15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2801 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2801  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 279 aa  570  1e-161  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0164457  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3385  CRISPR-associated protein Cas5  33.91 
 
 		 1084 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.335684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1489  metal dependent phosphohydrolase  33.48 
 
 		 1078 aa  108  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0565561 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2515  helix-turn-helix, type 11  33.59 
 
 		 348 aa  103  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3021  transcriptional regulator protein  29.96 
 
 		 343 aa  96.7  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.140247  normal  0.168441 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3359  hypothetical protein  27.71 
 
 		 334 aa  79  0.00000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.737744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1228  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.25 
 
 		 335 aa  76.3  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.671066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2698  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  29.57 
 
 		 323 aa  62  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000125555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2004  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.38 
 
 		 321 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.532666  normal  0.656208 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3075  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.02 
 
 		 326 aa  56.6  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00643592  unclonable  0.0000000271212 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0652  regulatory protein, DeoR  27.05 
 
 		 332 aa  55.8  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.545144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5075  regulatory protein, DeoR  24.81 
 
 		 331 aa  55.5  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0552  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.57 
 
 		 347 aa  51.2  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1808  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  29.03 
 
 		 327 aa  49.7  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.503322  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0608  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.74 
 
 		 322 aa  47.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>