More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3015 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3015  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 327 aa  640    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4176  cation diffusion facilitator family transporter  58.75 
 
 		 318 aa  331  1e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  0.120202 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1141  cation diffusion facilitator family transporter  43.54 
 
 		 344 aa  219  6e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.807307  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0908  cation diffusion facilitator family transporter  46.3 
 
 		 353 aa  206  6e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00327359  normal  0.0207813 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0065  cation diffusion facilitator family transporter  41.25 
 
 		 329 aa  204  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3687  cation diffusion facilitator family transporter  44.36 
 
 		 321 aa  200  3e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.271523 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15840  cation diffusion facilitator family transporter  41.61 
 
 		 330 aa  198  7.999999999999999e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0295816  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4489  cation diffusion facilitator family transporter  38.75 
 
 		 298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0696938  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1782  cation efflux protein  38.08 
 
 		 321 aa  197  3e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0733  cation diffusion facilitator family transporter  36.24 
 
 		 365 aa  196  5.000000000000001e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.299752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4836  cation diffusion facilitator family transporter  37.85 
 
 		 344 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18150  cation diffusion facilitator family transporter  41.22 
 
 		 333 aa  187  2e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.040003  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04980  cation diffusion facilitator family transporter  34.97 
 
 		 351 aa  186  4e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3754  cation diffusion facilitator family transporter  39.34 
 
 		 319 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462365  normal  0.0201065 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01760  cation transport protein  37.95 
 
 		 310 aa  182  9.000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.664458  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0314  cation diffusion facilitator family transporter  40.36 
 
 		 315 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00366516  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4688  cation diffusion facilitator family transporter  37.25 
 
 		 340 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.105315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4319  cation diffusion facilitator family transporter  36.93 
 
 		 340 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.337852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1776  cation diffusion facilitator family transporter  39.73 
 
 		 331 aa  177  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1593  cation diffusion facilitator family transporter  41.76 
 
 		 302 aa  176  4e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.315476  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0438  cation diffusion facilitator family transporter  33.89 
 
 		 305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1390  cation diffusion facilitator family transporter  35.76 
 
 		 309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4110  cation diffusion facilitator family transporter  35.29 
 
 		 317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1360  cation diffusion facilitator family transporter  38.19 
 
 		 308 aa  171  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.733609  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0719  cation diffusion facilitator family transporter  36.63 
 
 		 317 aa  170  3e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.176085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2798  cation diffusion facilitator family transporter  32.77 
 
 		 300 aa  169  7e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4497  cation diffusion facilitator family transporter  36.91 
 
 		 353 aa  168  9e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3824  cation diffusion facilitator family transporter  38.38 
 
 		 283 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2733  cation diffusion facilitator family transporter  37.04 
 
 		 303 aa  165  9e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.924366 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4628  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 		 308 aa  163  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0300132  normal  0.143648 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2205  cation diffusion facilitator family transporter  35.93 
 
 		 317 aa  162  6e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.244213 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0824  cation diffusion facilitator family transporter  32.82 
 
 		 323 aa  159  4e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0759  cation diffusion facilitator family transporter  36.1 
 
 		 319 aa  159  6e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  0.101295 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1771  cation transporter, permease component  34.78 
 
 		 312 aa  159  7e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.52517  normal  0.0251557 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5899  cation diffusion facilitator family transporter  35.02 
 
 		 312 aa  159  9e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.847836 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2294  cation diffusion facilitator family transporter  37.87 
 
 		 316 aa  157  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.547422  normal  0.0692994 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1337  cation diffusion facilitator family transporter  33.56 
 
 		 297 aa  157  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0964  cation diffusion facilitator family transporter  35.62 
 
 		 323 aa  157  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_13994  predicted protein  36.8 
 
 		 336 aa  155  8e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455794  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4060  cation diffusion facilitator family transporter  35.23 
 
 		 315 aa  154  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.978964  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2745  cation diffusion facilitator family transporter  30.94 
 
 		 363 aa  154  2e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4528  cation diffusion facilitator family transporter  32 
 
 		 301 aa  151  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4859  cation diffusion facilitator family transporter  36.45 
 
 		 310 aa  149  6e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.311707  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4986  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 		 318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.992274 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6323  cation diffusion facilitator family transporter  32.77 
 
 		 305 aa  146  6e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.275453  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1655  cation diffusion facilitator family transporter  38.72 
 
