181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4456 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4456  transcriptional regulator,-like protein  100 
 
 		 335 aa  671    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.427678  normal  0.167477 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2367  hypothetical protein  62.54 
 
 		 330 aa  370  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2249  hypothetical protein  61.93 
 
 		 330 aa  355  7.999999999999999e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00588148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21980  predicted transcriptional regulator  49.22 
 
 		 327 aa  262  6e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.143715  normal  0.382871 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2686  hypothetical protein  50 
 
 		 327 aa  258  1e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2249  putative transcriptional regulator protein  50.32 
 
 		 327 aa  256  5e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2316  DeoR family transcriptional regulator  44.51 
 
 		 331 aa  249  5e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000471902  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1501  transcriptional regulator  46.77 
 
 		 683 aa  246  4e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.634725  decreased coverage  0.0000677289 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1826  transcriptional regulator protein-like protein  46.13 
 
 		 313 aa  239  6.999999999999999e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3091  hypothetical protein  43.43 
 
 		 359 aa  229  3e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.727496  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5862  transcriptional regulator protein-like protein  43.6 
 
 		 318 aa  229  6e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3444  hypothetical protein  42.33 
 
 		 335 aa  229  7e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1200  transcriptional regulator-like  46.98 
 
 		 315 aa  226  4e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.386828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2610  transcriptional regulator-like  42.32 
 
 		 361 aa  223  4e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000080301  normal  0.16283 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12131  hypothetical protein  40.37 
 
 		 332 aa  217  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000529286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2472  hypothetical protein  42.38 
 
 		 326 aa  216  5e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2517  hypothetical protein  42.38 
 
 		 326 aa  216  5e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2509  hypothetical protein  42.59 
 
 		 326 aa  216  5e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.308334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1771  transcriptional regulator  46.25 
 
 		 675 aa  212  7e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.193993  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2434  hypothetical protein  41.08 
 
 		 361 aa  212  9e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2466  transcriptional regulator protein-like protein  43.43 
 
 		 331 aa  209  4e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0245457  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1879  transcriptional regulator-like  42.59 
 
 		 352 aa  205  8e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2959  transcriptional regulator protein-like protein  39.61 
 
 		 364 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000346913  hitchhiker  0.00472926 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2167  hypothetical protein  41.25 
 
 		 325 aa  188  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.175858  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13990  predicted transcriptional regulator  40.37 
 
 		 348 aa  186  6e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0412748  normal  0.158003 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18560  predicted transcriptional regulator  37.85 
 
 		 361 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.0049611  normal  0.0116825 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4872  hypothetical protein  41.03 
 
 		 401 aa  182  7e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1866  transcriptional regulator protein-like protein  37.04 
 
 		 354 aa  178  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00621522  normal  0.291628 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2650  transcriptional regulator-like  39.21 
 
 		 323 aa  175  8e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.535773  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1783  transcriptional regulator protein-like protein  37.93 
 
 		 337 aa  175  9.999999999999999e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  unclonable  0.000000000261192  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2057  transcriptional regulator-like protein  36.16 
 
 		 320 aa  152  7e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.090135  normal  0.188447 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1924  transcriptional regulator-like protein  36.2 
 
 		 663 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000155311 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2181  transcriptional regulator-like protein  35.98 
 
 		 663 aa  145  8.000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117971  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1287  putative transcriptional regulator protein  33.23 
 
 		 334 aa  144  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.271739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5785  transcriptional regulator protein-like protein  28.02 
 
 		 687 aa  82.4  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11950  predicted transcriptional regulator  35.13 
 
 		 699 aa  80.9  0.00000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.308253  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16040  predicted transcriptional regulator  33.18 
 
 		 664 aa  79.7  0.00000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04135  transcriptional regulator  28.53 
 
 		 321 aa  79.3  0.00000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.292788  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3925  transcriptional regulator-like  27.72 
 
 		 345 aa  75.9  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.836948  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4065  transcriptional regulator protein-like protein  28.44 
 
 		 511 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4033  transcriptional regulator protein-like protein  28.44 
 
