234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2368 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2368  hypothetical protein  100 
 
 		 340 aa  657    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2250  hypothetical protein  92.23 
 
 		 337 aa  562  1.0000000000000001e-159  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0118565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4455  hypothetical protein  56.19 
 
 		 317 aa  327  2.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.495976  normal  0.176655 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2250  putative transcriptional regulator protein  54.63 
 
 		 321 aa  312  4.999999999999999e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2687  transcriptional regulator-like protein  55.06 
 
 		 331 aa  295  7e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21970  predicted transcriptional regulator  52.87 
 
 		 326 aa  290  2e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.530492  normal  0.375543 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1201  hypothetical protein  50.16 
 
 		 329 aa  265  8.999999999999999e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.334695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2609  hypothetical protein  48.12 
 
 		 325 aa  260  2e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000144716  normal  0.0873123 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5861  hypothetical protein  47.3 
 
 		 318 aa  260  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3443  transcriptional regulator-like protein  47.92 
 
 		 331 aa  259  6e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2510  transcriptional regulator-like protein  49.06 
 
 		 325 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.440747  normal  0.721122 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2317  transcriptional regulator-like protein  48.26 
 
 		 327 aa  257  2e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000143606  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2473  transcriptional regulator-like protein  49.06 
 
 		 325 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2518  transcriptional regulator-like protein  49.06 
 
 		 325 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3092  transcriptional regulator-like protein  48.56 
 
 		 328 aa  250  2e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.295578  normal  0.213314 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4871  hypothetical protein  47.32 
 
 		 321 aa  250  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0785474  normal  0.13747 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1825  hypothetical protein  46.8 
 
 		 319 aa  243  3e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1880  hypothetical protein  43.21 
 
 		 344 aa  236  3e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12130  hypothetical protein  48.53 
 
 		 316 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0209407  normal  0.896855 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2435  hypothetical protein  46.03 
 
 		 323 aa  227  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2467  transcriptional regulator protein-like protein  40.74 
 
 		 326 aa  223  4e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0469709  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1771  transcriptional regulator  42.3 
 
 		 675 aa  202  8e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.193993  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2958  hypothetical protein  43.49 
 
 		 326 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000014666  hitchhiker  0.00431859 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2168  hypothetical protein  43.17 
 
 		 324 aa  186  5e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0937011  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14000  predicted transcriptional regulator  38.27 
 
 		 343 aa  185  1.0000000000000001e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0168164  normal  0.101985 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2058  hypothetical protein  41.76 
 
 		 336 aa  176  6e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal  0.181699 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2651  hypothetical protein  39.94 
 
 		 330 aa  176  7e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.514708  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1501  transcriptional regulator  39.6 
 
 		 683 aa  169  7e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.634725  decreased coverage  0.0000677289 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2181  transcriptional regulator-like protein  34.89 
 
 		 663 aa  164  3e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117971  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1924  transcriptional regulator-like protein  35.26 
 
 		 663 aa  163  3e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000155311 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18550  predicted transcriptional regulator  37.05 
 
 		 341 aa  150  3e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110092  normal  0.0353921 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1782  transcriptional regulator protein-like protein  40.33 
 
 		 334 aa  139  4.999999999999999e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00000339637  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1867  transcriptional regulator protein-like protein  37.46 
 
 		 328 aa  124  3e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0502476  normal  0.18034 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1288  hypothetical protein  31.01 
 
 		 327 aa  115  7.999999999999999e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5828  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11950  predicted transcriptional regulator  34.01 
 
 		 699 aa  106  6e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.308253  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0624  transcriptional regulator-like protein  29.77 
 
 		 368 aa  89.4  9e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2367  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.58 
 
 		 313 aa  81.3  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.440872  normal  0.310405 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0608  transcriptional regulator-like protein  32.54 
 
 		 364 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.588838  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0581  transcriptional regulator-like  32.54 
 
 		 367 aa  80.1  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0616  transcriptional regulator-like protein  32.54 
 
 		 369 aa  79.3  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501695  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16040  predicted transcriptional regulator  29.82 
 
