More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01760 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01760  cation transport protein  100 
 
 		 310 aa  625  1e-178  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.664458  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4110  cation diffusion facilitator family transporter  54.97 
 
 		 317 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3824  cation diffusion facilitator family transporter  54.89 
 
 		 283 aa  297  2e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1776  cation diffusion facilitator family transporter  50.33 
 
 		 331 aa  286  2e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2798  cation diffusion facilitator family transporter  48.79 
 
 		 300 aa  281  1e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1782  cation efflux protein  47.78 
 
 		 321 aa  268  5.9999999999999995e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1360  cation diffusion facilitator family transporter  48.11 
 
 		 308 aa  264  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.733609  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2733  cation diffusion facilitator family transporter  48.29 
 
 		 303 aa  259  3e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.924366 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1337  cation diffusion facilitator family transporter  40.69 
 
 		 297 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04980  cation diffusion facilitator family transporter  45 
 
 		 351 aa  251  1e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3754  cation diffusion facilitator family transporter  45.45 
 
 		 319 aa  247  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462365  normal  0.0201065 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0314  cation diffusion facilitator family transporter  46.26 
 
 		 315 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00366516  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1771  cation transporter, permease component  43.06 
 
 		 312 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.52517  normal  0.0251557 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0719  cation diffusion facilitator family transporter  44.88 
 
 		 317 aa  236  4e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.176085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0438  cation diffusion facilitator family transporter  40.34 
 
 		 305 aa  235  7e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4836  cation diffusion facilitator family transporter  43.58 
 
 		 344 aa  226  4e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2294  cation diffusion facilitator family transporter  44.95 
 
 		 316 aa  223  3e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.547422  normal  0.0692994 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4319  cation diffusion facilitator family transporter  42.16 
 
 		 340 aa  219  5e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.337852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4688  cation diffusion facilitator family transporter  42.16 
 
 		 340 aa  218  7e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.105315  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1655  cation diffusion facilitator family transporter  47.45 
 
 		 318 aa  214  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26540  cation diffusion facilitator family transporter  39.93 
 
 		 426 aa  213  1.9999999999999998e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0548124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4628  cation diffusion facilitator family transporter  36.73 
 
 		 308 aa  186  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0300132  normal  0.143648 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2205  cation diffusion facilitator family transporter  38.36 
 
 		 317 aa  183  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.244213 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1390  cation diffusion facilitator family transporter  36.59 
 
 		 309 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3015  cation diffusion facilitator family transporter  37.95 
 
 		 327 aa  177  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4176  cation diffusion facilitator family transporter  36.61 
 
 		 318 aa  172  7.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  0.120202 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0759  cation diffusion facilitator family transporter  35.47 
 
 		 319 aa  172  9e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  0.101295 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1671  cation diffusion facilitator family transporter  35.6 
 
 		 341 aa  171  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.357995  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3687  cation diffusion facilitator family transporter  39.08 
 
 		 321 aa  169  5e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.271523 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4528  cation diffusion facilitator family transporter  35.71 
 
 		 301 aa  169  7e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5899  cation diffusion facilitator family transporter  36.08 
 
 		 312 aa  169  7e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.847836 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4060  cation diffusion facilitator family transporter  36.79 
 
 		 315 aa  168  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.978964  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4986  cation diffusion facilitator family transporter  36.27 
 
 		 318 aa  158  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.992274 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0964  cation diffusion facilitator family transporter  34.02 
 
 		 323 aa  157  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4570  cation diffusion facilitator family transporter  37.84 
 
 		 308 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0901  cation diffusion facilitator family transporter  34.41 
 
 		 323 aa  155  7e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.549098  normal  0.0315614 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4358  cation diffusion facilitator family transporter  35.57 
 
 		 312 aa  155  8e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0273314 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2403  cation diffusion facilitator family transporter  37.63 
 
 		 308 aa  153  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0831069 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0908  cation diffusion facilitator family transporter  40.75 
 
 		 353 aa  153  4e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00327359  normal  0.0207813 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6323  cation diffusion facilitator family transporter  35.35 
 
 		 305 aa  152  5.9999999999999996e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.275453  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1993  cation diffusion facilitator family transporter  33.57 
 
 		 326 aa  151  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09160  cation diffusion facilitator family transporter  34.88 
 
 		 311 aa  150  4e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.236518 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0065  cation diffusion facilitator family transporter  31.44 
 
 		 329 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4497  cation diffusion facilitator family transporter  29.31 
 
 		 353 aa  148  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18150  cation diffusion facilitator family transporter  36.03 
 
