191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2467 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2467  transcriptional regulator protein-like protein  100 
 
 		 326 aa  654    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0469709  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21970  predicted transcriptional regulator  48.8 
 
 		 326 aa  268  1e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.530492  normal  0.375543 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3443  transcriptional regulator-like protein  47.15 
 
 		 331 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3092  transcriptional regulator-like protein  47.45 
 
 		 328 aa  258  8e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.295578  normal  0.213314 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2250  putative transcriptional regulator protein  47.11 
 
 		 321 aa  258  1e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2473  transcriptional regulator-like protein  48.05 
 
 		 325 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2518  transcriptional regulator-like protein  48.05 
 
 		 325 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2510  transcriptional regulator-like protein  48.04 
 
 		 325 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.440747  normal  0.721122 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12130  hypothetical protein  46.71 
 
 		 316 aa  231  2e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0209407  normal  0.896855 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1880  hypothetical protein  41.9 
 
 		 344 aa  226  3e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2368  hypothetical protein  41.25 
 
 		 340 aa  223  4.9999999999999996e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2168  hypothetical protein  46.53 
 
 		 324 aa  219  3.9999999999999997e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0937011  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2250  hypothetical protein  42.72 
 
 		 337 aa  218  1e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0118565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4455  hypothetical protein  40.92 
 
 		 317 aa  207  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.495976  normal  0.176655 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2958  hypothetical protein  41.77 
 
 		 326 aa  204  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000014666  hitchhiker  0.00431859 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2609  hypothetical protein  39.09 
 
 		 325 aa  203  3e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000144716  normal  0.0873123 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2687  transcriptional regulator-like protein  40.98 
 
 		 331 aa  203  3e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1201  hypothetical protein  39.13 
 
 		 329 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.334695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5861  hypothetical protein  39.44 
 
 		 318 aa  189  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286987  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1825  hypothetical protein  42.42 
 
 		 319 aa  186  4e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14000  predicted transcriptional regulator  36.28 
 
 		 343 aa  182  7e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0168164  normal  0.101985 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4871  hypothetical protein  39.52 
 
 		 321 aa  181  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0785474  normal  0.13747 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2435  hypothetical protein  39.51 
 
 		 323 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2317  transcriptional regulator-like protein  37.39 
 
 		 327 aa  167  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000143606  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2181  transcriptional regulator-like protein  31.87 
 
 		 663 aa  157  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117971  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1771  transcriptional regulator  34.24 
 
 		 675 aa  153  4e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.193993  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1924  transcriptional regulator-like protein  30.63 
 
 		 663 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000155311 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2651  hypothetical protein  36.12 
 
 		 330 aa  144  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.514708  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1501  transcriptional regulator  34.52 
 
 		 683 aa  143  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.634725  decreased coverage  0.0000677289 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2058  hypothetical protein  35.49 
 
 		 336 aa  132  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal  0.181699 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18550  predicted transcriptional regulator  31.85 
 
 		 341 aa  125  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110092  normal  0.0353921 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1782  transcriptional regulator protein-like protein  41.74 
 
 		 334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00000339637  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1867  transcriptional regulator protein-like protein  38.71 
 
 		 328 aa  100  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0502476  normal  0.18034 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0624  transcriptional regulator-like protein  29.79 
 
 		 368 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11950  predicted transcriptional regulator  33.47 
 
 		 699 aa  92.8  7e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.308253  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16040  predicted transcriptional regulator  31.82 
 
 		 664 aa  80.1  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1288  hypothetical protein  28.92 
 
 		 327 aa  79.7  0.00000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2755  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.04 
 
 		 336 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0581  transcriptional regulator-like  28.95 
 
 		 367 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0608  transcriptional regulator-like protein  28.95 
 
 		 364 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.588838  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0616  transcriptional regulator-like protein  28.62 
 
 		 369 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501695  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4104  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.33 
 
 		 316 aa  73.6  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15260  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.85 
 
 		 327 aa  71.2  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190404  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0660  transcriptional regulator, putative  22.59 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6729  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.26 
 
 		 324 aa  65.9  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.41486 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2996  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  35.44 
 
