20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2388 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2388  hypothetical protein  100 
 
 		 606 aa  1195    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2436  hypothetical protein  97.03 
 
 		 606 aa  1112    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5102  hypothetical protein  54.61 
 
 		 609 aa  605  9.999999999999999e-173  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5074  hypothetical protein  54.85 
 
 		 210 aa  198  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3009  transcriptional regulator-like protein  43.28 
 
 		 695 aa  54.3  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0558706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2673  hypothetical protein  42.19 
 
 		 698 aa  52  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.749079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2546  hypothetical protein  38.03 
 
 		 676 aa  51.6  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000686535  normal  0.24215 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2467  transcriptional regulator protein-like protein  34.38 
 
 		 326 aa  48.5  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0469709  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1771  transcriptional regulator  30 
 
 		 675 aa  48.1  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.193993  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2435  hypothetical protein  32.56 
 
 		 323 aa  48.5  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2250  putative transcriptional regulator protein  26.09 
 
 		 321 aa  47.4  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1825  hypothetical protein  30.43 
 
 		 319 aa  47  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2996  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  43.33 
 
 		 226 aa  46.2  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2089  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  41.54 
 
 		 237 aa  45.4  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.641654  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1734  transcriptional regulator, putative  38.16 
 
 		 233 aa  45.4  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.781604  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2058  hypothetical protein  30.77 
 
 		 336 aa  45.1  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal  0.181699 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3400  hypothetical protein  33.33 
 
 		 226 aa  45.1  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1676  putative transcriptional regulator  38.16 
 
 		 233 aa  43.9  0.009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1823  Helix-turn-helix type 11 domain protein  35.82 
 
 		 237 aa  43.9  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406304  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3386  transcriptional regulator protein-like protein  31.18 
 
 		 164 aa  43.9  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0270371  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>