More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCZK0823 on replicon NC_006274
Organism: Bacillus cereus E33L



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006274  BCZK0823  hypothetical protein  100 
 
 
251 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0713  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.64 
 
 
319 aa  99  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.677583  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45460  hypothetical protein  27.6 
 
 
323 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1946  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.53 
 
 
321 aa  89.4  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2021  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.9 
 
 
317 aa  89  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0370713  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0147  helix-turn-helix, type 11  27.13 
 
 
316 aa  87.8  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1870  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.36 
 
 
337 aa  87  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.199317 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3859  hypothetical protein  28.77 
 
 
323 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0913  hypothetical protein  31.18 
 
 
317 aa  80.5  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0351983  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2367  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.04 
 
 
313 aa  79.7  0.00000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.440872  normal  0.310405 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1647  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  30.61 
 
 
299 aa  79  0.00000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4546  DeoR family transcriptional regulator  28.3 
 
 
314 aa  79  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.86893  normal  0.117628 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1789  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.77 
 
 
333 aa  78.2  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0003326  normal  0.195591 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0221  helix-turn-helix, type 11  27.96 
 
 
228 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0705  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  27.96 
 
 
228 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.179711  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0672  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.96 
 
 
228 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664641  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4059  helix-turn-helix, type 11  23.68 
 
 
318 aa  77  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.348793  normal  0.0202879 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3412  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.74 
 
 
324 aa  77.8  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380317  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0335  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  28.17 
 
 
321 aa  76.3  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.377994  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3752  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.15 
 
 
235 aa  76.3  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4645  helix-turn-helix, type 11  23.66 
 
 
333 aa  75.9  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0418126  normal  0.223314 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0327  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.11 
 
 
339 aa  75.5  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489263  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3791  transcriptional regulator-like  27.49 
 
 
228 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.55139  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0766  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.44 
 
 
303 aa  75.1  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0596  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  27.01 
 
 
228 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0621  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.01 
 
 
228 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.296179  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5791  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  24.7 
 
 
339 aa  73.2  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0679  helix-turn-helix, type 11  28.72 
 
 
237 aa  73.2  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0456  helix-turn-helix, type 11  26.64 
 
 
230 aa  72.4  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0450  HTH domain-containing protein  26.64 
 
 
230 aa  72.4  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0510  helix-turn-helix, type 11  26.64 
 
 
230 aa  72.4  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0108  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  28.51 
 
 
240 aa  71.6  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.403778 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2492  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.84 
 
 
302 aa  69.7  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156303  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2401  hypothetical protein  26.09 
 
 
320 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148102  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0838  hypothetical protein  26.32 
 
 
229 aa  69.7  0.00000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.183627 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7481  transcriptional regulator-like  23.01 
 
 
326 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1823  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.3 
 
 
237 aa  67.4  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406304  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3062  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.41 
 
 
313 aa  67.4  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal  0.752018 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2437  hypothetical protein  28.02 
 
 
323 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2909  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.47 
 
 
232 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4133  DeoR family transcriptional regulator  25.26 
 
 
317 aa  67  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113991  normal  0.040793 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2503  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25 
 
 
232 aa  67  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.751243 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2689  hypothetical protein  24.9 
 
 
320 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0201589  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2370  hypothetical protein  27.49 
 
 
228 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3390  transcriptional regulator (repressor protein)  27.49 
 
 
228 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2679  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.96 
 
 
228 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1146  hypothetical protein  27.49 
 
 
228 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0387023  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2550  putative transcriptional regulator  27.49 
 
 
228 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1262  hypothetical protein  27.49 
 
 
228 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2673  hypothetical protein  25.65 
 
 
320 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000327581 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2474  hypothetical protein  25.65 
 
 
320 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0188594  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2656  hypothetical protein  25.65 
 
 
320 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3679  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  22.87 
 
 
321 aa  65.5  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0370855  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2683  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.57 
 
 
324 aa  65.5  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.255194  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6203  DeoR family transcriptional regulator  23.11 
 
 
318 aa  65.5  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2698  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  29.67 
 
 
323 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000125555  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3934  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.81 
 
 
321 aa  65.1  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0769202  hitchhiker  0.00173443 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2539  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  25.82 
 
 
228 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4540  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.32 
 
 
228 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1731  DeoR family transcriptional regulator  25.88 
 
 
230 aa  64.7  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.590959  normal  0.873384 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0284  hypothetical protein  27.49 
 
 
361 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2944  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  25 
 
 
324 aa  64.3  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6729  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.29 
 
 
324 aa  63.9  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.41486 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2507  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.15 
 
 
321 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3763  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  24.58 
 
 
323 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3086  transcriptional regulator, putative  26.51 
 
 
334 aa  63.9  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0282  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  28.7 
 
 
231 aa  63.9  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2857  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.89 
 
 
326 aa  64.3  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0404483  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3348  hypothetical protein  27.49 
 
 
339 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.822547  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1778  Helix-turn-helix type 11 domain protein  37.37 
 
 
352 aa  63.9  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17920  predicted transcriptional regulator  24.67 
 
 
238 aa  63.5  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.384504 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3694  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.43 
 
 
321 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0509362  hitchhiker  0.00000175857 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2004  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  28.86 
 
 
321 aa  63.2  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.532666  normal  0.656208 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0875  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.22 
 
 
328 aa  63.2  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6686  hypothetical protein  25.78 
 
 
327 aa  63.2  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0918823  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3383  putative transcriptional regulator  27.01 
 
 
367 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.296007  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0044  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.2 
 
 
318 aa  62.4  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.164988  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2475  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.61 
 
 
252 aa  62  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0100218  normal  0.326712 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000786  predicted transcriptional regulator  27.83 
 
 
228 aa  62  0.000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0574064  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36430  predicted transcriptional regulator  23.47 
 
 
323 aa  62  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.649805 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3646  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.39 
 
 
230 aa  61.6  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4846  transcriptional regulator protein-like protein  26.51 
 
 
326 aa  61.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.715011 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1867  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.81 
 
 
232 aa  61.6  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.117205 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1959  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.91 
 
 
234 aa  61.2  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4104  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  22.69 
 
 
316 aa  61.2  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35620  predicted transcriptional regulator  21.84 
 
 
241 aa  62  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2673  putative repressor transcription regulator protein  23.58 
 
 
232 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.94129  normal  0.397505 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2105  hypothetical protein  26.17 
 
 
228 aa  60.8  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2094  hypothetical protein  26.17 
 
 
228 aa  60.8  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1363  YobV  24.79 
 
 
311 aa  60.8  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.396054  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0369  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  24.03 
 
 
229 aa  61.2  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.189659 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3142  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  25.49 
 
 
232 aa  60.8  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92923  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0064  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.67 
 
 
328 aa  60.8  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.188997  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7049  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  25.41 
 
 
233 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.135487  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4738  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.09 
 
 
313 aa  60.1  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.947562  normal  0.956989 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0960  helix-turn-helix, type 11  23.94 
 
 
317 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.386939  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5398  helix-turn-helix type 11 domain protein  25.36 
 
 
327 aa  60.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.229533  normal  0.331781 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0978  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  23.94 
 
 
317 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.318116  normal  0.0703128 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0988  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  23.94 
 
 
317 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0815  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.53 
 
 
312 aa  60.1  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.502142  hitchhiker  0.0000272273 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>