247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1880 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1880  hypothetical protein  100 
 
 		 344 aa  677    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1201  hypothetical protein  49.55 
 
 		 329 aa  288  7e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.334695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2609  hypothetical protein  51.06 
 
 		 325 aa  288  1e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000144716  normal  0.0873123 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5861  hypothetical protein  50.77 
 
 		 318 aa  285  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14000  predicted transcriptional regulator  46.33 
 
 		 343 aa  277  2e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0168164  normal  0.101985 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1825  hypothetical protein  48.68 
 
 		 319 aa  261  1e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2687  transcriptional regulator-like protein  48.17 
 
 		 331 aa  260  3e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2250  putative transcriptional regulator protein  44.69 
 
 		 321 aa  255  8e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2317  transcriptional regulator-like protein  48.16 
 
 		 327 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000143606  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4871  hypothetical protein  46.36 
 
 		 321 aa  254  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0785474  normal  0.13747 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2435  hypothetical protein  48.01 
 
 		 323 aa  244  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21970  predicted transcriptional regulator  44.06 
 
 		 326 aa  236  3e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.530492  normal  0.375543 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1771  transcriptional regulator  44.17 
 
 		 675 aa  229  4e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.193993  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2368  hypothetical protein  42.95 
 
 		 340 aa  222  7e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2467  transcriptional regulator protein-like protein  43 
 
 		 326 aa  220  3e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0469709  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2250  hypothetical protein  42.49 
 
 		 337 aa  218  1e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0118565  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1501  transcriptional regulator  43.04 
 
 		 683 aa  202  5e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.634725  decreased coverage  0.0000677289 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2181  transcriptional regulator-like protein  37.35 
 
 		 663 aa  201  9.999999999999999e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117971  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1924  transcriptional regulator-like protein  36.73 
 
 		 663 aa  200  3e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000155311 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2473  transcriptional regulator-like protein  39.45 
 
 		 325 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2518  transcriptional regulator-like protein  39.45 
 
 		 325 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3443  transcriptional regulator-like protein  38.89 
 
 		 331 aa  194  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2510  transcriptional regulator-like protein  39.14 
 
 		 325 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.440747  normal  0.721122 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2958  hypothetical protein  42.81 
 
 		 326 aa  187  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000014666  hitchhiker  0.00431859 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3092  transcriptional regulator-like protein  39.51 
 
 		 328 aa  185  9e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.295578  normal  0.213314 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4455  hypothetical protein  38.7 
 
 		 317 aa  182  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.495976  normal  0.176655 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2651  hypothetical protein  42.11 
 
 		 330 aa  181  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.514708  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2058  hypothetical protein  40.71 
 
 		 336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal  0.181699 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18550  predicted transcriptional regulator  38.59 
 
 		 341 aa  164  3e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110092  normal  0.0353921 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12130  hypothetical protein  36.62 
 
 		 316 aa  157  3e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0209407  normal  0.896855 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2168  hypothetical protein  36.2 
 
 		 324 aa  150  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0937011  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1782  transcriptional regulator protein-like protein  39.43 
 
 		 334 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00000339637  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1867  transcriptional regulator protein-like protein  37.12 
 
 		 328 aa  120  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0502476  normal  0.18034 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1288  hypothetical protein  30.93 
 
 		 327 aa  105  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5754  hypothetical protein  30.91 
 
 		 351 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0624  transcriptional regulator-like protein  31.79 
 
 		 368 aa  97.4  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2755  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.07 
 
 		 336 aa  90.1  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16040  predicted transcriptional regulator  29.08 
 
 		 664 aa  88.6  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0608  transcriptional regulator-like protein  31.58 
 
 		 364 aa  85.5  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.588838  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11950  predicted transcriptional regulator  33.77 
 
 		 699 aa  84.3  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.308253  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0660  transcriptional regulator, putative  24.7 
 
 		 301 aa  83.6  0.000000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0616  transcriptional regulator-like protein  30.69 
 
