25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2168 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2168  transcriptional regulator-like protein  100 
 
 		 341 aa  692    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.229743  hitchhiker  0.000000957386 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1468  transcriptional regulator-like protein  82.4 
 
 		 341 aa  573  1.0000000000000001e-162  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.125958  normal  0.997916 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1026  hypothetical protein  57.82 
 
 		 343 aa  348  1e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.471951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3020  transcriptional regulator-like protein  39.18 
 
 		 352 aa  211  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.117802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0236  transcriptional regulator-like protein  39.23 
 
 		 334 aa  208  1e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4261  hypothetical protein  37.13 
 
 		 342 aa  207  3e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2683  transcriptional regulator-like protein  38.46 
 
 		 348 aa  162  7e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0348913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2643  hypothetical protein  60.34 
 
 		 136 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0187479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1577  hypothetical protein  53.97 
 
 		 136 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000129101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0437  hypothetical protein  22.12 
 
 		 326 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1438  hypothetical protein  20.47 
 
 		 337 aa  60.5  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0956  Helix-turn-helix type 11 domain protein  20.32 
 
 		 327 aa  55.8  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3644  hypothetical protein  29.37 
 
 		 326 aa  55.8  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.16096  normal  0.19013 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2154  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.88 
 
 		 324 aa  49.7  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2986  hypothetical protein  26.32 
 
 		 433 aa  47  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.178567 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0991  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  24.74 
 
 		 302 aa  46.6  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0351  hypothetical protein  27.02 
 
 		 325 aa  46.2  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1977  transcriptional regulator protein-like  22.66 
 
 		 325 aa  46.2  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2437  hypothetical protein  20.46 
 
 		 323 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1233  transcriptional regulator-like  22.52 
 
 		 326 aa  44.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4016  transcriptional regulator-like protein  28.57 
 
 		 323 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.620781  normal  0.983747 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0944  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  23.08 
 
 		 330 aa  43.9  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.001663  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1122  transcriptional regulator-like protein  26.72 
 
 		 343 aa  43.5  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.970908  normal  0.295057 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2944  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  25.17 
 
 		 324 aa  43.1  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1421  hypothetical protein  19.11 
 
 		 324 aa  42.7  0.009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.182129 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>