189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12130 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12130  hypothetical protein  100 
 
 		 316 aa  627  1e-178  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0209407  normal  0.896855 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2473  transcriptional regulator-like protein  73.35 
 
 		 325 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2518  transcriptional regulator-like protein  73.35 
 
 		 325 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2510  transcriptional regulator-like protein  73.04 
 
 		 325 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.440747  normal  0.721122 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3443  transcriptional regulator-like protein  71.88 
 
 		 331 aa  434  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3092  transcriptional regulator-like protein  70.62 
 
 		 328 aa  414  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.295578  normal  0.213314 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2250  putative transcriptional regulator protein  51.26 
 
 		 321 aa  281  1e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21970  predicted transcriptional regulator  49.37 
 
 		 326 aa  271  8.000000000000001e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.530492  normal  0.375543 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2467  transcriptional regulator protein-like protein  47.94 
 
 		 326 aa  261  1e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0469709  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2250  hypothetical protein  47.8 
 
 		 337 aa  260  3e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0118565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2368  hypothetical protein  48.99 
 
 		 340 aa  258  9e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2687  transcriptional regulator-like protein  45.18 
 
 		 331 aa  239  5e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4455  hypothetical protein  44.13 
 
 		 317 aa  234  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.495976  normal  0.176655 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2609  hypothetical protein  42.14 
 
 		 325 aa  227  2e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000144716  normal  0.0873123 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2168  hypothetical protein  48.49 
 
 		 324 aa  226  3e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0937011  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1201  hypothetical protein  42.77 
 
 		 329 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.334695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4871  hypothetical protein  41.51 
 
 		 321 aa  208  8e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0785474  normal  0.13747 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1825  hypothetical protein  41.75 
 
 		 319 aa  203  3e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5861  hypothetical protein  39.62 
 
 		 318 aa  200  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1880  hypothetical protein  37.15 
 
 		 344 aa  190  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2435  hypothetical protein  41.07 
 
 		 323 aa  189  5.999999999999999e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2317  transcriptional regulator-like protein  40.25 
 
 		 327 aa  189  8e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000143606  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2958  hypothetical protein  42.04 
 
 		 326 aa  186  3e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000014666  hitchhiker  0.00431859 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14000  predicted transcriptional regulator  35.69 
 
 		 343 aa  172  5e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0168164  normal  0.101985 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1771  transcriptional regulator  35.51 
 
 		 675 aa  172  5e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.193993  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2651  hypothetical protein  35.28 
 
 		 330 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.514708  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2181  transcriptional regulator-like protein  31.73 
 
 		 663 aa  140  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117971  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18550  predicted transcriptional regulator  33.04 
 
 		 341 aa  135  9e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110092  normal  0.0353921 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2058  hypothetical protein  34.35 
 
 		 336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal  0.181699 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1924  transcriptional regulator-like protein  29.68 
 
 		 663 aa  133  5e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000155311 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1867  transcriptional regulator protein-like protein  36.58 
 
 		 328 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0502476  normal  0.18034 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1501  transcriptional regulator  32.13 
 
 		 683 aa  122  6e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.634725  decreased coverage  0.0000677289 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1782  transcriptional regulator protein-like protein  34.8 
 
 		 334 aa  122  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00000339637  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1288  hypothetical protein  30 
 
 		 327 aa  101  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5828  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11950  predicted transcriptional regulator  32.13 
 
 		 699 aa  100  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.308253  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0624  transcriptional regulator-like protein  27.99 
 
 		 368 aa  92.4  9e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16040  predicted transcriptional regulator  31.77 
 
 		 664 aa  81.3  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0608  transcriptional regulator-like protein  28.72 
 
 		 364 aa  79.7  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.588838  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0581  transcriptional regulator-like  28.72 
 
 		 367 aa  79.3  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0616  transcriptional regulator-like protein  28.38 
 
 		 369 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501695  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3146  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.3 
 
 		 351 aa  76.3  0.0000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4016  transcriptional regulator-like protein  28.06 
 
 		 323 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.620781  normal  0.983747 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2755  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.45 
 
