24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3020 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3020  transcriptional regulator-like protein  100 
 
 		 352 aa  716    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.117802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2683  transcriptional regulator-like protein  73.16 
 
 		 348 aa  482  1e-135  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0348913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0236  transcriptional regulator-like protein  47.02 
 
 		 334 aa  281  2e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1468  transcriptional regulator-like protein  41.69 
 
 		 341 aa  219  7.999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.125958  normal  0.997916 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2168  transcriptional regulator-like protein  39.18 
 
 		 341 aa  211  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.229743  hitchhiker  0.000000957386 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4261  hypothetical protein  39.12 
 
 		 342 aa  207  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1026  hypothetical protein  42.98 
 
 		 343 aa  202  9e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.471951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1577  hypothetical protein  45.1 
 
 		 136 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000129101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2643  hypothetical protein  45.65 
 
 		 136 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0187479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1977  transcriptional regulator protein-like  25 
 
 		 325 aa  63.5  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1644  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.73 
 
 		 347 aa  50.8  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0304784  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2874  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  24.46 
 
 		 322 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2437  hypothetical protein  22.07 
 
 		 323 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1294  regulatory protein, DeoR  23.88 
 
 		 336 aa  47.4  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2992  helix-turn-helix, type 11  26.07 
 
 		 252 aa  47  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3107  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.56 
 
 		 324 aa  46.2  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.786544  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2166  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.78 
 
 		 320 aa  45.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.304825  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45460  hypothetical protein  31.15 
 
 		 323 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2435  hypothetical protein  23.38 
 
 		 323 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4041  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.89 
 
 		 316 aa  43.9  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2627  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.27 
 
 		 242 aa  43.5  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4871  hypothetical protein  28.22 
 
 		 321 aa  43.5  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0785474  normal  0.13747 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3859  hypothetical protein  31.29 
 
 		 323 aa  43.5  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0913  hypothetical protein  20.16 
 
 		 317 aa  43.9  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0351983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>