186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1782 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1782  transcriptional regulator protein-like protein  100 
 
 		 334 aa  635    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00000339637  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18550  predicted transcriptional regulator  54.35 
 
 		 341 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110092  normal  0.0353921 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1867  transcriptional regulator protein-like protein  54.95 
 
 		 328 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0502476  normal  0.18034 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2058  hypothetical protein  46.11 
 
 		 336 aa  221  1.9999999999999999e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal  0.181699 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2250  putative transcriptional regulator protein  42.55 
 
 		 321 aa  187  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1288  hypothetical protein  39.58 
 
 		 327 aa  177  3e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2250  hypothetical protein  42.17 
 
 		 337 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0118565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2609  hypothetical protein  39.33 
 
 		 325 aa  169  7e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000144716  normal  0.0873123 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1201  hypothetical protein  39.82 
 
 		 329 aa  169  9e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.334695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1880  hypothetical protein  39.53 
 
 		 344 aa  168  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21970  predicted transcriptional regulator  39.94 
 
 		 326 aa  168  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.530492  normal  0.375543 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2368  hypothetical protein  41.75 
 
 		 340 aa  168  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1825  hypothetical protein  38.83 
 
 		 319 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2687  transcriptional regulator-like protein  44.37 
 
 		 331 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1771  transcriptional regulator  39.76 
 
 		 675 aa  162  9e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.193993  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2435  hypothetical protein  40.13 
 
 		 323 aa  160  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5861  hypothetical protein  38.27 
 
 		 318 aa  159  8e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2317  transcriptional regulator-like protein  38.53 
 
 		 327 aa  157  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000143606  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2510  transcriptional regulator-like protein  36.78 
 
 		 325 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.440747  normal  0.721122 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2473  transcriptional regulator-like protein  36.39 
 
 		 325 aa  152  8e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2518  transcriptional regulator-like protein  36.39 
 
 		 325 aa  152  8e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3443  transcriptional regulator-like protein  34.37 
 
 		 331 aa  149  9e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4455  hypothetical protein  37.89 
 
 		 317 aa  148  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.495976  normal  0.176655 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1501  transcriptional regulator  41.95 
 
 		 683 aa  147  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.634725  decreased coverage  0.0000677289 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2467  transcriptional regulator protein-like protein  41.74 
 
 		 326 aa  145  8.000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0469709  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3092  transcriptional regulator-like protein  33.75 
 
 		 328 aa  145  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.295578  normal  0.213314 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4871  hypothetical protein  38.48 
 
 		 321 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0785474  normal  0.13747 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2958  hypothetical protein  39.94 
 
 		 326 aa  137  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000014666  hitchhiker  0.00431859 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2651  hypothetical protein  35.84 
 
 		 330 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.514708  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12130  hypothetical protein  34.92 
 
 		 316 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0209407  normal  0.896855 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14000  predicted transcriptional regulator  32.46 
 
 		 343 aa  122  9.999999999999999e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0168164  normal  0.101985 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2168  hypothetical protein  37.99 
 
 		 324 aa  119  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0937011  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1924  transcriptional regulator-like protein  32.62 
 
 		 663 aa  116  6e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000155311 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2181  transcriptional regulator-like protein  31.35 
 
 		 663 aa  114  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117971  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5238  transcriptional regulator  21.23 
 
 		 304 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0664508  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11950  predicted transcriptional regulator  30.57 
 
 		 699 aa  78.6  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.308253  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5785  transcriptional regulator protein-like protein  29.97 
 
 		 687 aa  76.3  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2367  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.02 
 
 		 313 aa  74.7  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.440872  normal  0.310405 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0660  transcriptional regulator, putative  23.29 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1647  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  21.74 
 
 		 299 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2446  hypothetical protein  25.45 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0624  transcriptional regulator-like protein  32.2 
 
 		 368 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2444  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.9 
 
 		 319 aa  67  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2755  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.02 
 
 		 336 aa  65.9  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1775  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  31.52 
 
