31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0236 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_0236  transcriptional regulator-like protein  100 
 
 		 334 aa  676    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3020  transcriptional regulator-like protein  47.02 
 
 		 352 aa  281  1e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.117802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4261  hypothetical protein  43.07 
 
 		 342 aa  254  2.0000000000000002e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2683  transcriptional regulator-like protein  44.18 
 
 		 348 aa  238  8e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0348913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1468  transcriptional regulator-like protein  41.49 
 
 		 341 aa  238  9e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.125958  normal  0.997916 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1026  hypothetical protein  45.48 
 
 		 343 aa  230  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.471951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2168  transcriptional regulator-like protein  39.23 
 
 		 341 aa  208  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.229743  hitchhiker  0.000000957386 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2643  hypothetical protein  38.05 
 
 		 136 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0187479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0944  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  25.6 
 
 		 330 aa  72  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.001663  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1577  hypothetical protein  34.92 
 
 		 136 aa  70.5  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000129101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3086  transcriptional regulator, putative  24.32 
 
 		 334 aa  55.8  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1977  transcriptional regulator protein-like  26.04 
 
 		 325 aa  55.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4323  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  29.53 
 
 		 327 aa  52  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.807083  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1438  hypothetical protein  26.75 
 
 		 337 aa  52.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0437  hypothetical protein  26.84 
 
 		 326 aa  52  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0382  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.1 
 
 		 333 aa  51.6  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.117118  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0473  transcriptional regulator, putative  22.98 
 
 		 334 aa  52  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2609  hypothetical protein  28.42 
 
 		 325 aa  50.1  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000144716  normal  0.0873123 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1441  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.83 
 
 		 333 aa  49.3  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0494  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  24.55 
 
 		 336 aa  48.5  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4871  hypothetical protein  27.15 
 
 		 321 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0785474  normal  0.13747 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2780  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.46 
 
 		 333 aa  47.8  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00079876  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2435  hypothetical protein  23.89 
 
 		 323 aa  47  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15260  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.27 
 
 		 327 aa  45.4  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190404  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0913  hypothetical protein  20.75 
 
 		 317 aa  43.9  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0351983  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2368  hypothetical protein  27.81 
 
 		 340 aa  43.5  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1644  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.82 
 
 		 347 aa  43.5  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0304784  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0573  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.75 
 
 		 317 aa  43.1  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000975752  normal  0.773563 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4455  hypothetical protein  26.88 
 
 		 317 aa  43.1  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.495976  normal  0.176655 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0988  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  22.95 
 
 		 317 aa  42.7  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2437  hypothetical protein  23.59 
 
 		 323 aa  42.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>