16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2436 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2388  hypothetical protein  97.03 
 
 
606 aa  1112    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2436  hypothetical protein  100 
 
 
606 aa  1198    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5102  hypothetical protein  55.37 
 
 
609 aa  616  1e-175  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5074  hypothetical protein  53.85 
 
 
210 aa  204  4e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3009  transcriptional regulator-like protein  45.16 
 
 
695 aa  54.3  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0558706  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2673  hypothetical protein  42.19 
 
 
698 aa  52  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.749079  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2546  hypothetical protein  39.39 
 
 
676 aa  51.6  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000686535  normal  0.24215 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2467  transcriptional regulator protein-like protein  34.38 
 
 
326 aa  48.5  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0469709  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2250  putative transcriptional regulator protein  27.27 
 
 
321 aa  48.1  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1825  hypothetical protein  31.88 
 
 
319 aa  48.1  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2089  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  43.08 
 
 
237 aa  47  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.641654  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2996  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  43.33 
 
 
226 aa  46.2  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2435  hypothetical protein  31.76 
 
 
323 aa  46.2  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1771  transcriptional regulator  29.21 
 
 
675 aa  45.4  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.193993  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1734  transcriptional regulator, putative  38.16 
 
 
233 aa  45.1  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.781604  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1676  putative transcriptional regulator  38.16 
 
 
233 aa  43.9  0.009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>