193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4455 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4455  hypothetical protein  100 
 
 		 317 aa  617  1e-176  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.495976  normal  0.176655 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2250  hypothetical protein  58.86 
 
 		 337 aa  333  2e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0118565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2368  hypothetical protein  58.39 
 
 		 340 aa  332  6e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2250  putative transcriptional regulator protein  50.63 
 
 		 321 aa  281  1e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21970  predicted transcriptional regulator  50.32 
 
 		 326 aa  280  2e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.530492  normal  0.375543 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2687  transcriptional regulator-like protein  49.83 
 
 		 331 aa  266  4e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2609  hypothetical protein  46.56 
 
 		 325 aa  243  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000144716  normal  0.0873123 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3443  transcriptional regulator-like protein  43.12 
 
 		 331 aa  239  5e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2510  transcriptional regulator-like protein  44.16 
 
 		 325 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.440747  normal  0.721122 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5861  hypothetical protein  43.08 
 
 		 318 aa  236  5.0000000000000005e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1201  hypothetical protein  45.57 
 
 		 329 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.334695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2473  transcriptional regulator-like protein  44.51 
 
 		 325 aa  235  7e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2518  transcriptional regulator-like protein  44.51 
 
 		 325 aa  235  7e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3092  transcriptional regulator-like protein  43.61 
 
 		 328 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.295578  normal  0.213314 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1825  hypothetical protein  43.92 
 
 		 319 aa  220  3e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4871  hypothetical protein  45.25 
 
 		 321 aa  218  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0785474  normal  0.13747 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2467  transcriptional regulator protein-like protein  40.91 
 
 		 326 aa  213  1.9999999999999998e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0469709  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12130  hypothetical protein  40.66 
 
 		 316 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0209407  normal  0.896855 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2317  transcriptional regulator-like protein  42.01 
 
 		 327 aa  208  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000143606  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2435  hypothetical protein  43.53 
 
 		 323 aa  207  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1880  hypothetical protein  38.7 
 
 		 344 aa  194  1e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2958  hypothetical protein  43.67 
 
 		 326 aa  194  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000014666  hitchhiker  0.00431859 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1771  transcriptional regulator  38.94 
 
 		 675 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.193993  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2168  hypothetical protein  43.17 
 
 		 324 aa  186  4e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0937011  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14000  predicted transcriptional regulator  37.58 
 
 		 343 aa  181  1e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0168164  normal  0.101985 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2651  hypothetical protein  39.51 
 
 		 330 aa  167  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.514708  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1501  transcriptional regulator  38.24 
 
 		 683 aa  165  6.9999999999999995e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.634725  decreased coverage  0.0000677289 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2058  hypothetical protein  39.33 
 
 		 336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal  0.181699 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18550  predicted transcriptional regulator  37.66 
 
 		 341 aa  155  6e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110092  normal  0.0353921 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2181  transcriptional regulator-like protein  31.89 
 
 		 663 aa  153  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117971  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1924  transcriptional regulator-like protein  34.06 
 
 		 663 aa  144  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000155311 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1782  transcriptional regulator protein-like protein  38.91 
 
 		 334 aa  125  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00000339637  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1867  transcriptional regulator protein-like protein  35.43 
 
 		 328 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0502476  normal  0.18034 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0624  transcriptional regulator-like protein  31.33 
 
 		 368 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1288  hypothetical protein  30.06 
 
 		 327 aa  96.7  4e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5828  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11950  predicted transcriptional regulator  32.76 
 
 		 699 aa  91.3  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.308253  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0970  transcriptional regulator-like protein  31.51 
 
 		 330 aa  88.2  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16040  predicted transcriptional regulator  29.79 
 
 		 664 aa  86.7  5e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4104  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.51 
 
 		 316 aa  84  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0608  transcriptional regulator-like protein  31.75 
 
 		 364 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.588838  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1647  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  21.3 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0616  transcriptional regulator-like protein  31.43 
 
 		 369 aa  80.1  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501695  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5754  hypothetical protein  28.89 
 
 		 351 aa  79.7  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2755  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.12 
 
 		 336 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0581  transcriptional regulator-like  31.43 
 
 		 367 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1294  regulatory protein, DeoR  30.29 
 
 		 336 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2004  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  28.53 
 
