289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2058 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2058  hypothetical protein  100 
 
 		 336 aa  651    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal  0.181699 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18550  predicted transcriptional regulator  45.11 
 
 		 341 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110092  normal  0.0353921 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2609  hypothetical protein  43.21 
 
 		 325 aa  213  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000144716  normal  0.0873123 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1880  hypothetical protein  40.71 
 
 		 344 aa  208  8e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1782  transcriptional regulator protein-like protein  46.98 
 
 		 334 aa  205  9e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00000339637  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5861  hypothetical protein  41.28 
 
 		 318 aa  195  7e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2250  putative transcriptional regulator protein  40.92 
 
 		 321 aa  194  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2250  hypothetical protein  41.4 
 
 		 337 aa  190  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0118565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1201  hypothetical protein  40.65 
 
 		 329 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.334695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2368  hypothetical protein  40.97 
 
 		 340 aa  188  9e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2687  transcriptional regulator-like protein  42.86 
 
 		 331 aa  186  7e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1771  transcriptional regulator  40.06 
 
 		 675 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.193993  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1867  transcriptional regulator protein-like protein  46.6 
 
 		 328 aa  182  6e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0502476  normal  0.18034 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4455  hypothetical protein  39.33 
 
 		 317 aa  181  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.495976  normal  0.176655 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4871  hypothetical protein  41.67 
 
 		 321 aa  180  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0785474  normal  0.13747 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1825  hypothetical protein  39.54 
 
 		 319 aa  178  9e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2317  transcriptional regulator-like protein  38.62 
 
 		 327 aa  177  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000143606  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2958  hypothetical protein  42.12 
 
 		 326 aa  169  8e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000014666  hitchhiker  0.00431859 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1501  transcriptional regulator  41.23 
 
 		 683 aa  167  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.634725  decreased coverage  0.0000677289 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3443  transcriptional regulator-like protein  36.39 
 
 		 331 aa  167  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21970  predicted transcriptional regulator  38.69 
 
 		 326 aa  167  2.9999999999999998e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.530492  normal  0.375543 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2435  hypothetical protein  39.63 
 
 		 323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3092  transcriptional regulator-like protein  36.45 
 
 		 328 aa  162  6e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.295578  normal  0.213314 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1924  transcriptional regulator-like protein  35.71 
 
 		 663 aa  157  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000155311 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2510  transcriptional regulator-like protein  35.29 
 
 		 325 aa  155  8e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.440747  normal  0.721122 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2467  transcriptional regulator protein-like protein  35.62 
 
 		 326 aa  153  2.9999999999999998e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0469709  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2473  transcriptional regulator-like protein  34.98 
 
 		 325 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2518  transcriptional regulator-like protein  34.98 
 
 		 325 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1288  hypothetical protein  34.97 
 
 		 327 aa  151  2e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2181  transcriptional regulator-like protein  33.33 
 
 		 663 aa  148  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117971  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14000  predicted transcriptional regulator  34.05 
 
 		 343 aa  143  4e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0168164  normal  0.101985 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12130  hypothetical protein  33.23 
 
 		 316 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0209407  normal  0.896855 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2651  hypothetical protein  37.16 
 
 		 330 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.514708  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2168  hypothetical protein  35.05 
 
 		 324 aa  107  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0937011  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5754  hypothetical protein  32.28 
 
 		 351 aa  107  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1363  YobV  25.23 
 
 		 311 aa  91.3  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.396054  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2755  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.88 
 
 		 336 aa  87.4  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1644  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.46 
 
 		 347 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0304784  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5238  transcriptional regulator  19.51 
 
 		 304 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0664508  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1647  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  22.22 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0624  transcriptional regulator-like protein  33.48 
 
 		 368 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2042  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  23.6 
 
 		 307 aa  76.3  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.395632  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5785  transcriptional regulator protein-like protein  27.73 
 
 		 687 aa  74.7  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0680  DeoR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 231 aa  74.3  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11950  predicted transcriptional regulator  29.2 
 
 		 699 aa  73.9  0.000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.308253  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0660  transcriptional regulator, putative  22.43 
 