 		 664 aa  79  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0660  transcriptional regulator, putative  24.77 
 
 		 301 aa  74.7  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2437  hypothetical protein  25.7 
 
 		 323 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4104  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.39 
 
 		 316 aa  72.4  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1644  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.07 
 
 		 347 aa  70.9  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0304784  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5754  hypothetical protein  27.97 
 
 		 351 aa  70.5  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1438  hypothetical protein  24.7 
 
 		 337 aa  69.7  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2755  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.89 
 
 		 336 aa  68.2  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0437  hypothetical protein  25.64 
 
 		 326 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2610  transcriptional regulator-like  29.67 
 
 		 361 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000080301  normal  0.16283 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2933  helix-turn-helix, type 11  31.31 
 
 		 230 aa  65.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.686891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0977  DeoR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 360 aa  65.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.226699  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1441  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.48 
 
 		 333 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1647  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  19.35 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0063  hypothetical protein  22.88 
 
 		 339 aa  63.2  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516278  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2780  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.15 
 
 		 333 aa  63.2  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00079876  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36430  predicted transcriptional regulator  33.48 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.649805 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1294  regulatory protein, DeoR  26.11 
 
 		 336 aa  63.2  0.000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2996  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  30.47 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3146  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.76 
 
 		 351 aa  62.8  0.000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2446  hypothetical protein  30.48 
 
 		 324 aa  62.8  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2503  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.58 
 
 		 232 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.751243 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1775  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  30.81 
 
 		 330 aa  62  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000116568 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2775  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  28.51 
 
 		 229 aa  61.6  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2909  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.17 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1363  YobV  26.4 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.396054  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1185  hypothetical protein  20.86 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0499  hypothetical protein  24.12 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.477682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1867  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.86 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.117205 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0815  Helix-turn-helix type 11 domain protein  19.74 
 
 		 312 aa  59.7  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.502142  hitchhiker  0.0000272273 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2673  putative repressor transcription regulator protein  29.22 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.94129  normal  0.397505 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1180  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  29.19 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0359  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.58 
 
 		 318 aa  59.3  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2673  hypothetical protein  24.26 
 
 		 320 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000327581 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3086  transcriptional regulator, putative  24.93 
 
 		 334 aa  58.9  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0970  transcriptional regulator-like protein  26.16 
 
 		 330 aa  59.3  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1823  Helix-turn-helix type 11 domain protein  32.26 
 
 		 237 aa  58.9  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406304  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0998  transcriptional regulator  20.55 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0713  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  25.23 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.677583  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2698  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  25.83 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000125555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5238  transcriptional regulator  19.38 
 
 		 304 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0664508  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0679  helix-turn-helix, type 11  30.95 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6203  DeoR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2010  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.05 
 
 		 320 aa  56.2  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0450  HTH domain-containing protein  29.58 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0456  helix-turn-helix, type 11  29.58 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1001  hypothetical protein  20.86 
 
 		 313 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0841  hypothetical protein  24.7 
 
 		 351 aa  55.5  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.189594 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0151  helix-turn-helix, type 11  31.98 
 
 		 231 aa  55.5  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1092  Helix-turn-helix type 11 domain protein  20.37 
 
 		 315 aa  55.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.206539  normal  0.830453 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15260  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.9 
 
 		 327 aa  55.8  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190404  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0510  helix-turn-helix, type 11  29.58 
 
 		 230 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1946  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.78 
 
 		 321 aa  55.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5785  transcriptional regulator protein-like protein  28 
 
 		 687 aa  55.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2401  hypothetical protein  23.67 
 
 		 320 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148102  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2656  hypothetical protein  23.08 
 
 		 320 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4059  helix-turn-helix, type 11  29.31 
 
 		 318 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.348793  normal  0.0202879 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2492  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.01 
 
 		 302 aa  54.7  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156303  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4016  transcriptional regulator-like protein  25.4 
 
 		 323 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.620781  normal  0.983747 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0991  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  19.81 
 
 		 302 aa  54.7  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>