25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1977 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_1977  transcriptional regulator protein-like  100 
 
 		 325 aa  666    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3020  transcriptional regulator-like protein  25 
 
 		 352 aa  63.5  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.117802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2683  transcriptional regulator-like protein  24.75 
 
 		 348 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0348913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1468  transcriptional regulator-like protein  25.46 
 
 		 341 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.125958  normal  0.997916 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0236  transcriptional regulator-like protein  26.04 
 
 		 334 aa  55.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5785  transcriptional regulator protein-like protein  28.16 
 
 		 687 aa  49.3  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2437  hypothetical protein  22.81 
 
 		 323 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4261  hypothetical protein  23.86 
 
 		 342 aa  48.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4846  transcriptional regulator protein-like protein  26.05 
 
 		 326 aa  47.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.715011 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1441  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.48 
 
 		 333 aa  47  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2021  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.63 
 
 		 317 aa  47  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0370713  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1708  hypothetical protein  24.75 
 
 		 317 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000278682 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2168  transcriptional regulator-like protein  22.66 
 
 		 341 aa  46.2  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.229743  hitchhiker  0.000000957386 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15260  Helix-turn-helix type 11 domain protein  30.49 
 
 		 327 aa  46.2  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190404  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0920  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.09 
 
 		 327 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.711136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0815  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.97 
 
 		 312 aa  45.4  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.502142  hitchhiker  0.0000272273 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4738  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  25.42 
 
 		 313 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.947562  normal  0.956989 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6203  DeoR family transcriptional regulator  28 
 
 		 318 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2992  helix-turn-helix, type 11  29.24 
 
 		 252 aa  45.1  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5861  hypothetical protein  26.38 
 
 		 318 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0063  hypothetical protein  26.59 
 
 		 339 aa  43.9  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516278  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0473  transcriptional regulator, putative  23.2 
 
 		 334 aa  43.9  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2780  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.88 
 
 		 333 aa  43.9  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00079876  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2910  transcriptional regulator  23.73 
 
 		 359 aa  43.9  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.246584 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1799  helix-turn-helix, type 11  29.05 
 
 		 229 aa  42.7  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.000591723  normal  0.0198726 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>