More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3216 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3216  Helix-turn-helix type 11 domain protein  100 
 
 
224 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1583  hypothetical protein  61.09 
 
 
234 aa  285  4e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.906124  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5977  Helix-turn-helix type 11 domain protein  56.56 
 
 
231 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374689  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0369  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  52.04 
 
 
229 aa  233  3e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.189659 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0104  hypothetical protein  49.78 
 
 
230 aa  228  7e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0532  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  52.94 
 
 
231 aa  228  8e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3646  Helix-turn-helix type 11 domain protein  51.56 
 
 
230 aa  227  1e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2105  hypothetical protein  51.33 
 
 
228 aa  226  3e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2094  hypothetical protein  51.33 
 
 
228 aa  226  3e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3821  hypothetical protein  50.44 
 
 
232 aa  223  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2380  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  52.94 
 
 
228 aa  218  8.999999999999998e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0831  transcriptional regulator-like  51.12 
 
 
244 aa  215  4e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0455803 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3900  Helix-turn-helix type 11 domain protein  49.11 
 
 
230 aa  210  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.543885  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5701  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  49.11 
 
 
229 aa  198  7e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.818045  normal  0.0721904 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2368  helix-turn-helix, type 11  48 
 
 
231 aa  194  1e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.150063 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4080  Helix-turn-helix type 11 domain protein  47.83 
 
 
230 aa  192  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4400  Helix-turn-helix type 11 domain protein  48.04 
 
 
231 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2089  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  44.09 
 
 
237 aa  187  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.641654  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2475  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  44.2 
 
 
252 aa  182  3e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0100218  normal  0.326712 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7104  hypothetical protein  42.53 
 
 
232 aa  177  8e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3551  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  42.86 
 
 
238 aa  174  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4185  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  42.34 
 
 
248 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3752  Helix-turn-helix type 11 domain protein  43.35 
 
 
235 aa  167  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0146  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  40.45 
 
 
233 aa  166  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4305  Helix-turn-helix type 11 domain protein  40.38 
 
 
233 aa  162  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0970  Helix-turn-helix type 11 domain protein  39.27 
 
 
230 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.890751  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2577  DeoR family transcriptional regulator  40.99 
 
 
238 aa  159  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0848  Helix-turn-helix type 11 domain protein  39.27 
 
 
230 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.814852 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0588  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  38.29 
 
 
237 aa  155  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0282  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  41.18 
 
 
231 aa  155  6e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5970  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  36.73 
 
 
241 aa  148  8e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.392838 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2449  helix-turn-helix, type 11  39.73 
 
 
229 aa  145  6e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.153287 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0151  helix-turn-helix, type 11  39.37 
 
 
231 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2996  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  41.9 
 
 
226 aa  139  3.9999999999999997e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0108  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  42.79 
 
 
240 aa  137  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.403778 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000786  predicted transcriptional regulator  37.67 
 
 
228 aa  136  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0574064  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0247  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  42.38 
 
 
227 aa  135  4e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4069  Helix-turn-helix type 11 domain protein  38.81 
 
 
225 aa  135  7.000000000000001e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2992  helix-turn-helix, type 11  38.07 
 
 
252 aa  134  8e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1823  Helix-turn-helix type 11 domain protein  40.28 
 
 
237 aa  133  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406304  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2539  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  37.75 
 
 
228 aa  132  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1734  transcriptional regulator, putative  42.08 
 
 
233 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.781604  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3521  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  38.01 
 
 
231 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0554  TonB-dependent receptor  35.91 
 
 
234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.665291  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1676  putative transcriptional regulator  42.08 
 
 
233 aa  129  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1180  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  42.08 
 
 
233 aa  128  7.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3553  helix-turn-helix, type 11  34.74 
 
 
238 aa  124  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0408  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  39.8 
 
 
233 aa  124  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.855844 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2503  Helix-turn-helix type 11 domain protein  36.28 
 