 		 321 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.532666  normal  0.656208 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0955  transcriptional regulator  22.78 
 
 		 323 aa  71.2  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0131189  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3900  hypothetical protein  32.92 
 
 		 326 aa  71.2  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1438  hypothetical protein  24.08 
 
 		 337 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5785  transcriptional regulator protein-like protein  29.81 
 
 		 687 aa  71.2  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2437  hypothetical protein  24.32 
 
 		 323 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0063  hypothetical protein  26.23 
 
 		 339 aa  70.9  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516278  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0956  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.46 
 
 		 327 aa  70.5  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0437  hypothetical protein  22.31 
 
 		 326 aa  70.1  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0841  hypothetical protein  26.42 
 
 		 351 aa  69.7  0.00000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.189594 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3075  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.23 
 
 		 326 aa  69.3  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00643592  unclonable  0.0000000271212 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1233  transcriptional regulator-like  27.08 
 
 		 326 aa  69.3  0.00000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3086  transcriptional regulator, putative  26.19 
 
 		 334 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3146  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.96 
 
 		 351 aa  68.6  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04135  transcriptional regulator  29.72 
 
 		 321 aa  68.9  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.292788  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1644  Helix-turn-helix type 11 domain protein  33.71 
 
 		 347 aa  68.2  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0304784  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2698  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  25.3 
 
 		 323 aa  67  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000125555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1219  transcriptional regulator  25.84 
 
 		 336 aa  66.2  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2444  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.24 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2673  hypothetical protein  20.63 
 
 		 320 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000327581 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4096  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.09 
 
 		 334 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3644  hypothetical protein  32.53 
 
 		 326 aa  63.9  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.16096  normal  0.19013 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1441  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.08 
 
 		 333 aa  62.4  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0660  transcriptional regulator, putative  22.33 
 
 		 301 aa  62.4  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2401  hypothetical protein  20.24 
 
 		 320 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148102  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5238  transcriptional regulator  20.86 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0664508  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1421  hypothetical protein  25.81 
 
 		 324 aa  61.2  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.182129 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2010  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  25.46 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2154  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.82 
 
 		 324 aa  60.8  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2823  putative transcriptional regulator  27.11 
 
 		 334 aa  60.1  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2689  hypothetical protein  25.9 
 
 		 320 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0201589  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2496  Helix-turn-helix type 11 domain protein  32.43 
 
 		 322 aa  59.3  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.496312  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2474  hypothetical protein  19.84 
 
 		 320 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0188594  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2656  hypothetical protein  19.84 
 
 		 320 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2780  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.77 
 
 		 333 aa  58.9  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00079876  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3403  transcriptional regulator-like protein  24.49 
 
 		 323 aa  58.5  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0101274  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4846  transcriptional regulator protein-like protein  29.43 
 
 		 326 aa  58.5  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.715011 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0452  helix-turn-helix type 11 domain protein  31.5 
 
 		 324 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3926  transcriptional regulator-like  27.43 
 
 		 323 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.816323  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5977  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.02 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374689  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1028  Helix-turn-helix type 11 domain protein  32.69 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1255  transcriptional regulator  27.57 
 
 		 322 aa  57.8  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1775  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  25.14 
 
 		 330 aa  58.5  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000116568 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1092  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.03 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.206539  normal  0.830453 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2446  hypothetical protein  24.56 
 
 		 324 aa  57.8  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3527  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.11 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.315913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4034  transcriptional regulator-like protein  26.21 
 
 		 322 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0815  Helix-turn-helix type 11 domain protein  21.6 
 
 		 312 aa  57.4  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.502142  hitchhiker  0.0000272273 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2296  Helix-turn-helix type 11 domain protein  18.79 
 
 		 322 aa  57  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000342768  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2367  Helix-turn-helix type 11 domain protein  30.43 
 
 		 313 aa  57  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.440872  normal  0.310405 
 
 
-
 
NC_002936  DET1515  hypothetical protein  23.94 
 
 		 349 aa  56.6  0.0000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.284607  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3752  Helix-turn-helix type 11 domain protein  32.88 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4066  transcriptional regulator-like protein  26.32 
 
 		 322 aa  56.2  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.652063  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1185  hypothetical protein  21.75 
 
 		 313 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>