More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1655 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1655  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 318 aa  627  1e-179  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1782  cation efflux protein  50.34 
 
 		 321 aa  304  1.0000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2798  cation diffusion facilitator family transporter  47.62 
 
 		 300 aa  290  3e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1337  cation diffusion facilitator family transporter  46.94 
 
 		 297 aa  288  6e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04980  cation diffusion facilitator family transporter  47.81 
 
 		 351 aa  282  5.000000000000001e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1771  cation transporter, permease component  48.46 
 
 		 312 aa  281  1e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.52517  normal  0.0251557 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0438  cation diffusion facilitator family transporter  44.93 
 
 		 305 aa  278  1e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1776  cation diffusion facilitator family transporter  49.2 
 
 		 331 aa  277  2e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0719  cation diffusion facilitator family transporter  48.5 
 
 		 317 aa  261  1e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.176085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01760  cation transport protein  47.57 
 
 		 310 aa  258  6e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.664458  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4110  cation diffusion facilitator family transporter  43.73 
 
 		 317 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3824  cation diffusion facilitator family transporter  47.71 
 
 		 283 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3754  cation diffusion facilitator family transporter  46.6 
 
 		 319 aa  249  5e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462365  normal  0.0201065 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2733  cation diffusion facilitator family transporter  45.76 
 
 		 303 aa  249  6e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.924366 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1360  cation diffusion facilitator family transporter  46.18 
 
 		 308 aa  239  4e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.733609  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4836  cation diffusion facilitator family transporter  45.57 
 
 		 344 aa  238  1e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4319  cation diffusion facilitator family transporter  43.93 
 
 		 340 aa  229  4e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.337852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4688  cation diffusion facilitator family transporter  44.06 
 
 		 340 aa  229  6e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.105315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0314  cation diffusion facilitator family transporter  44.72 
 
 		 315 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00366516  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26540  cation diffusion facilitator family transporter  40.61 
 
 		 426 aa  211  9e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0548124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2294  cation diffusion facilitator family transporter  43.04 
 
 		 316 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.547422  normal  0.0692994 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4628  cation diffusion facilitator family transporter  35.28 
 
 		 308 aa  186  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0300132  normal  0.143648 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6323  cation diffusion facilitator family transporter  40.34 
 
 		 305 aa  182  5.0000000000000004e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.275453  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0759  cation diffusion facilitator family transporter  38.79 
 
 		 319 aa  181  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  0.101295 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2205  cation diffusion facilitator family transporter  36.68 
 
 		 317 aa  181  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.244213 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5899  cation diffusion facilitator family transporter  36.7 
 
 		 312 aa  179  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.847836 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0824  cation diffusion facilitator family transporter  35 
 
 		 323 aa  175  9.999999999999999e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1993  cation diffusion facilitator family transporter  31.25 
 
 		 326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4060  cation diffusion facilitator family transporter  39.06 
 
 		 315 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.978964  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1390  cation diffusion facilitator family transporter  37.45 
 
 		 309 aa  169  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3015  cation diffusion facilitator family transporter  39.34 
 
 		 327 aa  169  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2745  cation diffusion facilitator family transporter  35.42 
 
 		 363 aa  168  1e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4358  cation diffusion facilitator family transporter  37.58 
 
 		 312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0273314 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4528  cation diffusion facilitator family transporter  34.9 
 
 		 301 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4176  cation diffusion facilitator family transporter  33.67 
 
 		 318 aa  163  5.0000000000000005e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  0.120202 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3687  cation diffusion facilitator family transporter  39.62 
 
 		 321 aa  160  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.271523 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4489  cation diffusion facilitator family transporter  37.21 
 
 		 298 aa  160  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0696938  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0065  cation diffusion facilitator family transporter  36.49 
 
 		 329 aa  159  5e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1671  cation diffusion facilitator family transporter  36.68 
 
 		 341 aa  159  8e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.357995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18150  cation diffusion facilitator family transporter  40.68 
 
 		 333 aa  158  9e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.040003  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1141  cation diffusion facilitator family transporter  34.81 
 
 		 344 aa  158  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.807307  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0964  cation diffusion facilitator family transporter  35.4 
 
 		 323 aa  158  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4986  cation diffusion facilitator family transporter  36.15 
 
 		 318 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.992274 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2403  cation diffusion facilitator family transporter  37.16 
 
 		 308 aa  155  7e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0831069 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4497  cation diffusion facilitator family transporter  37.27 
 
 		 353 aa  155  8e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0337  cation diffusion facilitator family transporter  33.87 
 
 		 317 aa  154  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3642  cation diffusion facilitator family transporter  36.12 
 