 		 336 aa  73.9  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1438  hypothetical protein  25.3 
 
 		 337 aa  70.9  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5754  hypothetical protein  27.65 
 
 		 351 aa  70.5  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15260  Helix-turn-helix type 11 domain protein  21.22 
 
 		 327 aa  69.3  0.00000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190404  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0122  hypothetical protein  32.26 
 
 		 326 aa  69.3  0.00000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0660  transcriptional regulator, putative  22.71 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1647  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  19.94 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0359  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.76 
 
 		 318 aa  67  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04135  transcriptional regulator  29.89 
 
 		 321 aa  66.6  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.292788  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0970  transcriptional regulator-like protein  27.98 
 
 		 330 aa  66.2  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1775  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  31.05 
 
 		 330 aa  64.3  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000116568 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5785  transcriptional regulator protein-like protein  25.87 
 
 		 687 aa  63.5  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2010  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  24.85 
 
 		 320 aa  63.2  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0437  hypothetical protein  25.42 
 
 		 326 aa  63.2  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0063  hypothetical protein  25.45 
 
 		 339 aa  61.2  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516278  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2437  hypothetical protein  23.94 
 
 		 323 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2004  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.58 
 
 		 321 aa  59.7  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.532666  normal  0.656208 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6729  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.53 
 
 		 324 aa  59.3  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.41486 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4034  transcriptional regulator-like protein  25.4 
 
 		 322 aa  59.3  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1185  hypothetical protein  20.61 
 
 		 313 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3926  transcriptional regulator-like  25 
 
 		 323 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.816323  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4546  DeoR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 314 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.86893  normal  0.117628 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1255  transcriptional regulator  28 
 
 		 322 aa  58.5  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2446  hypothetical protein  25.7 
 
 		 324 aa  58.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7049  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  33.04 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.135487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5326  DeoR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  0.563326 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1826  transcriptional regulator protein-like protein  27.72 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0991  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  17.61 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0977  DeoR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 360 aa  57.4  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.226699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1644  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.62 
 
 		 347 aa  56.6  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0304784  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1223  hypothetical protein  28 
 
 		 322 aa  56.2  0.0000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3527  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.315913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4066  transcriptional regulator-like protein  24.83 
 
 		 322 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.652063  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3644  hypothetical protein  31.32 
 
 		 326 aa  55.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.16096  normal  0.19013 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4104  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  24.32 
 
 		 316 aa  55.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0998  transcriptional regulator  21.21 
 
 		 313 aa  54.7  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4738  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.01 
 
 		 313 aa  55.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.947562  normal  0.956989 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2444  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.98 
 
 		 319 aa  54.7  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2626  helix-turn-helix, type 11  29.11 
 
 		 230 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.182787  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2670  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  29.11 
 
 		 230 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.750457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8630  DeoR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 322 aa  53.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4096  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.69 
 
 		 334 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0608  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  24.41 
 
 		 322 aa  53.1  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3934  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.21 
 
 		 321 aa  52.8  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0769202  hitchhiker  0.00173443 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0249  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  28 
 
 		 324 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1359  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26 
 
 		 322 aa  52.4  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0679  helix-turn-helix, type 11  33.57 
 
 		 237 aa  51.2  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4133  DeoR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 317 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113991  normal  0.040793 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5106  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  24.84 
 
 		 319 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.505458  normal  0.201643 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1294  regulatory protein, DeoR  24.08 
 
 		 336 aa  51.6  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0560  transcriptional regulator  21.78 
 
 		 317 aa  50.4  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00184479  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5970  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  25.88 
 
 		 241 aa  50.8  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.392838 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2683  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.06 
 
 		 324 aa  50.4  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.255194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1962  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.33 
 
 		 330 aa  50.4  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000800393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8641  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.25 
 
 		 320 aa  50.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160159  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1001  hypothetical protein  20.61 
 
 		 313 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0841  hypothetical protein  25 
 
 		 351 aa  50.1  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.189594 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0499  hypothetical protein  27.15 
 
 		 229 aa  50.1  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.477682  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>