 		 301 aa  72.4  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4104  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  25.69 
 
 		 316 aa  72.4  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2909  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.61 
 
 		 232 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1731  DeoR family transcriptional regulator  23.28 
 
 		 230 aa  71.6  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.590959  normal  0.873384 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2503  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.49 
 
 		 232 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.751243 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0764  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.69 
 
 		 298 aa  69.7  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000424784  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2446  hypothetical protein  27.02 
 
 		 324 aa  69.7  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0941  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  24.57 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.958625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0838  hypothetical protein  22.36 
 
 		 229 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.183627 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6729  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.42 
 
 		 324 aa  67.4  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.41486 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2775  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  25.42 
 
 		 229 aa  67.4  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0335  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.19 
 
 		 321 aa  67  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.377994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2797  putative transcriptional regulator  30.47 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2996  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  29.22 
 
 		 226 aa  66.2  0.0000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2673  putative repressor transcription regulator protein  28.76 
 
 		 232 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.94129  normal  0.397505 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4054  Helix-turn-helix type 11 domain protein  30.03 
 
 		 324 aa  65.5  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.135242  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15260  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.06 
 
 		 327 aa  65.9  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190404  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2296  Helix-turn-helix type 11 domain protein  16.77 
 
 		 322 aa  64.7  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000342768  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3075  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.4 
 
 		 326 aa  64.3  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00643592  unclonable  0.0000000271212 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0151  helix-turn-helix, type 11  31.21 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4016  transcriptional regulator-like protein  26.28 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.620781  normal  0.983747 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3646  Helix-turn-helix type 11 domain protein  20.6 
 
 		 309 aa  63.2  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000392325  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2367  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.41 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.440872  normal  0.310405 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0608  transcriptional regulator-like protein  32.58 
 
 		 364 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.588838  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0616  transcriptional regulator-like protein  32.58 
 
 		 369 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501695  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2492  Helix-turn-helix type 11 domain protein  21.63 
 
 		 302 aa  62.4  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156303  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35620  predicted transcriptional regulator  38.89 
 
 		 241 aa  62  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0581  transcriptional regulator-like  32.42 
 
 		 367 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3846  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.46 
 
 		 230 aa  61.6  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.80209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1092  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.12 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.206539  normal  0.830453 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0510  helix-turn-helix, type 11  28.32 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2449  helix-turn-helix, type 11  38.16 
 
 		 229 aa  60.8  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.153287 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1867  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.5 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.117205 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0450  HTH domain-containing protein  27.88 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0991  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  20.44 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0456  helix-turn-helix, type 11  27.88 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0788  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  20.39 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2673  hypothetical protein  22.22 
 
 		 320 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000327581 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16040  predicted transcriptional regulator  30.4 
 
 		 664 aa  59.3  0.00000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1775  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  29.65 
 
 		 330 aa  59.3  0.00000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000116568 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0623  DeoR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 335 aa  59.3  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3039  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.55 
 
 		 235 aa  58.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.545561  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2401  hypothetical protein  22.5 
 
 		 320 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148102  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1799  helix-turn-helix, type 11  26.61 
 
 		 229 aa  59.3  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.000591723  normal  0.0198726 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0562  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  22.15 
 
 		 317 aa  58.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.349747  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0615  hypothetical protein  22.71 
 
 		 317 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.759398  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0648  hypothetical protein  22.71 
 
 		 317 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0266881  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0147  helix-turn-helix, type 11  46.55 
 
 		 316 aa  58.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2933  helix-turn-helix, type 11  28.32 
 
 		 230 aa  58.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.686891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0875  Helix-turn-helix type 11 domain protein  30.7 
 
 		 328 aa  57.4  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1959  Helix-turn-helix type 11 domain protein  46.97 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2054  transcriptional regulator protein-like protein  45.07 
 
 		 258 aa  57  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0485994  normal  0.848173 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0559  transcriptional regulator  23.17 
 
 		 317 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5326  DeoR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 318 aa  57  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  0.563326 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0815  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.83 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.502142  hitchhiker  0.0000272273 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>