58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1296 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1296  transcriptional regulator-like protein  100 
 
 		 340 aa  695    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2599  transcriptional regulator-like protein  41.81 
 
 		 340 aa  247  2e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.781453  normal  0.328063 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0239  transcriptional regulator-like protein  31.27 
 
 		 330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2452  hypothetical protein  27.7 
 
 		 318 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.271591  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1441  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.87 
 
 		 333 aa  91.7  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3086  transcriptional regulator, putative  27.18 
 
 		 334 aa  90.5  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2780  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.84 
 
 		 333 aa  90.1  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00079876  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0494  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  28.09 
 
 		 336 aa  82  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3146  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.3 
 
 		 351 aa  77  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0473  transcriptional regulator, putative  24.41 
 
 		 334 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1294  regulatory protein, DeoR  28.66 
 
 		 336 aa  75.9  0.0000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0944  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  24.6 
 
 		 330 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.001663  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0970  transcriptional regulator-like protein  40.45 
 
 		 330 aa  72.8  0.000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1219  transcriptional regulator  26.6 
 
 		 336 aa  70.1  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1233  transcriptional regulator-like  37.65 
 
 		 326 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1421  hypothetical protein  22.15 
 
 		 324 aa  64.7  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.182129 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2154  Helix-turn-helix type 11 domain protein  38.36 
 
 		 324 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1644  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.55 
 
 		 347 aa  63.9  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0304784  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0573  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.38 
 
 		 317 aa  63.2  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000975752  normal  0.773563 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0382  Helix-turn-helix type 11 domain protein  37.84 
 
 		 333 aa  63.2  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.117118  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0956  Helix-turn-helix type 11 domain protein  36.11 
 
 		 327 aa  62  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0049  hypothetical protein  23.51 
 
 		 320 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.607165  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0841  hypothetical protein  27.81 
 
 		 351 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.189594 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0552  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.08 
 
 		 347 aa  60.1  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3403  transcriptional regulator-like protein  24.68 
 
 		 323 aa  58.9  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0101274  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0955  transcriptional regulator  23.78 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0131189  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0437  hypothetical protein  25.64 
 
 		 326 aa  57  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1438  hypothetical protein  25.93 
 
 		 337 aa  56.2  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2823  putative transcriptional regulator  33.7 
 
 		 334 aa  55.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0063  hypothetical protein  23.19 
 
 		 339 aa  55.8  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516278  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3051  transcriptional factor  23.74 
 
 		 336 aa  55.1  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.430784  normal  0.0169917 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1778  Helix-turn-helix type 11 domain protein  34.94 
 
 		 352 aa  54.3  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3896  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.29 
 
 		 321 aa  53.9  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2885  transcriptional regulator protein-like protein  25.78 
 
 		 329 aa  53.5  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.379735  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1779  transcriptional regulator-like protein  24.11 
 
 		 347 aa  52  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.374823  normal  0.268659 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0608  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  23.86 
 
 		 322 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1775  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  21.8 
 
 		 330 aa  51.6  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000116568 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2698  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  36.62 
 
 		 323 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000125555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2004  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  30.68 
 
 		 321 aa  49.3  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.532666  normal  0.656208 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15260  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.21 
 
 		 327 aa  48.5  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190404  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1009  regulatory protein, DeoR  32.88 
 
 		 351 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1199  putative transcriptional regulator protein  21.93 
 
 		 335 aa  48.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.069662 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1808  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  24.44 
 
 		 327 aa  48.5  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.503322  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3075  Helix-turn-helix type 11 domain protein  32.84 
 
 		 326 aa  47.8  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00643592  unclonable  0.0000000271212 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4096  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.11 
 
 		 334 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2446  hypothetical protein  22.39 
 
 		 324 aa  46.2  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0652  regulatory protein, DeoR  29.89 
 
 		 332 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.545144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1122  transcriptional regulator-like protein  25.57 
 
 		 343 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.970908  normal  0.295057 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2755  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.28 
 
 		 336 aa  45.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04135  transcriptional regulator  20.92 
 
 		 321 aa  44.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.292788  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3527  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.78 
 
 		 323 aa  44.3  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.315913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0499  hypothetical protein  25.51 
 
 		 229 aa  43.9  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.477682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1300  transcriptional regulator  25.64 
 
 		 323 aa  43.9  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.909513  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1255  transcriptional regulator  21.91 
 
 		 322 aa  43.9  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1223  hypothetical protein  21.91 
 
 		 322 aa  43.1  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4335  CRISPR-associated helicase Cas3  31.65 
 
 		 904 aa  43.1  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0995159  decreased coverage  0.00193959 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0815  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.38 
 
 		 312 aa  43.1  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.502142  hitchhiker  0.0000272273 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2435  hypothetical protein  23.23 
 
 		 323 aa  42.7  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>