231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_0616 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_0616  transcriptional regulator-like protein  100 
 
 
369 aa  705    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501695  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0581  transcriptional regulator-like  94.02 
 
 
367 aa  565  1e-160  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0608  transcriptional regulator-like protein  99.35 
 
 
364 aa  536  1e-151  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.588838  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0624  transcriptional regulator-like protein  83.65 
 
 
368 aa  501  1e-141  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2181  transcriptional regulator-like protein  31.53 
 
 
663 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117971  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2687  transcriptional regulator-like protein  36.16 
 
 
331 aa  125  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2609  hypothetical protein  33.75 
 
 
325 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000144716  normal  0.0873123 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4871  hypothetical protein  33.85 
 
 
321 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0785474  normal  0.13747 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21970  predicted transcriptional regulator  32.59 
 
 
326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.530492  normal  0.375543 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4455  hypothetical protein  30.77 
 
 
317 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.495976  normal  0.176655 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1201  hypothetical protein  31.37 
 
 
329 aa  106  7e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.334695  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1771  transcriptional regulator  30.75 
 
 
675 aa  105  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.193993  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2250  hypothetical protein  33.11 
 
 
337 aa  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0118565  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1924  transcriptional regulator-like protein  28.99 
 
 
663 aa  105  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000155311 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1880  hypothetical protein  30.82 
 
 
344 aa  105  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2368  hypothetical protein  33.89 
 
 
340 aa  105  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5754  hypothetical protein  31.86 
 
 
351 aa  103  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2755  Helix-turn-helix type 11 domain protein  30.61 
 
 
336 aa  99  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2250  putative transcriptional regulator protein  31.58 
 
 
321 aa  99  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1825  hypothetical protein  31.54 
 
 
319 aa  98.2  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2467  transcriptional regulator protein-like protein  28.62 
 
 
326 aa  95.9  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0469709  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5785  transcriptional regulator protein-like protein  31.47 
 
 
687 aa  94.4  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2317  transcriptional regulator-like protein  31.78 
 
 
327 aa  92.8  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000143606  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2958  hypothetical protein  33.44 
 
 
326 aa  91.7  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000014666  hitchhiker  0.00431859 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1501  transcriptional regulator  30.06 
 
 
683 aa  90.5  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.634725  decreased coverage  0.0000677289 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4066  transcriptional regulator-like protein  32.14 
 
 
322 aa  90.5  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.652063  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14000  predicted transcriptional regulator  29.28 
 
 
343 aa  90.1  5e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0168164  normal  0.101985 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12130  hypothetical protein  29.07 
 
 
316 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0209407  normal  0.896855 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0970  transcriptional regulator-like protein  29.04 
 
 
330 aa  87.4  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4034  transcriptional regulator-like protein  31.49 
 
 
322 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2473  transcriptional regulator-like protein  27.89 
 
 
325 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2518  transcriptional regulator-like protein  27.89 
 
 
325 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5861  hypothetical protein  28.3 
 
 
318 aa  83.6  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286987  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2435  hypothetical protein  31.11 
 
 
323 aa  83.2  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2168  hypothetical protein  30.06 
 
 
324 aa  82.8  0.000000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0937011  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3926  transcriptional regulator-like  31.08 
 
 
323 aa  80.9  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.816323  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3443  transcriptional regulator-like protein  27.01 
 
 
331 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2510  transcriptional regulator-like protein  27.55 
 
 
325 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.440747  normal  0.721122 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2004  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  30.51 
 
 
321 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.532666  normal  0.656208 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2698  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  28.88 
 
 
323 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000125555  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3092  transcriptional regulator-like protein  27.01 
 
 
328 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.295578  normal  0.213314 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4016  transcriptional regulator-like protein  28.47 
 
 
323 aa  76.6  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.620781  normal  0.983747 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0063  hypothetical protein  26.34 
 
 
339 aa  76.3  0.0000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516278  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15260  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.88 
 
 
327 aa  76.3  0.0000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190404  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2058  hypothetical protein  32.26 
 
 
336 aa  74.3  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal  0.181699 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1294  regulatory protein, DeoR  35.88 
 
 
336 aa  73.2  0.000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2651  hypothetical protein  30.98 
 
 
330 aa  72.8  0.000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.514708  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0607  putative DeoR-family transcriptional regulator  33.16 
 
