89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_5075 on replicon NC_009973
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009973  Haur_5075  regulatory protein, DeoR  100 
 
 		 331 aa  686    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2004  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  42.9 
 
 		 321 aa  259  5.0000000000000005e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.532666  normal  0.656208 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0652  regulatory protein, DeoR  44.89 
 
 		 332 aa  258  1e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.545144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2698  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  41.77 
 
 		 323 aa  247  2e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000125555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0608  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  41.39 
 
 		 322 aa  247  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3075  Helix-turn-helix type 11 domain protein  40.06 
 
 		 326 aa  229  3e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00643592  unclonable  0.0000000271212 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0552  Helix-turn-helix type 11 domain protein  34.88 
 
 		 347 aa  193  3e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1009  regulatory protein, DeoR  35.74 
 
 		 351 aa  172  5.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1187  regulatory protein, DeoR  33.74 
 
 		 342 aa  159  8e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00660104 
 
 
-
 
NC_002936  DET1515  hypothetical protein  29.61 
 
 		 349 aa  156  6e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.284607  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2515  helix-turn-helix, type 11  32.68 
 
 		 348 aa  128  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1489  metal dependent phosphohydrolase  30.96 
 
 		 1078 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0565561 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2780  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.98 
 
 		 333 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00079876  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3021  transcriptional regulator protein  32.18 
 
 		 343 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.140247  normal  0.168441 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1441  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.98 
 
 		 333 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3086  transcriptional regulator, putative  27.55 
 
 		 334 aa  107  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2241  transcriptional regulator-like protein  27.78 
 
 		 350 aa  102  8e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295044  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0473  transcriptional regulator, putative  27.22 
 
 		 334 aa  100  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0382  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25 
 
 		 333 aa  99.8  6e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.117118  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0494  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  27.6 
 
 		 336 aa  99  9e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3385  CRISPR-associated protein Cas5  29.03 
 
 		 1084 aa  99  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.335684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1294  regulatory protein, DeoR  29.22 
 
 		 336 aa  97.4  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0944  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  27.22 
 
 		 330 aa  94.7  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.001663  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15260  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.48 
 
 		 327 aa  93.6  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190404  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1219  transcriptional regulator  27.27 
 
 		 336 aa  93.2  6e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0970  transcriptional regulator-like protein  28.01 
 
 		 330 aa  91.7  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0841  hypothetical protein  27.38 
 
 		 351 aa  92.4  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.189594 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0815  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.08 
 
 		 312 aa  89.7  6e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.502142  hitchhiker  0.0000272273 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0437  hypothetical protein  25.77 
 
 		 326 aa  87.4  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1778  Helix-turn-helix type 11 domain protein  30.13 
 
 		 352 aa  85.9  8e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1438  hypothetical protein  25.85 
 
 		 337 aa  84  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3146  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.9 
 
 		 351 aa  83.2  0.000000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1808  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  27.04 
 
 		 327 aa  82.8  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.503322  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4846  transcriptional regulator protein-like protein  24.68 
 
 		 326 aa  82  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.715011 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2154  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.65 
 
 		 324 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0573  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.35 
 
 		 317 aa  80.9  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000975752  normal  0.773563 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1644  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.09 
 
 		 347 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0304784  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2823  putative transcriptional regulator  28.85 
 
 		 334 aa  76.6  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3359  hypothetical protein  25.58 
 
 		 334 aa  73.2  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.737744  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3896  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.27 
 
 		 321 aa  72.4  0.000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2437  hypothetical protein  25 
 
 		 323 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1421  hypothetical protein  25.73 
 
 		 324 aa  72.4  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.182129 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1228  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  24.5 
 
 		 335 aa  67.8  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.671066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0063  hypothetical protein  29.95 
 
 		 339 aa  66.6  0.0000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516278  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1233  transcriptional regulator-like  24.93 
 
 		 326 aa  66.2  0.0000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0956  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.79 
 
 		 327 aa  65.1  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3403  transcriptional regulator-like protein  24.52 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0101274  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1775  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  28.79 
 
 		 330 aa  62.8  0.000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000116568 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1001  hypothetical protein  24.32 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1244  HTH domain family  24.41 
 
 		 313 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4335  CRISPR-associated helicase Cas3  39.47 
 
 		 904 aa  59.7  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0995159  decreased coverage  0.00193959 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0998  transcriptional regulator  24.01 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1185  hypothetical protein  24.27 
 
 		 313 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4096  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.01 
 
 		 334 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2801  putative transcriptional regulator  29.61 
 
 		 279 aa  54.3  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0164457  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0913  hypothetical protein  23.19 
 
 		 317 aa  53.9  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0351983  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4645  helix-turn-helix, type 11  27.55 
 
 		 333 aa  53.9  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0418126  normal  0.223314 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1201  hypothetical protein  25.53 
 
 		 329 aa  53.1  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.334695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2797  putative transcriptional regulator  26.98 
 
 		 339 aa  52.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1199  putative transcriptional regulator protein  27.74 
 
 		 335 aa  52  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.069662 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2885  transcriptional regulator protein-like protein  27.66 
 
 		 329 aa  52.4  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.379735  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6729  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.61 
 
 		 324 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.41486 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0955  transcriptional regulator  23.34 
 
 		 323 aa  51.2  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0131189  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3679  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.56 
 
 		 321 aa  50.4  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0370855  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4566  transcriptional regulator protein-like protein  28.37 
 
 		 360 aa  50.1  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.439608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3644  hypothetical protein  27.78 
 
 		 326 aa  49.7  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.16096  normal  0.19013 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3046  transcriptional factor  22.87 
 
 		 349 aa  48.9  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0024  transcriptional regulator-like protein  25 
 
 		 330 aa  48.9  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1300  transcriptional regulator  23.61 
 
 		 323 aa  48.5  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.909513  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5442  transcriptional regulator  24.65 
 
 		 326 aa  48.5  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.171727 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2435  hypothetical protein  26.57 
 
 		 323 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0823  hypothetical protein  27.98 
 
 		 251 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0359  Helix-turn-helix type 11 domain protein  19.61 
 
 		 318 aa  47.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6052  transcriptional factor  28.12 
 
 		 338 aa  47  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18560  predicted transcriptional regulator  28.79 
 
 		 361 aa  47.4  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.0049611  normal  0.0116825 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3091  hypothetical protein  30.5 
 
 		 359 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.727496  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3412  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.76 
 
 		 324 aa  47  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04135  transcriptional regulator  22.01 
 
 		 321 aa  46.6  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.292788  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2568  transcriptional regulator-like protein  26.52 
 
 		 352 aa  46.2  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000241414  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0660  transcriptional regulator, putative  22.81 
 
 		 301 aa  45.4  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1013  hypothetical protein  24.12 
 
 		 245 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.18033  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1287  putative transcriptional regulator protein  26.94 
 
 		 334 aa  44.7  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.271739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2755  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.51 
 
 		 336 aa  43.9  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3444  hypothetical protein  28.78 
 
 		 335 aa  43.5  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2444  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.35 
 
 		 319 aa  43.5  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5754  hypothetical protein  30.51 
 
 		 351 aa  43.1  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2317  transcriptional regulator-like protein  24.64 
 
 		 327 aa  43.1  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000143606  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1585  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  25.51 
 
 		 244 aa  43.1  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0474711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1879  transcriptional regulator-like  26.18 
 
 		 352 aa  42.7  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>