 
232 aa  122  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.751243 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2627  Helix-turn-helix type 11 domain protein  34.53 
 
 
242 aa  122  4e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2673  putative repressor transcription regulator protein  36.28 
 
 
232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.94129  normal  0.397505 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2909  Helix-turn-helix type 11 domain protein  35.81 
 
 
232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2541  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  39.8 
 
 
228 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0679  helix-turn-helix, type 11  38.57 
 
 
237 aa  119  4.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0190  Helix-turn-helix type 11 domain protein  39.23 
 
 
242 aa  118  7.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3432  helix-turn-helix, type 11  40.59 
 
 
234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.587974  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0172  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  38.76 
 
 
242 aa  115  5e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.657073  normal  0.98017 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2933  helix-turn-helix, type 11  35.89 
 
 
230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.686891  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0694  Helix-turn-helix type 11 domain protein  35.27 
 
 
246 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.454528  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3039  Helix-turn-helix type 11 domain protein  33.33 
 
 
235 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.545561  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3791  transcriptional regulator-like  36.55 
 
 
228 aa  112  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.55139  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2775  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  34.65 
 
 
229 aa  112  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0221  helix-turn-helix, type 11  36.55 
 
 
228 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0705  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  36.55 
 
 
228 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.179711  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2797  putative transcriptional regulator  38.21 
 
 
229 aa  112  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0450  HTH domain-containing protein  35.41 
 
 
230 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0456  helix-turn-helix, type 11  35.41 
 
 
230 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0510  helix-turn-helix, type 11  35.41 
 
 
230 aa  112  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3142  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  35.05 
 
 
232 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92923  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2822  Helix-turn-helix type 11 domain protein  35.87 
 
 
235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.424495  normal  0.108616 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0672  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  36.04 
 
 
228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664641  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0596  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  36.04 
 
 
228 aa  109  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0621  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  36.04 
 
 
228 aa  109  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.296179  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2785  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  36.82 
 
 
229 aa  108  6e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.899973 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1799  helix-turn-helix, type 11  35.55 
 
 
229 aa  108  9.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.000591723  normal  0.0198726 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3400  hypothetical protein  34.85 
 
 
226 aa  107  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4005  putative transcriptional regulator  35.78 
 
 
246 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.22778  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1758  hypothetical protein  35.82 
 
 
230 aa  105  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1191  hypothetical protein  36.92 
 
 
235 aa  105  6e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.351784  normal  0.832163 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2538  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  35.32 
 
 
232 aa  104  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2605  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  35.32 
 
 
232 aa  104  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2704  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  35.32 
 
 
232 aa  104  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.981557  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1457  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  35.82 
 
 
225 aa  104  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2599  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  35 
 
 
235 aa  103  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0941  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  32.82 
 
 
230 aa  102  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.958625  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4104  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  33.02 
 
 
316 aa  102  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3383  putative transcriptional regulator  37.69 
 
 
367 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.296007  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1593  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  35.82 
 
 
237 aa  102  6e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.375886 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0878  helix-turn-helix, type 11  35.15 
 
 
233 aa  101  8e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0490604 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1558  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  35.32 
 
 
237 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2786  Helix-turn-helix type 11 domain protein  35.32 
 
 
237 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.987618  normal  0.72002 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2370  hypothetical protein  37.19 
 
 
228 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3390  transcriptional regulator (repressor protein)  37.19 
 
 
228 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0284  hypothetical protein  37.19 
 
 
361 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1146  hypothetical protein  37.19 
 
 
228 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0387023  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1564  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  35.32 
 
 
237 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2550  putative transcriptional regulator  37.19 
 
 
228 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3348  hypothetical protein  37.19 
 
 
339 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.822547  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3846  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.27 
 
 
230 aa  98.2  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.80209  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0838  hypothetical protein  30.95 
 
 
229 aa  97.4  2e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.183627 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>