 		 333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.040003  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4489  cation diffusion facilitator family transporter  35.91 
 
 		 298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0696938  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0843  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  34.59 
 
 		 327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4859  cation diffusion facilitator family transporter  34.14 
 
 		 310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.311707  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1141  cation diffusion facilitator family transporter  36.95 
 
 		 344 aa  147  3e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.807307  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15840  cation diffusion facilitator family transporter  33.88 
 
 		 330 aa  146  3e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0295816  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_13994  predicted protein  33.07 
 
 		 336 aa  145  6e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455794  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0824  cation diffusion facilitator family transporter  31.23 
 
 		 323 aa  144  1e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1482  cation diffusion facilitator family transporter  32.44 
 
 		 305 aa  144  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348371  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1222  cation diffusion facilitator family transporter  33.9 
 
 		 335 aa  142  6e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0856853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2745  cation diffusion facilitator family transporter  32.14 
 
 		 363 aa  140  3e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3642  cation diffusion facilitator family transporter  36.24 
 
 		 306 aa  137  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1593  cation diffusion facilitator family transporter  36.29 
 
 		 302 aa  133  5e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.315476  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6007  cation diffusion facilitator family transporter  34.23 
 
 		 318 aa  132  9e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000180235  normal  0.0482641 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0733  cation diffusion facilitator family transporter  31.5 
 
 		 365 aa  125  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.299752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1307  cation diffusion facilitator family transporter  29.22 
 
 		 321 aa  123  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0337  cation diffusion facilitator family transporter  29.22 
 
 		 317 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39741  CDF family transporter: cation efflux  35.15 
 
 		 345 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1535  cation transporter  32.74 
 
 		 314 aa  108  8.000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000520481  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08140  cation diffusion facilitator family transporter  24.67 
 
 		 369 aa  78.6  0.0000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.150714  normal  0.172071 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1513  cation diffusion facilitator family transporter  29.54 
 
 		 302 aa  75.5  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.5227 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0076  cation diffusion facilitator family transporter  28.2 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.097535  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04870  cation diffusion facilitator family transporter  22.38 
 
 		 374 aa  73.2  0.000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0586  cation efflux family protein  21.4 
 
 		 393 aa  72.4  0.000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0440871  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0576  cation efflux family protein  21.4 
 
 		 393 aa  72.4  0.000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0853  cation diffusion facilitator family transporter  29.24 
 
 		 479 aa  71.6  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3583  cation diffusion facilitator family transporter  19.87 
 
 		 392 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000126728  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4494  cation efflux family protein  29.94 
 
 		 298 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4529  cation efflux family protein  29.34 
 
 		 297 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0706  cation efflux family protein  29.94 
 
 		 297 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4544  cation efflux family protein  29.94 
 
 		 297 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4305  cation efflux family protein  29.34 
 
 		 298 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.901101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4143  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  29.34 
 
 		 297 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4154  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  29.34 
 
 		 298 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4640  cation efflux family protein  29.34 
 
 		 298 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4490  cation efflux family protein  29.34 
 
 		 297 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013867 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4257  cation diffusion facilitator family transporter  28.74 
 
 		 297 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3126  cation diffusion facilitator family transporter  27.71 
 
 		 297 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4790  cation efflux family protein  25.17 
 
 		 297 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4333  cation efflux protein  24.83 
 
 		 297 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0970  cation diffusion facilitator family transporter  20.58 
 
 		 390 aa  65.1  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000558459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2381  cation diffusion facilitator family transporter  19.86 
 
 		 388 aa  64.3  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000223883  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1410  cation diffusion facilitator family transporter  20.3 
 
 		 333 aa  64.7  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1051  putative cation efflux system protein  21.58 
 
 		 319 aa  61.6  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0198  cation diffusion facilitator family transporter  23.4 
 
 		 474 aa  61.6  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.859565 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0339  cation diffusion facilitator family transporter  24.66 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000143188  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0737  cation efflux system protein  21.07 
 
 		 317 aa  61.2  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.338743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2256  cation diffusion facilitator family transporter  24.47 
 
 		 332 aa  60.1  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00134926  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09106  cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcD  25.89 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.341807  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  33.75 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1712  cation diffusion facilitator family transporter  23.11 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00125134  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0698  cation diffusion facilitator family transporter  23.78 
 
 		 406 aa  58.9  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3435  cation diffusion facilitator family transporter  27.38 
 
 		 478 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0253813 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12610  putative transporter  23.49 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.686969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  22.56 
 
 		 291 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1334  cation diffusion facilitator family transporter  25.77 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.215207  hitchhiker  0.000886879 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>