17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1026 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1026  hypothetical protein  100 
 
 		 343 aa  685    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.471951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1468  transcriptional regulator-like protein  60.47 
 
 		 341 aa  393  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.125958  normal  0.997916 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2168  transcriptional regulator-like protein  57.82 
 
 		 341 aa  376  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.229743  hitchhiker  0.000000957386 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0236  transcriptional regulator-like protein  45.48 
 
 		 334 aa  252  7e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4261  hypothetical protein  41.47 
 
 		 342 aa  247  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3020  transcriptional regulator-like protein  42.98 
 
 		 352 aa  226  4e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.117802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2683  transcriptional regulator-like protein  43.79 
 
 		 348 aa  194  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0348913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1577  hypothetical protein  59.7 
 
 		 136 aa  155  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000129101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2643  hypothetical protein  62.07 
 
 		 136 aa  145  9e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0187479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1438  hypothetical protein  23.49 
 
 		 337 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2944  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.1 
 
 		 324 aa  50.8  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3694  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.71 
 
 		 321 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0509362  hitchhiker  0.00000175857 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0437  hypothetical protein  22.74 
 
 		 326 aa  49.3  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6686  hypothetical protein  25.88 
 
 		 327 aa  47.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0918823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1977  transcriptional regulator protein-like  25.76 
 
 		 325 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1201  hypothetical protein  28.05 
 
 		 329 aa  45.4  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.334695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4096  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.43 
 
 		 334 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353495  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>