269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1826 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1826  transcriptional regulator protein-like protein  100 
 
 		 313 aa  617  1e-176  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5862  transcriptional regulator protein-like protein  73.5 
 
 		 318 aa  456  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2316  DeoR family transcriptional regulator  60.95 
 
 		 331 aa  332  4e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000471902  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2367  hypothetical protein  54.09 
 
 		 330 aa  277  2e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2249  putative transcriptional regulator protein  52.48 
 
 		 327 aa  273  2.0000000000000002e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1501  transcriptional regulator  51.58 
 
 		 683 aa  273  3e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.634725  decreased coverage  0.0000677289 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1879  transcriptional regulator-like  53.67 
 
 		 352 aa  260  2e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2249  hypothetical protein  53.77 
 
 		 330 aa  258  8e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00588148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2686  hypothetical protein  50.68 
 
 		 327 aa  258  9e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2610  transcriptional regulator-like  48.46 
 
 		 361 aa  253  4.0000000000000004e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000080301  normal  0.16283 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1200  transcriptional regulator-like  49.52 
 
 		 315 aa  252  5.000000000000001e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.386828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12131  hypothetical protein  45.76 
 
 		 332 aa  239  5e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000529286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2434  hypothetical protein  44.55 
 
 		 361 aa  238  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4456  transcriptional regulator,-like protein  46.13 
 
 		 335 aa  237  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.427678  normal  0.167477 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2472  hypothetical protein  47.87 
 
 		 326 aa  236  3e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2517  hypothetical protein  47.87 
 
 		 326 aa  236  3e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2509  hypothetical protein  47.87 
 
 		 326 aa  236  3e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.308334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1771  transcriptional regulator  49.68 
 
 		 675 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.193993  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21980  predicted transcriptional regulator  50.47 
 
 		 327 aa  234  1.0000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.143715  normal  0.382871 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3444  hypothetical protein  45.02 
 
 		 335 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18560  predicted transcriptional regulator  44.1 
 
 		 361 aa  233  3e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.0049611  normal  0.0116825 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3091  hypothetical protein  45.12 
 
 		 359 aa  225  7e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.727496  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4872  hypothetical protein  48.2 
 
 		 401 aa  215  5.9999999999999996e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1783  transcriptional regulator protein-like protein  44.65 
 
 		 337 aa  214  9.999999999999999e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  unclonable  0.000000000261192  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2466  transcriptional regulator protein-like protein  42.28 
 
 		 331 aa  208  1e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0245457  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2959  transcriptional regulator protein-like protein  42.39 
 
 		 364 aa  199  6e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000346913  hitchhiker  0.00472926 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1866  transcriptional regulator protein-like protein  42.68 
 
 		 354 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00621522  normal  0.291628 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2650  transcriptional regulator-like  40.68 
 
 		 323 aa  193  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.535773  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2167  hypothetical protein  40.75 
 
 		 325 aa  184  1.0000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.175858  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13990  predicted transcriptional regulator  41.59 
 
 		 348 aa  180  2.9999999999999997e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0412748  normal  0.158003 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2057  transcriptional regulator-like protein  41.67 
 
 		 320 aa  179  4e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.090135  normal  0.188447 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1287  putative transcriptional regulator protein  38.99 
 
 		 334 aa  179  7e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.271739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1924  transcriptional regulator-like protein  40.8 
 
 		 663 aa  173  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000155311 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2181  transcriptional regulator-like protein  40.25 
 
 		 663 aa  169  5e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117971  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5785  transcriptional regulator protein-like protein  30.12 
 
 		 687 aa  102  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5753  putative DeoR-family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 369 aa  100  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16040  predicted transcriptional regulator  39.3 
 
 		 664 aa  91.3  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5754  hypothetical protein  33.06 
 
 		 351 aa  78.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2755  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.66 
 
 		 336 aa  77  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4065  transcriptional regulator protein-like protein  31.93 
 
 		 511 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4033  transcriptional regulator protein-like protein  31.93 
 
 		 511 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.559835  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3925  transcriptional regulator-like  31.88 
 
 		 345 aa  76.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.836948  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4059  helix-turn-helix, type 11  32.08 
 
 		 318 aa  75.1  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.348793  normal  0.0202879 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5106  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  30.94 
 