 		 511 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.559835  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5753  putative DeoR-family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 369 aa  70.1  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0623  DeoR family transcriptional regulator  27.99 
 
 		 335 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3527  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.88 
 
 		 323 aa  68.6  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.315913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4015  transcriptional regulator protein-like protein  27.3 
 
 		 512 aa  66.2  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0063  hypothetical protein  24.58 
 
 		 339 aa  65.5  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516278  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2241  transcriptional regulator-like protein  26.13 
 
 		 350 aa  64.3  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295044  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2444  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.73 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0615  putative DeoR-family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 334 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4059  helix-turn-helix, type 11  27.04 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.348793  normal  0.0202879 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0607  putative DeoR-family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 334 aa  62.8  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0580  DeoR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 334 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2446  hypothetical protein  29.73 
 
 		 324 aa  60.8  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3867  Helix-turn-helix type 11 domain protein  31.11 
 
 		 335 aa  61.2  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2755  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.78 
 
 		 336 aa  60.8  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0672  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  29.89 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664641  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1001  hypothetical protein  22.97 
 
 		 313 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3062  Helix-turn-helix type 11 domain protein  32.58 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal  0.752018 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1870  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  31.84 
 
 		 337 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.199317 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1223  hypothetical protein  26.88 
 
 		 322 aa  58.5  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5754  hypothetical protein  31.13 
 
 		 351 aa  57.8  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0221  helix-turn-helix, type 11  29.35 
 
 		 228 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0705  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  29.35 
 
 		 228 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.179711  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1255  transcriptional regulator  26.34 
 
 		 322 aa  57  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3107  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.97 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.786544  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3791  transcriptional regulator-like  27.51 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.55139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3412  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.63 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1244  HTH domain family  22.97 
 
 		 313 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0596  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  27.51 
 
 		 228 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3403  transcriptional regulator-like protein  27.76 
 
 		 323 aa  55.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0101274  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0621  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.51 
 
 		 228 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.296179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6729  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.28 
 
 		 324 aa  55.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.41486 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0998  transcriptional regulator  24.41 
 
 		 313 aa  54.7  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3293  Helix-turn-helix type 11 domain protein  34.36 
 
 		 327 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0990426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0713  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  25.37 
 
 		 319 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.677583  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4104  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.03 
 
 		 316 aa  54.7  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1823  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.36 
 
 		 237 aa  54.3  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406304  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0094  Helix-turn-helix type 11 domain protein  32.35 
 
 		 325 aa  54.3  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5212  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.61 
 
 		 317 aa  53.9  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000701081  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1775  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  28.73 
 
 		 330 aa  53.9  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000116568 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5244  DeoR family transcriptional regulator  26.1 
 
 		 337 aa  53.5  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.288323 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1185  hypothetical protein  24.29 
 
 		 313 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1047  DeoR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 322 aa  53.1  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0554838 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2906  Helix-turn-helix type 11 domain protein  32.24 
 
 		 334 aa  53.1  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.754227  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0960  helix-turn-helix, type 11  25.68 
 
 		 317 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.386939  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0978  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  25.68 
 
 		 317 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.318116  normal  0.0703128 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0151  helix-turn-helix, type 11  25.22 
 
 		 231 aa  52  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0680  DeoR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 231 aa  52.4  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0988  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  26.41 
 
 		 317 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0955  transcriptional regulator  26.19 
 
 		 323 aa  51.6  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0131189  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0977  DeoR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 360 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.226699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7049  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  30.24 
 
 		 233 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.135487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1808  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  39.06 
 
 		 327 aa  51.6  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.503322  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1946  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  33.33 
 
 		 321 aa  50.8  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1789  Helix-turn-helix type 11 domain protein  40 
 
 		 333 aa  50.8  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0003326  normal  0.195591 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1294  regulatory protein, DeoR  27.86 
 
 		 336 aa  51.2  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1962  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.92 
 
 		 330 aa  50.8  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000800393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4738  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  28.43 
 
 		 313 aa  50.4  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.947562  normal  0.956989 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3846  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.34 
 
 		 230 aa  50.4  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.80209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0608  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  24.32 
 
 		 322 aa  50.1  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>