		 335 aa  63.9  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02350  predicted transcriptional regulator  31.75 
 
 		 327 aa  63.5  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1734  transcriptional regulator, putative  30.9 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.781604  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2874  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.85 
 
 		 322 aa  62.8  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1676  putative transcriptional regulator  30.9 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0249  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  28.45 
 
 		 324 aa  62.8  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1180  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  30.9 
 
 		 233 aa  62.4  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2679  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  36.36 
 
 		 228 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0094  Helix-turn-helix type 11 domain protein  34.18 
 
 		 325 aa  61.6  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4041  Helix-turn-helix type 11 domain protein  31.89 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0063  hypothetical protein  23.85 
 
 		 339 aa  61.6  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516278  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0977  DeoR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 360 aa  61.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.226699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2538  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  28.44 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2704  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  28.12 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.981557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3646  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.27 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000392325  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4738  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  32.39 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.947562  normal  0.956989 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1758  hypothetical protein  29.3 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1998  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.32 
 
 		 334 aa  60.5  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.556593 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1457  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  28.89 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2368  helix-turn-helix, type 11  34.25 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.150063 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0660  transcriptional regulator, putative  28.32 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3107  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.43 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.786544  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2605  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  27.98 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0463  Helix-turn-helix type 11 domain protein  33.66 
 
 		 334 aa  60.1  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.104964  normal  0.0170301 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0456  helix-turn-helix, type 11  29.21 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0450  HTH domain-containing protein  29.21 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1185  hypothetical protein  30.49 
 
 		 313 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5238  transcriptional regulator  25.45 
 
 		 304 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0664508  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0510  helix-turn-helix, type 11  29.21 
 
 		 230 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1363  YobV  26.51 
 
 		 311 aa  58.9  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.396054  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4305  Helix-turn-helix type 11 domain protein  33.79 
 
 		 233 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1047  DeoR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 322 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0554838 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45460  hypothetical protein  31.3 
 
 		 323 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4015  transcriptional regulator protein-like protein  28.84 
 
 		 512 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>