 
334 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0615  putative DeoR-family transcriptional regulator  33.16 
 
 
334 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1644  Helix-turn-helix type 11 domain protein  33.71 
 
 
347 aa  70.5  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0304784  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0608  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.69 
 
 
322 aa  69.7  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4104  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  29.35 
 
 
316 aa  69.3  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1421  hypothetical protein  30.64 
 
 
324 aa  68.6  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.182129 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4096  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.45 
 
 
334 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353495  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0494  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  28.08 
 
 
336 aa  68.2  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1300  transcriptional regulator  25.98 
 
 
323 aa  68.2  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.909513  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3075  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.77 
 
 
326 aa  65.1  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00643592  unclonable  0.0000000271212 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1438  hypothetical protein  25.09 
 
 
337 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2241  transcriptional regulator-like protein  22.92 
 
 
350 aa  64.3  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295044  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1826  transcriptional regulator protein-like protein  32.61 
 
 
313 aa  63.9  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0956  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.68 
 
 
327 aa  63.2  0.000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0499  hypothetical protein  27.73 
 
 
229 aa  63.2  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.477682  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18550  predicted transcriptional regulator  28.5 
 
 
341 aa  63.2  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110092  normal  0.0353921 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2154  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.06 
 
 
324 aa  62.8  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1866  transcriptional regulator protein-like protein  33.66 
 
 
354 aa  62  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00621522  normal  0.291628 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0437  hypothetical protein  27.78 
 
 
326 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2689  hypothetical protein  26.8 
 
 
320 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0201589  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1219  transcriptional regulator  25.23 
 
 
336 aa  61.2  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5238  transcriptional regulator  25.7 
 
 
304 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0664508  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1288  hypothetical protein  28.16 
 
 
327 aa  60.5  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5828  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5753  putative DeoR-family transcriptional regulator  32.04 
 
 
369 aa  60.8  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2474  hypothetical protein  25.81 
 
 
320 aa  60.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0188594  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2656  hypothetical protein  25.81 
 
 
320 aa  60.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0977  DeoR family transcriptional regulator  31.07 
 
 
360 aa  60.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.226699  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1515  hypothetical protein  21.57 
 
 
349 aa  58.9  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.284607  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2546  hypothetical protein  41.03 
 
 
676 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000686535  normal  0.24215 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0713  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.04 
 
 
319 aa  58.9  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.677583  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1946  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  31.93 
 
 
321 aa  58.9  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2401  hypothetical protein  24.68 
 
 
320 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148102  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1289  Helix-turn-helix type 11 domain protein  30.67 
 
 
315 aa  58.9  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.447111 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3009  transcriptional regulator-like protein  41.25 
 
 
695 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0558706  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5862  transcriptional regulator protein-like protein  46.67 
 
 
318 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167693  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2944  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.77 
 
 
324 aa  57.8  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1870  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  30.99 
 
 
337 aa  57.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.199317 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3115  transcriptional factor MdcH  30 
 
 
343 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.020795  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1778  Helix-turn-helix type 11 domain protein  31.52 
 
 
352 aa  57.4  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2437  hypothetical protein  27.06 
 
 
323 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0815  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.94 
 
 
312 aa  57  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.502142  hitchhiker  0.0000272273 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1647  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  22.35 
 
 
299 aa  57  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0580  DeoR family transcriptional regulator  35.37 
 
 
334 aa  56.6  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2985  transcriptional regulator protein-like protein  25.37 
 
 
342 aa  56.6  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.256195 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24500  hypothetical protein  34.62 
 
 
150 aa  56.6  0.0000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4546  DeoR family transcriptional regulator  25.99 
 
 
314 aa  56.6  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.86893  normal  0.117628 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2823  putative transcriptional regulator  29.08 
 
 
334 aa  56.6  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0652  regulatory protein, DeoR  25.78 
 
 
332 aa  56.2  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.545144  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1751  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  28.75 
 
 
325 aa  56.2  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.33135  normal  0.990555 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0660  transcriptional regulator, putative  21.5 
 
 
301 aa  55.8  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2507  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.71 
 
 
321 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1363  YobV  29.41 
 
 
311 aa  55.5  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.396054  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3135  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.93 
 
 
329 aa  55.5  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.224168  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>