 		 318 aa  146  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3642  cation diffusion facilitator family transporter  34.74 
 
 		 306 aa  145  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0337  cation diffusion facilitator family transporter  31.53 
 
 		 317 aa  144  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0901  cation diffusion facilitator family transporter  34.64 
 
 		 323 aa  143  4e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.549098  normal  0.0315614 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1993  cation diffusion facilitator family transporter  30.46 
 
 		 326 aa  142  6e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26540  cation diffusion facilitator family transporter  31.16 
 
 		 426 aa  141  9.999999999999999e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0548124  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2403  cation diffusion facilitator family transporter  35.43 
 
 		 308 aa  140  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0831069 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1222  cation diffusion facilitator family transporter  32.89 
 
 		 335 aa  136  4e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0856853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0843  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  32.33 
 
 		 327 aa  136  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1671  cation diffusion facilitator family transporter  35.69 
 
 		 341 aa  135  8e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.357995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4358  cation diffusion facilitator family transporter  31.23 
 
 		 312 aa  135  9e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0273314 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1482  cation diffusion facilitator family transporter  32.44 
 
 		 305 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348371  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1307  cation diffusion facilitator family transporter  30.58 
 
 		 321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39741  CDF family transporter: cation efflux  33.55 
 
 		 345 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4570  cation diffusion facilitator family transporter  39.22 
 
 		 308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6007  cation diffusion facilitator family transporter  34.42 
 
 		 318 aa  125  7e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000180235  normal  0.0482641 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09160  cation diffusion facilitator family transporter  35.81 
 
 		 311 aa  122  8e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.236518 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1535  cation transporter  29.64 
 
 		 314 aa  100  4e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000520481  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3583  cation diffusion facilitator family transporter  25.17 
 
 		 392 aa  95.1  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000126728  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0586  cation efflux family protein  23.45 
 
 		 393 aa  89  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0440871  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0576  cation efflux family protein  24.05 
 
 		 393 aa  88.6  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2256  cation diffusion facilitator family transporter  27.62 
 
 		 332 aa  85.1  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00134926  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  25.84 
 
 		 285 aa  82.4  0.000000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  24.83 
 
 		 323 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0076  cation diffusion facilitator family transporter  28.11 
 
 		 315 aa  77  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.097535  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4020  ferrous iron efflux protein F  26.45 
 
 		 300 aa  76.3  0.0000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1410  cation diffusion facilitator family transporter  21.36 
 
 		 333 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  25.86 
 
 		 301 aa  74.7  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1521  cation diffusion facilitator family transporter  26.26 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1952  cation diffusion facilitator family transporter  23.95 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110398  normal  0.0228516 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  29.58 
 
 		 314 aa  71.2  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  30.77 
 
 		 307 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3300  iron and zinc efflux system protein  24.91 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.831799  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3813  ferrous iron efflux protein F  26.3 
 
 		 298 aa  69.7  0.00000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.70191  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3647  cation diffusion facilitator family transporter  25.68 
 
 		 395 aa  69.3  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0724  cation diffusion facilitator family transporter  34.19 
 
 		 315 aa  69.3  0.00000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152803  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00146  ferrous iron efflux protein F  25.55 
 
 		 302 aa  68.6  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2100  cation diffusion facilitator family transporter  25.97 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.70845  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  27.44 
 
 		 311 aa  68.9  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1617  cation diffusion facilitator family transporter  26.62 
 
 		 313 aa  68.6  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1582  cation diffusion facilitator family transporter  24.41 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2613  cation efflux family protein  28.67 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1954  cation diffusion facilitator family transporter  25.24 
 
 		 328 aa  68.2  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002221  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  25.37 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000518265  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  21.9 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1450  cation diffusion facilitator family transporter  28.16 
 
 		 460 aa  67.8  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.25137  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2262  ferrous iron efflux protein F  26.18 
 
 		 302 aa  67  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000896639  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3764  cation efflux protein  23.97 
 
 		 389 aa  67  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0837533 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0198  cation diffusion facilitator family transporter  27.73 
 
 		 474 aa  67  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.859565 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19310  cation diffusion facilitator family transporter  28.98 
 
 		 298 aa  67  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000504538 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1171  cation efflux family protein  24.75 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  21.11 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1113  hypothetical protein  25.66 
 
 		 307 aa  65.9  0.0000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.416676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  26.92 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0314  cation diffusion facilitator family transporter  25.51 
 
 		 289 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000499164  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>