30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_5102 on replicon NC_009973
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009973  Haur_5102  hypothetical protein  100 
 
 		 609 aa  1192    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2436  hypothetical protein  55.37 
 
 		 606 aa  606  9.999999999999999e-173  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2388  hypothetical protein  54.61 
 
 		 606 aa  595  1e-169  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5074  hypothetical protein  86.54 
 
 		 210 aa  333  6e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2467  transcriptional regulator protein-like protein  38.57 
 
 		 326 aa  52.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0469709  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2250  putative transcriptional regulator protein  35.63 
 
 		 321 aa  52.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2996  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  47.83 
 
 		 226 aa  50.1  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2435  hypothetical protein  33.85 
 
 		 323 aa  49.7  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5977  Helix-turn-helix type 11 domain protein  32.03 
 
 		 231 aa  48.5  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1771  transcriptional regulator  30.68 
 
 		 675 aa  48.1  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.193993  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3386  transcriptional regulator protein-like protein  36.08 
 
 		 164 aa  48.5  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0270371  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2089  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  42.86 
 
 		 237 aa  48.1  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.641654  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1825  hypothetical protein  32.1 
 
 		 319 aa  47.4  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21970  predicted transcriptional regulator  33.33 
 
 		 326 aa  47.4  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.530492  normal  0.375543 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1501  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 683 aa  46.6  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.634725  decreased coverage  0.0000677289 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2317  transcriptional regulator-like protein  32.95 
 
 		 327 aa  46.6  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000143606  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1823  Helix-turn-helix type 11 domain protein  37.36 
 
 		 237 aa  47  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406304  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1180  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  39.24 
 
 		 233 aa  47  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0247  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  41.18 
 
 		 227 aa  46.2  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3553  helix-turn-helix, type 11  42.19 
 
 		 238 aa  45.8  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3009  transcriptional regulator-like protein  40.91 
 
 		 695 aa  45.8  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0558706  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1734  transcriptional regulator, putative  37.97 
 
 		 233 aa  46.6  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.781604  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2546  hypothetical protein  34.21 
 
 		 676 aa  45.4  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000686535  normal  0.24215 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2673  hypothetical protein  41.94 
 
 		 698 aa  45.4  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.749079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1676  putative transcriptional regulator  37.97 
 
 		 233 aa  44.7  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0190  Helix-turn-helix type 11 domain protein  35.71 
 
 		 242 aa  44.3  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2058  hypothetical protein  33.33 
 
 		 336 aa  44.3  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal  0.181699 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16040  predicted transcriptional regulator  30.71 
 
 		 664 aa  43.9  0.009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2687  transcriptional regulator-like protein  37.5 
 
 		 331 aa  43.9  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4080  Helix-turn-helix type 11 domain protein  32.97 
 
 		 230 aa  43.9  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>