 		 330 aa  64.7  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000116568 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2296  Helix-turn-helix type 11 domain protein  19.83 
 
 		 322 aa  63.5  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000342768  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2933  helix-turn-helix, type 11  29.15 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.686891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3075  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.41 
 
 		 326 aa  62  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00643592  unclonable  0.0000000271212 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16040  predicted transcriptional regulator  32.77 
 
 		 664 aa  62.4  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4104  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  30.17 
 
 		 316 aa  60.5  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6729  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.8 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.41486 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4323  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  33.03 
 
 		 327 aa  60.1  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.807083  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1946  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  25.1 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1867  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.17 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.117205 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0359  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.27 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0841  hypothetical protein  24.33 
 
 		 351 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.189594 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2004  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.33 
 
 		 321 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.532666  normal  0.656208 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5754  hypothetical protein  28.43 
 
 		 351 aa  58.5  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0608  transcriptional regulator-like protein  32.77 
 
 		 364 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.588838  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0616  transcriptional regulator-like protein  32.74 
 
 		 369 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501695  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0581  transcriptional regulator-like  31.93 
 
 		 367 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7049  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  31.02 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.135487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2775  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.43 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15260  Helix-turn-helix type 11 domain protein  21.18 
 
 		 327 aa  57.8  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190404  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2042  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  21.26 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.395632  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2909  Helix-turn-helix type 11 domain protein  30.84 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0510  helix-turn-helix, type 11  29.2 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0713  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.03 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.677583  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0147  helix-turn-helix, type 11  30.57 
 
 		 316 aa  56.6  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2698  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  26.24 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000125555  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2503  Helix-turn-helix type 11 domain protein  30.84 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.751243 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0456  helix-turn-helix, type 11  28.38 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0450  HTH domain-containing protein  28.38 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24500  hypothetical protein  32.14 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4034  transcriptional regulator-like protein  28.68 
 
 		 322 aa  56.2  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1180  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  29.52 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2797  putative transcriptional regulator  28.7 
 
 		 229 aa  55.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1438  hypothetical protein  23.47 
 
 		 337 aa  55.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8630  DeoR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 322 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0583  hypothetical protein  29.52 
 
 		 598 aa  55.1  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.692226  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4066  transcriptional regulator-like protein  28.31 
 
 		 322 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.652063  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2996  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  30.17 
 
 		 226 aa  54.3  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1644  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.8 
 
 		 347 aa  54.3  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0304784  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1363  YobV  21.3 
 
 		 311 aa  53.5  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.396054  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2361  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  36.94 
 
 		 164 aa  53.5  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407136  normal  0.0484328 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1789  Helix-turn-helix type 11 domain protein  30.87 
 
 		 333 aa  53.5  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0003326  normal  0.195591 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0941  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  24.44 
 
 		 230 aa  53.5  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.958625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4054  Helix-turn-helix type 11 domain protein  33.49 
 
 		 324 aa  53.1  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.135242  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0335  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  25.07 
 
 		 321 aa  52.8  0.000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.377994  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2673  putative repressor transcription regulator protein  29.96 
 
 		 232 aa  52.4  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.94129  normal  0.397505 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3926  transcriptional regulator-like  30.69 
 
 		 323 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.816323  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3900  hypothetical protein  31.47 
 
 		 326 aa  51.2  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0764  Helix-turn-helix type 11 domain protein  20.92 
 
 		 298 aa  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000424784  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2934  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  29.07 
 
 		 230 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334283 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0788  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  24.11 
 
 		 319 aa  51.6  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3403  transcriptional regulator-like protein  27.16 
 
 		 323 aa  51.2  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0101274  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2627  Helix-turn-helix type 11 domain protein  30.45 
 
 		 242 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1359  Helix-turn-helix type 11 domain protein  33.18 
 
 		 322 aa  51.6  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0063  hypothetical protein  25.36 
 
 		 339 aa  51.6  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516278  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2821  hypothetical DNA-binding protein  20.75 
 
 		 314 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.184297  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>