34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0583 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0583  hypothetical protein  100 
 
 		 598 aa  1133    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.692226  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2181  transcriptional regulator-like protein  27 
 
 		 663 aa  97.4  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117971  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1924  transcriptional regulator-like protein  27.76 
 
 		 663 aa  96.3  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000155311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5862  transcriptional regulator protein-like protein  32.21 
 
 		 318 aa  66.6  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167693  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1826  transcriptional regulator protein-like protein  32.86 
 
 		 313 aa  63.9  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2316  DeoR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 331 aa  63.5  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000471902  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2434  hypothetical protein  30.37 
 
 		 361 aa  63.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1866  transcriptional regulator protein-like protein  30.39 
 
 		 354 aa  57.4  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00621522  normal  0.291628 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2167  hypothetical protein  27.44 
 
 		 325 aa  55.1  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.175858  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2472  hypothetical protein  28.69 
 
 		 326 aa  54.3  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2509  hypothetical protein  28.69 
 
 		 326 aa  54.3  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.308334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2517  hypothetical protein  28.69 
 
 		 326 aa  54.3  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1501  transcriptional regulator  27.66 
 
 		 683 aa  53.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.634725  decreased coverage  0.0000677289 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2687  transcriptional regulator-like protein  26.87 
 
 		 331 aa  53.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1783  transcriptional regulator protein-like protein  31.02 
 
 		 337 aa  53.5  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  unclonable  0.000000000261192  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2249  putative transcriptional regulator protein  33.17 
 
 		 327 aa  52.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1287  putative transcriptional regulator protein  28.06 
 
 		 334 aa  52  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.271739  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2057  transcriptional regulator-like protein  30.37 
 
 		 320 aa  51.6  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.090135  normal  0.188447 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18550  predicted transcriptional regulator  28.64 
 
 		 341 aa  49.3  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110092  normal  0.0353921 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18560  predicted transcriptional regulator  28.1 
 
 		 361 aa  49.3  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.0049611  normal  0.0116825 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3444  hypothetical protein  29.91 
 
 		 335 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1288  hypothetical protein  30.05 
 
 		 327 aa  48.9  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1771  transcriptional regulator  29.18 
 
 		 675 aa  48.1  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.193993  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2651  hypothetical protein  29.48 
 
 		 330 aa  47.8  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.514708  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2686  hypothetical protein  31.6 
 
 		 327 aa  47.8  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3091  hypothetical protein  30.28 
 
 		 359 aa  46.6  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.727496  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4456  transcriptional regulator,-like protein  29.13 
 
 		 335 aa  46.6  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.427678  normal  0.167477 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1201  hypothetical protein  26.9 
 
 		 329 aa  46.6  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.334695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1977  transcriptional regulator protein-like  26.67 
 
 		 325 aa  45.4  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4455  hypothetical protein  28.36 
 
 		 317 aa  44.7  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.495976  normal  0.176655 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2368  hypothetical protein  25.95 
 
 		 340 aa  44.7  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1200  transcriptional regulator-like  30.5 
 
 		 315 aa  44.3  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.386828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2467  transcriptional regulator protein-like protein  30.85 
 
 		 326 aa  44.3  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0469709  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2250  hypothetical protein  26.32 
 
 		 337 aa  44.3  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0118565  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>