40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0087 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0087  transcriptional regulator  100 
 
 		 348 aa  729    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2910  transcriptional regulator  52.07 
 
 		 359 aa  378  1e-104  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.246584 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0568  putative transcriptional regulator protein  50.29 
 
 		 346 aa  356  2.9999999999999997e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4751  transcriptional regulator-like protein  50 
 
 		 345 aa  349  3e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0885788  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1490  hypothetical protein  50 
 
 		 348 aa  343  2e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0815411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1199  putative transcriptional regulator protein  31.49 
 
 		 335 aa  166  4e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.069662 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4566  transcriptional regulator protein-like protein  24.87 
 
 		 360 aa  88.2  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.439608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2437  hypothetical protein  23.89 
 
 		 323 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4096  Helix-turn-helix type 11 domain protein  21.8 
 
 		 334 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1644  Helix-turn-helix type 11 domain protein  21.59 
 
 		 347 aa  69.7  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0304784  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0570  hypothetical protein  23.78 
 
 		 298 aa  67.8  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0063  hypothetical protein  22.85 
 
 		 339 aa  67  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516278  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1294  regulatory protein, DeoR  20.29 
 
 		 336 aa  60.5  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0437  hypothetical protein  21.87 
 
 		 326 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0573  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.44 
 
 		 317 aa  55.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000975752  normal  0.773563 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2004  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  22.49 
 
 		 321 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.532666  normal  0.656208 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2768  hypothetical protein  48.98 
 
 		 57 aa  54.7  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.945651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0956  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.99 
 
 		 327 aa  54.3  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2444  Helix-turn-helix type 11 domain protein  21.59 
 
 		 319 aa  53.9  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0841  hypothetical protein  21.22 
 
 		 351 aa  53.9  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.189594 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3086  transcriptional regulator, putative  20.75 
 
 		 334 aa  53.1  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1441  Helix-turn-helix type 11 domain protein  20.59 
 
 		 333 aa  51.6  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2698  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  22.06 
 
 		 323 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000125555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2780  Helix-turn-helix type 11 domain protein  20.59 
 
 		 333 aa  50.8  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00079876  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0944  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  22.4 
 
 		 330 aa  50.8  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.001663  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3900  hypothetical protein  22.13 
 
 		 326 aa  49.3  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0382  Helix-turn-helix type 11 domain protein  21.23 
 
 		 333 aa  48.1  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.117118  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1778  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.68 
 
 		 352 aa  47.8  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1438  hypothetical protein  20.45 
 
 		 337 aa  47.4  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2154  Helix-turn-helix type 11 domain protein  21.8 
 
 		 324 aa  47  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2446  hypothetical protein  22.51 
 
 		 324 aa  47  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1808  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  20.96 
 
 		 327 aa  46.6  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.503322  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0970  transcriptional regulator-like protein  20.06 
 
 		 330 aa  46.6  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1219  transcriptional regulator  20.62 
 
 		 336 aa  46.6  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3527  Helix-turn-helix type 11 domain protein  21.97 
 
 		 323 aa  44.3  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.315913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3644  hypothetical protein  26.45 
 
 		 326 aa  44.3  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.16096  normal  0.19013 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0872  conserved hypothetical protein, putative transcriptional regulator  22.33 
 
 		 306 aa  44.7  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000595288  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1775  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  24.06 
 
 		 330 aa  43.9  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000116568 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3075  Helix-turn-helix type 11 domain protein  20.46 
 
 		 326 aa  43.1  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00643592  unclonable  0.0000000271212 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3896  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.59 
 
 		 321 aa  42.7  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>