191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_18560 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_18560  predicted transcriptional regulator  100 
 
 		 361 aa  704    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.0049611  normal  0.0116825 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1783  transcriptional regulator protein-like protein  59.82 
 
 		 337 aa  366  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  unclonable  0.000000000261192  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1866  transcriptional regulator protein-like protein  53.73 
 
 		 354 aa  329  6e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00621522  normal  0.291628 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2057  transcriptional regulator-like protein  47.92 
 
 		 320 aa  249  6e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.090135  normal  0.188447 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1287  putative transcriptional regulator protein  44.21 
 
 		 334 aa  243  5e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.271739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1879  transcriptional regulator-like  45.83 
 
 		 352 aa  235  9e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1826  transcriptional regulator protein-like protein  44.1 
 
 		 313 aa  226  4e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5862  transcriptional regulator protein-like protein  43.79 
 
 		 318 aa  216  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12131  hypothetical protein  39.82 
 
 		 332 aa  206  6e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000529286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3091  hypothetical protein  39.69 
 
 		 359 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.727496  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2610  transcriptional regulator-like  41.74 
 
 		 361 aa  199  6e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000080301  normal  0.16283 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2434  hypothetical protein  39.34 
 
 		 361 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2316  DeoR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 331 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000471902  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3444  hypothetical protein  38.86 
 
 		 335 aa  192  8e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2509  hypothetical protein  37.84 
 
 		 326 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.308334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2472  hypothetical protein  37.84 
 
 		 326 aa  189  5e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2517  hypothetical protein  37.84 
 
 		 326 aa  189  5e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2249  putative transcriptional regulator protein  40.12 
 
 		 327 aa  186  4e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2367  hypothetical protein  38.58 
 
 		 330 aa  181  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2249  hypothetical protein  40.43 
 
 		 330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00588148  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1501  transcriptional regulator  36.68 
 
 		 683 aa  180  4e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.634725  decreased coverage  0.0000677289 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4456  transcriptional regulator,-like protein  37.85 
 
 		 335 aa  177  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.427678  normal  0.167477 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1924  transcriptional regulator-like protein  36.45 
 
 		 663 aa  177  2e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000155311 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2959  transcriptional regulator protein-like protein  37.54 
 
 		 364 aa  177  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000346913  hitchhiker  0.00472926 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2466  transcriptional regulator protein-like protein  37.08 
 
 		 331 aa  175  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0245457  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4872  hypothetical protein  40.48 
 
 		 401 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1200  transcriptional regulator-like  40.12 
 
 		 315 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.386828  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2167  hypothetical protein  38.37 
 
 		 325 aa  169  8e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.175858  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1771  transcriptional regulator  37.99 
 
 		 675 aa  168  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.193993  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21980  predicted transcriptional regulator  37.99 
 
 		 327 aa  166  4e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.143715  normal  0.382871 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13990  predicted transcriptional regulator  37.46 
 
 		 348 aa  166  5e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0412748  normal  0.158003 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2686  hypothetical protein  37.74 
 
 		 327 aa  160  3e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2650  transcriptional regulator-like  38.06 
 
 		 323 aa  159  8e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.535773  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2181  transcriptional regulator-like protein  37.03 
 
 		 663 aa  158  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117971  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16040  predicted transcriptional regulator  34.45 
 
 		 664 aa  100  5e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5753  putative DeoR-family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 369 aa  86.3  8e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11950  predicted transcriptional regulator  36.11 
 
 		 699 aa  81.3  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.308253  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5785  transcriptional regulator protein-like protein  27.6 
 
 		 687 aa  80.9  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4015  transcriptional regulator protein-like protein  30.17 
 
 		 512 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4033  transcriptional regulator protein-like protein  30.47 
 
 		 511 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.559835  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0623  DeoR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 335 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4065  transcriptional regulator protein-like protein  28.45 
 
 		 511 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0615  putative DeoR-family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 334 aa  72.8  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0607  putative DeoR-family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 334 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0580  DeoR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 334 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3925  transcriptional regulator-like  28.19 
 
