192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2473 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2473  transcriptional regulator-like protein  100 
 
 		 325 aa  651    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2518  transcriptional regulator-like protein  100 
 
 		 325 aa  651    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2510  transcriptional regulator-like protein  99.08 
 
 		 325 aa  646    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.440747  normal  0.721122 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3443  transcriptional regulator-like protein  83.18 
 
 		 331 aa  515  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3092  transcriptional regulator-like protein  83.49 
 
 		 328 aa  499  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.295578  normal  0.213314 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12130  hypothetical protein  73.31 
 
 		 316 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0209407  normal  0.896855 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2250  putative transcriptional regulator protein  50.79 
 
 		 321 aa  296  3e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21970  predicted transcriptional regulator  46.58 
 
 		 326 aa  274  2.0000000000000002e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.530492  normal  0.375543 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2467  transcriptional regulator protein-like protein  48.14 
 
 		 326 aa  272  5.000000000000001e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0469709  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2368  hypothetical protein  48.84 
 
 		 340 aa  260  2e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2250  hypothetical protein  48.51 
 
 		 337 aa  259  3e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0118565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2609  hypothetical protein  44.48 
 
 		 325 aa  249  3e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000144716  normal  0.0873123 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2687  transcriptional regulator-like protein  44.92 
 
 		 331 aa  248  1e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4455  hypothetical protein  44.51 
 
 		 317 aa  241  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.495976  normal  0.176655 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2168  hypothetical protein  46.98 
 
 		 324 aa  232  7.000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0937011  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4871  hypothetical protein  42.73 
 
 		 321 aa  227  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0785474  normal  0.13747 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1201  hypothetical protein  41.93 
 
 		 329 aa  220  3e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.334695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1880  hypothetical protein  40.37 
 
 		 344 aa  210  3e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5861  hypothetical protein  38.36 
 
 		 318 aa  199  7e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2958  hypothetical protein  40.44 
 
 		 326 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000014666  hitchhiker  0.00431859 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1825  hypothetical protein  39.86 
 
 		 319 aa  195  7e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2317  transcriptional regulator-like protein  41.69 
 
 		 327 aa  195  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000143606  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2435  hypothetical protein  39.5 
 
 		 323 aa  191  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1771  transcriptional regulator  38.82 
 
 		 675 aa  177  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.193993  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14000  predicted transcriptional regulator  34.25 
 
 		 343 aa  163  4.0000000000000004e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0168164  normal  0.101985 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2181  transcriptional regulator-like protein  34.69 
 
 		 663 aa  155  9e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117971  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2651  hypothetical protein  35.89 
 
 		 330 aa  151  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.514708  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1924  transcriptional regulator-like protein  32.91 
 
 		 663 aa  147  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000155311 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18550  predicted transcriptional regulator  33.74 
 
 		 341 aa  142  9e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110092  normal  0.0353921 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2058  hypothetical protein  34.67 
 
 		 336 aa  140  3.9999999999999997e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal  0.181699 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1501  transcriptional regulator  32.78 
 
 		 683 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.634725  decreased coverage  0.0000677289 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1782  transcriptional regulator protein-like protein  35.5 
 
 		 334 aa  125  7e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00000339637  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1867  transcriptional regulator protein-like protein  33.11 
 
 		 328 aa  119  7.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0502476  normal  0.18034 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1288  hypothetical protein  30.43 
 
 		 327 aa  115  7.999999999999999e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5828  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11950  predicted transcriptional regulator  29.74 
 
 		 699 aa  90.1  5e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.308253  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0624  transcriptional regulator-like protein  29.49 
 
 		 368 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5785  transcriptional regulator protein-like protein  27.76 
 
 		 687 aa  78.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2755  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.95 
 
 		 336 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0608  transcriptional regulator-like protein  26.84 
 
 		 364 aa  76.6  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.588838  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0660  transcriptional regulator, putative  22.15 
 
 		 301 aa  74.7  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0616  transcriptional regulator-like protein  26.52 
 
 		 369 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501695  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0581  transcriptional regulator-like  26.6 
 
 		 367 aa  74.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16040  predicted transcriptional regulator  33.93 
 
