48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_5074 on replicon NC_009973
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009973  Haur_5074  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  414  9.999999999999999e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5102  hypothetical protein  86.54 
 
 		 609 aa  353  1e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2436  hypothetical protein  53.85 
 
 		 606 aa  218  7e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2388  hypothetical protein  54.85 
 
 		 606 aa  211  4.9999999999999996e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1734  transcriptional regulator, putative  43.59 
 
 		 233 aa  53.5  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.781604  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5977  Helix-turn-helix type 11 domain protein  32.89 
 
 		 231 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1676  putative transcriptional regulator  43.59 
 
 		 233 aa  53.1  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1180  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  42.31 
 
 		 233 aa  52  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1771  transcriptional regulator  32.56 
 
 		 675 aa  51.2  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.193993  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2250  putative transcriptional regulator protein  34.15 
 
 		 321 aa  50.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2467  transcriptional regulator protein-like protein  35.94 
 
 		 326 aa  49.7  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0469709  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21970  predicted transcriptional regulator  34.15 
 
 		 326 aa  49.7  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.530492  normal  0.375543 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2996  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  48.33 
 
 		 226 aa  48.5  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0063  hypothetical protein  26.35 
 
 		 339 aa  47.8  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516278  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2435  hypothetical protein  36.51 
 
 		 323 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1825  hypothetical protein  34.33 
 
 		 319 aa  47  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2089  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  28.48 
 
 		 237 aa  46.6  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.641654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3553  helix-turn-helix, type 11  45 
 
 		 238 aa  45.4  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2094  hypothetical protein  31.08 
 
 		 228 aa  45.4  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2673  hypothetical protein  36.49 
 
 		 698 aa  45.8  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.749079  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2105  hypothetical protein  31.08 
 
 		 228 aa  45.4  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1823  Helix-turn-helix type 11 domain protein  31.3 
 
 		 237 aa  44.7  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406304  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2546  hypothetical protein  35.23 
 
 		 676 aa  44.3  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000686535  normal  0.24215 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2775  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  36.11 
 
 		 229 aa  44.7  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4400  Helix-turn-helix type 11 domain protein  39.13 
 
 		 231 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3009  transcriptional regulator-like protein  36.36 
 
 		 695 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0558706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0190  Helix-turn-helix type 11 domain protein  33.33 
 
 		 242 aa  43.5  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3752  Helix-turn-helix type 11 domain protein  32.93 
 
 		 235 aa  43.9  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2058  hypothetical protein  30.23 
 
 		 336 aa  43.5  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal  0.181699 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1501  transcriptional regulator  31.43 
 
 		 683 aa  43.9  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.634725  decreased coverage  0.0000677289 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2687  transcriptional regulator-like protein  39.39 
 
 		 331 aa  43.1  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0369  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  39.53 
 
 		 229 aa  43.1  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.189659 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3386  transcriptional regulator protein-like protein  34.02 
 
 		 164 aa  43.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0270371  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1201  hypothetical protein  34.45 
 
 		 329 aa  43.1  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.334695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16040  predicted transcriptional regulator  35.14 
 
 		 664 aa  43.1  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2958  hypothetical protein  38.71 
 
 		 326 aa  43.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000014666  hitchhiker  0.00431859 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0676  hypothetical protein  29 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.268937  hitchhiker  0.000000172919 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2317  transcriptional regulator-like protein  34.92 
 
 		 327 aa  43.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000143606  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0104  hypothetical protein  30.41 
 
 		 230 aa  42.7  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3216  Helix-turn-helix type 11 domain protein  32.61 
 
 		 224 aa  42.7  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0247  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  39.68 
 
 		 227 aa  42.7  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2401  hypothetical protein  25.35 
 
 		 320 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148102  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3821  hypothetical protein  30.56 
 
 		 232 aa  42.4  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2673  hypothetical protein  25.35 
 
 		 320 aa  42  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000327581 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0172  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  33.33 
 
 		 242 aa  42  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.657073  normal  0.98017 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5861  hypothetical protein  25.81 
 
 		 318 aa  41.6  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0970  Helix-turn-helix type 11 domain protein  41.67 
 
 		 230 aa  41.2  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.890751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4080  Helix-turn-helix type 11 domain protein  37.31 
 
 		 230 aa  41.6  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>