 		 345 aa  69.7  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.836948  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2367  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.09 
 
 		 313 aa  69.7  0.00000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.440872  normal  0.310405 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2492  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.17 
 
 		 302 aa  68.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156303  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0991  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  21.62 
 
 		 302 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5754  hypothetical protein  29.46 
 
 		 351 aa  65.1  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6729  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.7 
 
 		 324 aa  63.9  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.41486 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3646  Helix-turn-helix type 11 domain protein  21.6 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000392325  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3428  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  24.54 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0660  transcriptional regulator, putative  29.14 
 
 		 301 aa  62  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2780  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.68 
 
 		 333 aa  62  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00079876  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2166  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.75 
 
 		 320 aa  62  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.304825  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4645  helix-turn-helix, type 11  31.71 
 
 		 333 aa  60.5  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0418126  normal  0.223314 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1185  hypothetical protein  27.46 
 
 		 313 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4546  DeoR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 314 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.86893  normal  0.117628 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1441  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.05 
 
 		 333 aa  59.3  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2874  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  24.88 
 
 		 322 aa  58.9  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0998  transcriptional regulator  27.46 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1001  hypothetical protein  27.98 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0970  transcriptional regulator-like protein  30.11 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3086  transcriptional regulator, putative  26.19 
 
 		 334 aa  58.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1244  HTH domain family  27.98 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0063  hypothetical protein  22.11 
 
 		 339 aa  58.2  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516278  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0841  hypothetical protein  23.79 
 
 		 351 aa  57.4  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.189594 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2154  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.64 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0788  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  24 
 
 		 319 aa  56.2  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0343  Helix-turn-helix type 11 domain protein  30.57 
 
 		 339 aa  56.2  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2042  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  23.65 
 
 		 307 aa  55.5  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.395632  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0581  transcriptional regulator-like  46.67 
 
 		 367 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0494  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  30.06 
 
 		 336 aa  55.1  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0944  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  24.28 
 
 		 330 aa  55.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.001663  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0608  transcriptional regulator-like protein  46.67 
 
 		 364 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.588838  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0988  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  31.47 
 
 		 317 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0624  transcriptional regulator-like protein  41.03 
 
 		 368 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2004  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  28.81 
 
 		 321 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.532666  normal  0.656208 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0616  transcriptional regulator-like protein  46.67 
 
 		 369 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501695  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0913  hypothetical protein  22.12 
 
 		 317 aa  53.9  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0351983  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1247  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  33.18 
 
 		 317 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161645 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1946  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.13 
 
 		 321 aa  53.9  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0437  hypothetical protein  25.91 
 
 		 326 aa  53.9  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4059  helix-turn-helix, type 11  28.97 
 
 		 318 aa  53.5  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.348793  normal  0.0202879 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1644  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.39 
 
 		 347 aa  53.5  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0304784  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2021  Helix-turn-helix type 11 domain protein  31.48 
 
 		 317 aa  53.5  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0370713  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3513  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.71 
 
 		 322 aa  53.1  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3403  transcriptional regulator-like protein  28.23 
 
 		 323 aa  53.5  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0101274  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15260  Helix-turn-helix type 11 domain protein  20 
 
 		 327 aa  53.5  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190404  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3527  Helix-turn-helix type 11 domain protein  40 
 
 		 323 aa  53.5  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.315913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0382  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.68 
 
 		 333 aa  53.1  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.117118  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7481  transcriptional regulator-like  24.71 
 
 		 326 aa  52.8  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0499  hypothetical protein  28.19 
 
 		 229 aa  52.4  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.477682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0960  helix-turn-helix, type 11  32.2 
 
 		 317 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.386939  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0978  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  32.2 
 
 		 317 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.318116  normal  0.0703128 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5238  transcriptional regulator  21.43 
 
 		 304 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0664508  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5463  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.8 
 
 		 313 aa  52  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.364956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0608  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.81 
 
 		 322 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2755  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.99 
 
 		 336 aa  51.6  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>