34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4261 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_4261  hypothetical protein  100 
 
 		 342 aa  704    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0236  transcriptional regulator-like protein  43.07 
 
 		 334 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1026  hypothetical protein  41.47 
 
 		 343 aa  232  9e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.471951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1468  transcriptional regulator-like protein  40.3 
 
 		 341 aa  222  7e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.125958  normal  0.997916 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3020  transcriptional regulator-like protein  39.12 
 
 		 352 aa  207  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.117802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2168  transcriptional regulator-like protein  37.13 
 
 		 341 aa  207  3e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.229743  hitchhiker  0.000000957386 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2683  transcriptional regulator-like protein  39.41 
 
 		 348 aa  200  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0348913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2643  hypothetical protein  40.91 
 
 		 136 aa  73.9  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0187479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1577  hypothetical protein  37.5 
 
 		 136 aa  73.6  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000129101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4096  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.36 
 
 		 334 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3934  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.95 
 
 		 321 aa  55.5  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0769202  hitchhiker  0.00173443 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1201  hypothetical protein  25.38 
 
 		 329 aa  55.1  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.334695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2609  hypothetical protein  27.78 
 
 		 325 aa  52  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000144716  normal  0.0873123 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2435  hypothetical protein  23.33 
 
 		 323 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0581  transcriptional regulator-like  31.75 
 
 		 367 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1977  transcriptional regulator protein-like  23.86 
 
 		 325 aa  48.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0616  transcriptional regulator-like protein  31.75 
 
 		 369 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501695  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0944  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  22.74 
 
 		 330 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.001663  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0608  transcriptional regulator-like protein  31.75 
 
 		 364 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.588838  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4095  DeoR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 333 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3086  transcriptional regulator, putative  22.94 
 
 		 334 aa  46.6  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5238  transcriptional regulator  22.32 
 
 		 304 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0664508  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1438  hypothetical protein  18.73 
 
 		 337 aa  46.6  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2455  hypothetical protein  23.15 
 
 		 325 aa  46.2  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.947664  normal  0.0726656 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0624  transcriptional regulator-like protein  29.06 
 
 		 368 aa  46.2  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0437  hypothetical protein  21.75 
 
 		 326 aa  45.8  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15260  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.76 
 
 		 327 aa  45.4  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190404  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14000  predicted transcriptional regulator  28.69 
 
 		 343 aa  45.4  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0168164  normal  0.101985 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0956  Helix-turn-helix type 11 domain protein  20.25 
 
 		 327 aa  44.3  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4455  hypothetical protein  27.46 
 
 		 317 aa  44.3  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.495976  normal  0.176655 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0788  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  22.35 
 
 		 319 aa  43.5  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0560  transcriptional regulator  18.92 
 
 		 317 aa  43.1  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00184479  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1867  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.85 
 
 		 232 aa  43.1  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.117205 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2503  Helix-turn-helix type 11 domain protein  30.72 
 
 		 232 aa  42.7  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.751243 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>