 		 369 aa  83.2  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501695  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4104  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.45 
 
 		 316 aa  83.2  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0581  transcriptional regulator-like  30.69 
 
 		 367 aa  82.8  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1775  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  32.62 
 
 		 330 aa  82.4  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000116568 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2021  Helix-turn-helix type 11 domain protein  30.91 
 
 		 317 aa  76.6  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0370713  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1185  hypothetical protein  24.47 
 
 		 313 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1644  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.67 
 
 		 347 aa  72.8  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0304784  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5326  DeoR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  0.563326 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0998  transcriptional regulator  23.56 
 
 		 313 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1363  YobV  21.3 
 
 		 311 aa  70.1  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.396054  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0437  hypothetical protein  24.04 
 
 		 326 aa  69.3  0.00000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1244  HTH domain family  23.87 
 
 		 313 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1647  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  22.29 
 
 		 299 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2437  hypothetical protein  27.24 
 
 		 323 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1294  regulatory protein, DeoR  28.29 
 
 		 336 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1438  hypothetical protein  23.62 
 
 		 337 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5238  transcriptional regulator  20.06 
 
 		 304 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0664508  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04135  transcriptional regulator  27.89 
 
 		 321 aa  67.8  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.292788  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1001  hypothetical protein  23.26 
 
 		 313 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3900  hypothetical protein  43.42 
 
 		 326 aa  65.5  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0623  DeoR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 335 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2673  hypothetical protein  23.62 
 
 		 320 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000327581 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2446  hypothetical protein  27.06 
 
 		 324 aa  64.7  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0615  putative DeoR-family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 334 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0607  putative DeoR-family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 334 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0359  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.81 
 
 		 318 aa  65.1  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1255  transcriptional regulator  28.98 
 
 		 322 aa  65.1  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5785  transcriptional regulator protein-like protein  28.99 
 
 		 687 aa  64.3  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6729  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.49 
 
 		 324 aa  64.3  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.41486 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1223  hypothetical protein  28.98 
 
 		 322 aa  64.3  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3527  Helix-turn-helix type 11 domain protein  30.9 
 
 		 323 aa  63.9  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.315913  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2401  hypothetical protein  23.62 
 
 		 320 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148102  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0499  hypothetical protein  28.93 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.477682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0713  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.98 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.677583  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0063  hypothetical protein  24.35 
 
 		 339 aa  63.2  0.000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516278  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0970  transcriptional regulator-like protein  28.26 
 
 		 330 aa  62.8  0.000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1946  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  29.53 
 
 		 321 aa  62.8  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4172  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.07 
 
 		 317 aa  62.4  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.917159  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2689  hypothetical protein  25.49 
 
 		 320 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0201589  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3428  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  22.15 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0764  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.47 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000424784  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5753  putative DeoR-family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 369 aa  59.3  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0147  helix-turn-helix, type 11  28.03 
 
 		 316 aa  59.3  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2474  hypothetical protein  23.25 
 
 		 320 aa  59.3  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0188594  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2656  hypothetical protein  23.25 
 
 		 320 aa  59.3  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4096  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.91 
 
 		 334 aa  59.3  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1421  hypothetical protein  26.32 
 
 		 324 aa  58.9  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.182129 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0920  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.9 
 
 		 327 aa  59.3  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.711136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3403  transcriptional regulator-like protein  27.45 
 
 		 323 aa  58.9  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0101274  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2154  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.61 
 
 		 324 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8630  DeoR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 322 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4054  Helix-turn-helix type 11 domain protein  33.59 
 
 		 324 aa  58.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.135242  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24500  hypothetical protein  37.23 
 
 		 150 aa  57.8  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0977  DeoR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 360 aa  57  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.226699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0955  transcriptional regulator  23.83 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0131189  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2010  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.27 
 
 		 320 aa  57.4  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4015  transcriptional regulator protein-like protein  29.74 
 
 		 512 aa  57  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6203  DeoR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4323  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  30.25 
 
 		 327 aa  55.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.807083  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>