 		 319 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.505458  normal  0.201643 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0988  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  28.71 
 
 		 317 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1247  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  29.64 
 
 		 317 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161645 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11950  predicted transcriptional regulator  33.98 
 
 		 699 aa  72.8  0.000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.308253  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4015  transcriptional regulator protein-like protein  30.38 
 
 		 512 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0623  DeoR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 335 aa  70.1  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0335  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  25.84 
 
 		 321 aa  69.3  0.00000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.377994  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2683  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.05 
 
 		 324 aa  68.6  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.255194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0960  helix-turn-helix, type 11  28.62 
 
 		 317 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.386939  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0978  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  28.62 
 
 		 317 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.318116  normal  0.0703128 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0607  putative DeoR-family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 334 aa  66.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0815  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.61 
 
 		 312 aa  66.6  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.502142  hitchhiker  0.0000272273 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6729  Helix-turn-helix type 11 domain protein  32.74 
 
 		 324 aa  66.6  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.41486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4645  helix-turn-helix, type 11  33.33 
 
 		 333 aa  66.2  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0418126  normal  0.223314 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3086  transcriptional regulator, putative  26.56 
 
 		 334 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4546  DeoR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 314 aa  66.6  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.86893  normal  0.117628 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0615  putative DeoR-family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 334 aa  66.2  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2780  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.08 
 
 		 333 aa  66.2  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00079876  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3867  Helix-turn-helix type 11 domain protein  32.2 
 
 		 335 aa  65.9  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0970  transcriptional regulator-like protein  29.39 
 
 		 330 aa  65.9  0.0000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0680  DeoR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4104  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  28.12 
 
 		 316 aa  65.9  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0580  DeoR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 334 aa  65.9  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0044  Helix-turn-helix type 11 domain protein  30.65 
 
 		 318 aa  65.9  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.164988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0063  hypothetical protein  27.87 
 
 		 339 aa  65.9  0.0000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516278  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1092  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.09 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.206539  normal  0.830453 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2609  hypothetical protein  32.89 
 
 		 325 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000144716  normal  0.0873123 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2166  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.38 
 
 		 320 aa  65.1  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.304825  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2004  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  30.77 
 
 		 321 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.532666  normal  0.656208 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1870  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  31.28 
 
 		 337 aa  64.3  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.199317 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2698  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  31.28 
 
 		 323 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000125555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2241  transcriptional regulator-like protein  23.3 
 
 		 350 aa  63.2  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295044  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1347  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  28.52 
 
 		 339 aa  63.2  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.469049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1644  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.9 
 
 		 347 aa  62.4  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0304784  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1441  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.41 
 
 		 333 aa  62  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0624  transcriptional regulator-like protein  32.94 
 
 		 368 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2857  Helix-turn-helix type 11 domain protein  34.22 
 
 		 326 aa  61.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0404483  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4041  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.08 
 
 		 316 aa  61.2  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2492  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.17 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156303  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3412  Helix-turn-helix type 11 domain protein  32.3 
 
 		 324 aa  61.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6203  DeoR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 318 aa  60.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0977  DeoR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 360 aa  60.5  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.226699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0920  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.34 
 
 		 327 aa  60.1  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.711136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0094  Helix-turn-helix type 11 domain protein  34.02 
 
 		 325 aa  60.1  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0998  transcriptional regulator  25.08 
 
 		 313 aa  59.7  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4738  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  28.67 
 
 		 313 aa  59.7  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.947562  normal  0.956989 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1185  hypothetical protein  24.63 
 
 		 313 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5326  DeoR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  0.563326 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0583  hypothetical protein  33.5 
 
 		 598 aa  59.3  0.00000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.692226  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0713  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  29.89 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.677583  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3763  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.27 
 
 		 323 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1785  transcriptional regulator-like protein  26.07 
 
 		 332 aa  58.9  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00220664  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2021  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.82 
 
 		 317 aa  58.5  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0370713  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0616  transcriptional regulator-like protein  33.13 
 
 		 369 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501695  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0581  transcriptional regulator-like  32.34 
 
 		 367 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1808  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  29.35 
 
 		 327 aa  57.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.503322  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2626  helix-turn-helix, type 11  30.94 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.182787  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>