 		 226 aa  65.5  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7049  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  35.58 
 
 		 233 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.135487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2367  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.52 
 
 		 313 aa  63.9  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.440872  normal  0.310405 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2775  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.7 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3926  transcriptional regulator-like  27.04 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.816323  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5754  hypothetical protein  26.16 
 
 		 351 aa  63.2  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2475  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.06 
 
 		 252 aa  62  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0100218  normal  0.326712 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4066  transcriptional regulator-like protein  27.04 
 
 		 322 aa  59.7  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.652063  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2444  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.26 
 
 		 319 aa  59.7  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4846  transcriptional regulator protein-like protein  29.28 
 
 		 326 aa  58.9  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.715011 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4034  transcriptional regulator-like protein  26.53 
 
 		 322 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0499  hypothetical protein  29.93 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.477682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0359  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.64 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0063  hypothetical protein  21.32 
 
 		 339 aa  56.6  0.0000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516278  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1644  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.84 
 
 		 347 aa  56.2  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0304784  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0970  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.01 
 
 		 230 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.890751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4016  transcriptional regulator-like protein  25.98 
 
 		 323 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.620781  normal  0.983747 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2380  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  31.94 
 
 		 228 aa  55.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2105  hypothetical protein  26.79 
 
 		 228 aa  55.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2094  hypothetical protein  26.79 
 
 		 228 aa  55.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1219  transcriptional regulator  25.54 
 
 		 336 aa  55.1  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1233  transcriptional regulator-like  24.59 
 
 		 326 aa  54.7  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1799  helix-turn-helix, type 11  27.4 
 
 		 229 aa  55.1  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.000591723  normal  0.0198726 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1438  hypothetical protein  27.27 
 
 		 337 aa  54.3  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6012  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.81 
 
 		 297 aa  54.3  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.913907 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0588  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  28.9 
 
 		 237 aa  53.9  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0848  Helix-turn-helix type 11 domain protein  30.92 
 
 		 230 aa  54.3  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.814852 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5785  transcriptional regulator protein-like protein  25.34 
 
 		 687 aa  53.5  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1289  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.15 
 
 		 315 aa  53.5  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.447111 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5977  Helix-turn-helix type 11 domain protein  30.59 
 
 		 231 aa  53.5  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2822  Helix-turn-helix type 11 domain protein  44.44 
 
 		 235 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.424495  normal  0.108616 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1359  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.63 
 
 		 322 aa  53.1  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3386  transcriptional regulator protein-like protein  38.03 
 
 		 164 aa  52.8  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0270371  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0676  hypothetical protein  35.19 
 
 		 206 aa  52  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.268937  hitchhiker  0.000000172919 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3896  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.45 
 
 		 321 aa  52.4  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2605  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  22.83 
 
 		 232 aa  52  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2673  hypothetical protein  21.45 
 
 		 320 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000327581 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2874  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  21.17 
 
 		 322 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5102  hypothetical protein  38.57 
 
 		 609 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2974  DeoR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 319 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.779274  normal  0.781562 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1775  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.49 
 
 		 330 aa  52.4  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000116568 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0532  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.11 
 
 		 231 aa  52.4  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3900  hypothetical protein  25.74 
 
 		 326 aa  51.2  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2992  helix-turn-helix, type 11  26.09 
 
 		 252 aa  51.2  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1731  DeoR family transcriptional regulator  21.05 
 
 		 230 aa  51.2  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.590959  normal  0.873384 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2538  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  22.83 
 
 		 232 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2089  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  41.27 
 
 		 237 aa  51.2  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.641654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1946  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.46 
 
 		 321 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1593  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  23.36 
 
 		 237 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.375886 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3551  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.03 
 
 		 238 aa  51.6  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1758  hypothetical protein  23.29 
 
 		 230 aa  51.2  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1867  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.35 
 
 		 232 aa  50.8  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.117205 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2010  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  28.42 
 
 		 320 aa  50.8  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4185  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.4 
 
 		 248 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2704  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  22.83 
 
 		 232 aa  50.8  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.981557  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>