 		 306 aa  151  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09160  cation diffusion facilitator family transporter  37.38 
 
 		 311 aa  150  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.236518 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1222  cation diffusion facilitator family transporter  34.71 
 
 		 335 aa  150  4e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0856853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0901  cation diffusion facilitator family transporter  34.66 
 
 		 323 aa  149  6e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.549098  normal  0.0315614 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0843  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  34.9 
 
 		 327 aa  149  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4859  cation diffusion facilitator family transporter  33.56 
 
 		 310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.311707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1482  cation diffusion facilitator family transporter  32.42 
 
 		 305 aa  146  5e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348371  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6007  cation diffusion facilitator family transporter  35.91 
 
 		 318 aa  145  8.000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000180235  normal  0.0482641 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4570  cation diffusion facilitator family transporter  41.77 
 
 		 308 aa  142  5e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15840  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 		 330 aa  142  7e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0295816  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1593  cation diffusion facilitator family transporter  37.6 
 
 		 302 aa  141  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.315476  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0733  cation diffusion facilitator family transporter  33.22 
 
 		 365 aa  139  4.999999999999999e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.299752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0908  cation diffusion facilitator family transporter  37.74 
 
 		 353 aa  139  7e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00327359  normal  0.0207813 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1307  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 		 321 aa  136  5e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_13994  predicted protein  32.08 
 
 		 336 aa  135  8e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455794  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1535  cation transporter  31.13 
 
 		 314 aa  123  5e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000520481  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39741  CDF family transporter: cation efflux  35.86 
 
 		 345 aa  122  6e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3583  cation diffusion facilitator family transporter  25.62 
 
 		 392 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000126728  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2256  cation diffusion facilitator family transporter  27.46 
 
 		 332 aa  82.8  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00134926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  23.02 
 
 		 291 aa  77.4  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  26.78 
 
 		 301 aa  76.6  0.0000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0076  cation diffusion facilitator family transporter  31.45 
 
 		 315 aa  75.5  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.097535  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  27.76 
 
 		 311 aa  74.7  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2100  cation diffusion facilitator family transporter  26.32 
 
 		 310 aa  74.7  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.70845  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0586  cation efflux family protein  22.3 
 
 		 393 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0440871  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  22.53 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0332  cation diffusion facilitator family transporter  25.66 
 
 		 450 aa  73.9  0.000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0339  cation diffusion facilitator family transporter  23.39 
 
 		 293 aa  73.6  0.000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000143188  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0970  cation diffusion facilitator family transporter  26.13 
 
 		 390 aa  73.2  0.000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000558459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0576  cation efflux family protein  22.3 
 
 		 393 aa  73.2  0.000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  26.53 
 
 		 311 aa  72.8  0.000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3095  putative cation-efflux pump  31.09 
 
 		 462 aa  72.8  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  22.31 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0698  cation diffusion facilitator family transporter  22.05 
 
 		 406 aa  69.3  0.00000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1410  cation diffusion facilitator family transporter  24.19 
 
 		 333 aa  69.3  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0960  cation diffusion facilitator family transporter  22.22 
 
 		 291 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1712  cation diffusion facilitator family transporter  24.5 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00125134  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  28.69 
 
 		 312 aa  68.2  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  25.66 
 
 		 300 aa  67.4  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  25.66 
 
 		 300 aa  67.4  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1334  cation diffusion facilitator family transporter  25.26 
 
 		 312 aa  67.4  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.215207  hitchhiker  0.000886879 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1051  putative cation efflux system protein  22.93 
 
 		 319 aa  67  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09106  cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcD  25.88 
 
 		 313 aa  66.2  0.0000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.341807  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  26.53 
 
 		 311 aa  65.9  0.0000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3476  putative cation efflux family protein, CzcD-like protein  28.7 
 
 		 296 aa  65.9  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal  0.771262 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1774  cation diffusion facilitator family transporter  25.77 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000103729  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0737  cation efflux system protein  24.89 
 
 		 317 aa  65.5  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.338743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1513  cation diffusion facilitator family transporter  28.57 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.5227 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0974  cation diffusion facilitator family transporter  31.09 
 
 		 466 aa  64.3  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0130  cation diffusion facilitator family transporter  24.78 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120546  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2574  cation diffusion facilitator family transporter  33.07 
 
 		 310 aa  64.3  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4529  cation efflux family protein  24.33 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0074  cation diffusion facilitator family transporter  24.65 
 
 		 313 aa  63.9  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4947  cation diffusion facilitator family transporter  28.42 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723787  normal  0.395043 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>