21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2683 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2683  transcriptional regulator-like protein  100 
 
 		 348 aa  702    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0348913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3020  transcriptional regulator-like protein  73.16 
 
 		 352 aa  506  9.999999999999999e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.117802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0236  transcriptional regulator-like protein  44.18 
 
 		 334 aa  256  4e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4261  hypothetical protein  39.41 
 
 		 342 aa  210  3e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1468  transcriptional regulator-like protein  40.59 
 
 		 341 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.125958  normal  0.997916 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1026  hypothetical protein  43.7 
 
 		 343 aa  189  5.999999999999999e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.471951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2168  transcriptional regulator-like protein  38.46 
 
 		 341 aa  186  4e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.229743  hitchhiker  0.000000957386 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2643  hypothetical protein  48.39 
 
 		 136 aa  73.2  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0187479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1577  hypothetical protein  44.44 
 
 		 136 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000129101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1977  transcriptional regulator protein-like  24.7 
 
 		 325 aa  62  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2992  helix-turn-helix, type 11  27.53 
 
 		 252 aa  47  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1644  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.1 
 
 		 347 aa  46.2  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0304784  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0705  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  27.15 
 
 		 228 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.179711  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0221  helix-turn-helix, type 11  27.15 
 
 		 228 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0672  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.36 
 
 		 228 aa  43.1  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1438  hypothetical protein  22 
 
 		 337 aa  43.1  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0596  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  27.11 
 
 		 228 aa  43.1  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0621  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.11 
 
 		 228 aa  43.1  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.296179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3086  transcriptional regulator, putative  25 
 
 		 334 aa  42.7  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3791  transcriptional regulator-like  26.67 
 
 		 228 aa  42.7  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.55139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0913  hypothetical protein  20.08 
 
 		 317 aa  42.7  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0351983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>