 		 664 aa  73.6  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1647  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  21.47 
 
 		 299 aa  72  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2296  Helix-turn-helix type 11 domain protein  20.62 
 
 		 322 aa  69.7  0.00000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000342768  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5754  hypothetical protein  26.84 
 
 		 351 aa  69.3  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1438  hypothetical protein  24.17 
 
 		 337 aa  69.3  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2437  hypothetical protein  24.53 
 
 		 323 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04135  transcriptional regulator  29.21 
 
 		 321 aa  66.6  0.0000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.292788  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2010  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.11 
 
 		 320 aa  66.2  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1775  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  30.6 
 
 		 330 aa  65.9  0.0000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000116568 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3527  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.94 
 
 		 323 aa  65.1  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.315913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4016  transcriptional regulator-like protein  25.56 
 
 		 323 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.620781  normal  0.983747 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0122  hypothetical protein  26.03 
 
 		 326 aa  61.6  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2492  Helix-turn-helix type 11 domain protein  21.43 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156303  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4104  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  25.6 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0838  hypothetical protein  22.59 
 
 		 229 aa  60.5  0.00000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.183627 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1255  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 322 aa  60.5  0.00000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0063  hypothetical protein  25.14 
 
 		 339 aa  60.1  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516278  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2444  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.67 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15260  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.41 
 
 		 327 aa  59.7  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190404  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0991  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  19.14 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8630  DeoR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 322 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1731  DeoR family transcriptional regulator  23.83 
 
 		 230 aa  58.5  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.590959  normal  0.873384 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4096  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.11 
 
 		 334 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0713  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.22 
 
 		 319 aa  58.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.677583  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7049  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  30.89 
 
 		 233 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.135487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0499  hypothetical protein  28.22 
 
 		 229 aa  58.2  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.477682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1294  regulatory protein, DeoR  29.52 
 
 		 336 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0359  Helix-turn-helix type 11 domain protein  20.44 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0941  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  23.79 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.958625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2475  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  28.9 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0100218  normal  0.326712 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1223  hypothetical protein  28 
 
 		 322 aa  57  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3428  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  23.56 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2446  hypothetical protein  25.54 
 
 		 324 aa  57  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1644  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.96 
 
 		 347 aa  56.6  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0304784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2401  hypothetical protein  20.12 
 
 		 320 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148102  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2885  transcriptional regulator protein-like protein  28.96 
 
 		 329 aa  56.6  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.379735  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6729  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.33 
 
 		 324 aa  55.8  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.41486 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2367  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.45 
 
 		 313 aa  55.5  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.440872  normal  0.310405 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0437  hypothetical protein  23.75 
 
 		 326 aa  55.5  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2673  hypothetical protein  20.12 
 
 		 320 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000327581 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3644  hypothetical protein  30.16 
 
 		 326 aa  54.7  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.16096  normal  0.19013 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2474  hypothetical protein  20.97 
 
 		 320 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0188594  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2656  hypothetical protein  20.97 
 
 		 320 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1515  hypothetical protein  24.42 
 
 		 349 aa  53.9  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.284607  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0955  transcriptional regulator  24.79 
 
 		 323 aa  53.5  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0131189  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3646  Helix-turn-helix type 11 domain protein  19.33 
 
 		 309 aa  53.9  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000392325  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1185  hypothetical protein  21.43 
 
 		 313 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3146  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.3 
 
 		 351 aa  53.1  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0456  helix-turn-helix, type 11  27.43 
 
 		 230 aa  53.1  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0510  helix-turn-helix, type 11  27.43 
 
 		 230 aa  53.1  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0450  HTH domain-containing protein  27.43 
 
 		 230 aa  53.1  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0970  transcriptional regulator-like protein  23.98 
 
 		 330 aa  52.8  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1826  transcriptional regulator protein-like protein  30.32 
 
 		 313 aa  52.8  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4172  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.3 
 
 		 317 aa  52.8  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.917159  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3403  transcriptional regulator-like protein  25 
 
 		 323 aa  52.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0101274  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8641  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.97 
 
 		 320 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1946  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  24.89 
 
 		 321 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4185  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.2 
 
 		 248 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>